Научная статья на тему 'Банк данных «Климат и инфекционные заболевания» (CliWaDIn) для исследования взаимосвязей между погодой, качеством воды и инфекционными заболеваниями'

Банк данных «Климат и инфекционные заболевания» (CliWaDIn) для исследования взаимосвязей между погодой, качеством воды и инфекционными заболеваниями Текст научной статьи по специальности «Науки о здоровье»

CC BY
107
34
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Инфекция и иммунитет
Scopus
ВАК
RSCI
ESCI
Область наук
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Банк данных «Климат и инфекционные заболевания» (CliWaDIn) для исследования взаимосвязей между погодой, качеством воды и инфекционными заболеваниями»

Материалы X съезда ВНПОЭМП, Москва, 12-13 апреля 2012 г.

Инфекция и иммунитет

карственной устойчивости к пиразинамиду было сложной проблемой. Пиразинамид активен только в кислой среде, на которой не растут многие штаммы МБТ, поскольку противотуберкулезной активностью обладает не сам препарат, а пиразиноико-вая кислота, образующаяся в микробной клетке под влиянием фермента пиразинамидазы. Этот фермент кодирует ген pncA, в составе которого более ста мутаций, ассоциированных с резистентностью к пиразинамиду. Предложенные альтернативные, в том числе и экспрессные молекулярно-гененетические методы определения ЛУ к пиразинамиду, либо чрезвычайно трудоемкие, либо недостаточно достоверные.

В доступной литературе нет работ о частоте резистентности пиразинамида при различных формах лекарственной устойчивости МБТ — поли- и муль-тирезистентности, XDR (широкая лекарственная устойчивость).

За период 2008—2010 гг. на автоматизированной диагностической системе BACTEC MGIT 960 изучена устойчивость к пиразинамиду 374 клинических штаммов микобактерий в основном от ранее леченных 242 больных различными формами туберкулеза легких и 85 больных туберкулезом внелегочной локализации внелегочной локализации, в том числе от 35 детей с костно-суставными поражениями из клиники детской фтизиологии и ортопедии СПбНИИФ. Исследованы изоляты из 249 проб респираторного материала, а также 35 образцов биоп-сийного и операционного легочного и 90 внелегоч-ного материала.

Частота лекарственной устойчивости к основным и резервным противотуберкулезным препаратам составила: к изониазиду — 78,9, стрептомицину — 77,5, рифампицину — 70,2, пиразинамиду — 58,9, этамбутолу — 55,8, этионамиду — 67,2, амикацину — 44,7, капреомицину — 38,5, офлоксацину — 38,0%. Обнаружено, что резистентность к пиразинамиду по отношению к чувствительности многократно увеличивается по мере возрастания тяжести структуры лекарственной резистентности — в 3,5—6— 11 раз соответственно при МЛУ, устойчивости к SIRE и XDR, из чего следует, что резистентность МБТ к пиразинамиду может служить относительным индикатором широкой лекарственной устойчивости.

Заслуживает внимания, что у 28 детей с костно-суставными поражениями выявлена монорезистентность изолятов к пиразинамиду, которые культурально-биохимическими и молекулярно-ге-нетическими методами были идентифицированы как M.bovis-BCG. У всех этих детей был диагностирован БЦЖ-остит. Проблема дифференциальной диагностики туберкулеза остается актуальной и сложной клинической задачей, тем более, что установка точного диагноза требует различного подхода к лечениию, профилактике в очаге инфекции, организации эпидрежима и связана с материально-правовыми особенностями. Известно, что большинство штаммов M. bovis имеют видовую устойчивость к пиразинамиду. Однако обнаруженная монорезистентность штаммов микобактерий к пи-разинамиду у таких детей с соответствующими клинико-анамнестическими данными может рассматриваться как маркер БЦЖ-остита или других поствакцинальных осложнений.

БАНК ДАННЫХ «КЛИМАТ И ИНФЕКЦИОННЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ» (CLIWADIN) ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ ВЗАИМОСВЯЗЕЙ МЕЖДУ ПОГОДОЙ, КАЧЕСТВОМ ВОДЫ И ИНФЕКЦИОННЫМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ

B.В. Губарев1, В.Б. Локтев2, В.И. Аксенова15, О.К. Альсова1, Т.В. Белова14, Н.Б. Белозерцева13, Л.А. Брусницына13, Г.К. Ванеева12, А.А. Гражданцева2, А.И. Егоров3*, Л.В. Иванова15, Л.И. Козловский5, Г.В. Кочнева2, С.Н. Макшанцева9, О.В. Миронова11, Е.Н. Наумова4, В.Н. Новошинцев6, Л.В. Озерская10, Е.В. Протопопова2, Н.Н. Радькова7, И.А. Разумов2, М. Райт3, Г.Ф. Сиволобова2, В.Н. Тарасов14,

Н.А. Чистяков1, А.Н. Швалов2, И.Н. Швайкова1,

C.Г. Юн1, Т.С. Яковлева8

1Новосибирский государственный технический университет, г. Новосибирск; 2Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор», Новосибирская область; 3United States Environmental Protection Agency, National Center forEnvironmentalAssessment, Cincinnati, OH, USA; 4Tufts University School of Engineering, Medford, MA, USA; 5Центр гигиены и эпидемиологии в Новосибирской области, Новосибирск; 6МУП Водоканал, г. Новосибирск; 7Центр гигиены и эпидемиологии в Алтайском Крае, г. Барнаул; 8ОАО Барнаульский водоканал, г. Барнаул; 9Центр гигиены и эпидемиологии Приморского края, г. Владивосток; 10Центр гигиены и эпидемиологии Красноярского края, г. Красноярск;11Красноярский жилищно-коммунальный комплекс «Краском», г. Красноярск; 12Центр гигиены и эпидемиологии Свердловской области, г. Екатеринбург; 13МУПВодоканал, г. Екатеринбург; 14Центр гигиены и эпидемиологии Челябинской области, г. Челябинск; 15МУППроизводственное объединение водоснабжения и водоотведения, г. Челябинск; *Now with the World Health Organization, Bonn, Germany

Основная задача исследования состояла в создании банка данных CliWaDIn 1,0 (Climate Water Diseases Infections) с целью проведения анализа взаимоотношений между факторами, относящими к окружающей среде, и желудочно-кишечными инфекциями, включая отдаленные взаимосвязи между ежедневными данными по погоде, качеству воды и данными по инфекционной заболеваемости, с целью оценки влияния экстремальных проявлений погоды вследствие глобального изменения климата на инфекции, передающиеся водным путем в России.

Репозиторий базы данных банка CliWaDIn содержит данные, относящиеся к окружающей среде и показателям здоровья. Стандартные системы организации базы данных (DBMS) были использованы для того, чтобы позволить безопасный дистанционный доступ к ним через WEB-интерфейс. DBMS MySQL 5,0 был использован для формирования начальных баз данных по качеству воды, погоде и инфекциям, передающимся водным путем. DBMS MSSQL2005 был использован для того, чтобы собрать объединенную базу данных, содержащих сведения по ежедневному качеству воды, погоде и количеству инфекционных заболеваний вместе с процедурами проверки качества и подтверждения качества данных. Ежедневные данные были собраны для шести городов: Новосибирска, Барнаула, Владивостока, Челябинска, Екатеринбурга и Красноярска. Относящие к окружающей среде данные содержат ежедневные сведения о 27 параметрах погоды в период с 2000 по 2009 гг. и 20 видов данных по качеству воды за период от 3 до 8 лет. Данные по инфекционной заболеваемости, содержащиеся в базе данных, объ-

2012, Т. 2, № 1-2

Внедрение достижений эпидемиологии

единяют сведения об инфекциях, передающихся через питьевую воду, включая ежедневные данные по желудочно-кишечным инфекциям неизвестной этиологии за этот же период. Предварительный статистический анализ продемонстрировал, что банк CliWaDIn можно использовать для оценки сложных взаимосвязей между погодой, качеством воды и инфекциями. Банк данных зарегистрирован в РОСПАТЕНТЕ: Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2011620720, по заявке № 2011620396 от 01.06.11; опубл. 04.10.11.

ЛЕПРА. ОБ ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОМ БЛАГОПОЛУЧИИ

В.В. Дуйко

ФГБУ «НИИЛ» Минздравсоцразвития России, г. Астрахань

На протяжении последних 25 лет заболеваемость лепрой в России носит устойчивый спорадический характер. Эпидемиологическую ситуацию позволило изменить эффективное лечение, качественная реабилитация и профилактика лепры в сочетании с медицинскими, социальными и экономическими мерами. Со снижением первичной заболеваемости уменьшалось общее число состоящих на учете больных, значительно увеличилась средняя продолжительность жизни и улучшилось ее качество. Это снижение было обеспечено обязательной госпитализацией и лечением всех вновь выявляемых больных лепрой; полноценным амбулаторным лечением и диспансерным наблюдением; превентивным лечением и ежегодным осмотром всех контактных лиц; проведением санитарно-просветительной и профилактической работы в очагах лепры.

Последние десятилетия характеризуются постарением состоящих на учете больных, наличием у них различных сопутствующих заболеваний, преобладанием среди вновь выявленных пожилого контингента с наиболее неблагоприятными многобактериальными формами лепры. Все чаще встречаются ошибки диагностики, когда больные поступают в запущенной стадии заболевания, а также случаи завозной лепры, что требует тщательного подхода к обследованию мигрантов. Увеличение среди больных лепрой лиц пожилого и старческого возраста требует индивидуализации их лечения с учетом снижения общей реактивности организма, наличия сопутствующих заболеваний, переносимости лекарственных средств и других особенностей.

Особая роль при этом отводится методам ранней, доклинической диагностики лепры и выявлению «групп повышенного риска» заболевания среди контактных лиц. Важнейшей задачей является разработка методов диагностики, профилактики и лечения инвалидизирующих последствий лепрозного процесса, дальнейшее совершенствование медицинской и физической реабилитации больных лепрой, что в свою очередь будет способствовать их более полной социальной реабилитации.

Важную роль призваны сыграть новые серологические методы диагностики заболевания, способные выявлять его на доклинической стадии, разработка молекулярно-генетических тест-систем. Нуждаются в дальнейшем изучении патоморфо-логические, иммунологические и биохимические основы патогенеза заболевания, вопросы контроля

эффективности лечения, прогнозирования и предотвращения инвалидизации, разработки критериев излеченности и др.

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ГЕОИНФОРМАЦИОННЫХ ТЕХНОЛОГИЙ В ПРАКТИКЕ ПРОТИВОЭПИДЕМИЧЕСКОЙ РАБОТЫ

Е.И. Ефимов, В.И. Ершов, П.Н. Никитин

ФБУН «Нижегородский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. академика И.Н. Блохиной» Роспотребнадзора, г. Нижний Новгород

Внедрение эффективной системы мониторинга за уровнем и динамикой инфекционной заболеваемости в практику работы органов и учреждений Роспотребнадзора и здравоохранения позволит оперативно реагировать на изменение эпидемических проявлений актуальных инфекций, значительно снизить заболеваемость населения, минимизировать материальные затраты по борьбе с ними. Применение с указанной целью компьютерных геоинформационных технологий даст возможность максимально визуализировать традиционные числовые и графические базы данных, за счет привязки последних к реальной картографической основе, в том числе с учетом конкретных ландшафтных, биоценотических и демографических характеристик региона.

Нами ведется разработка и внедрение в практику работы органов Роспотребнадзора и здравоохранения электронный эпидемиологический атлас Приволжского федерального округа (ПФО). В составе атласа 2 части — первая представляет информацию об инфекционной заболеваемости населения на территории округа в целом и на территории конкретного субъекта ПФО, во второй части представлена информация о силах и средствах противоэпидемической защиты населения субъектов округа. В разделах первой части атласа использованы базы данных о характеристиках эпидемического процесса вирусных гепатитов, ВИЧ-инфекции, гриппа и острых инфекций верхних дыхательных путей, ряда острых кишечных инфекций, дифтерии. Планируется работа по расширению баз данных по ряду других социально-значимых инфекций, среди которых будут представлены менингококковая инфекция, туберкулез, при-родноочаговые инфекции. Информация второй части атласа об организационно-штатной структуре, обеспечении кадрами, оборудованием, о возможностях работы специалистов и учреждений в условиях эпидемиологического неблагополучия необходима органам власти и руководителям здравоохранения при принятии ими управленческих решений.

Использование электронного эпидемиологического атласа ПФО органами здравоохранения и административного управления субъектов ПФО позволит своевременно проводить оценку эпидемиологической ситуации, прогнозировать ее развитие, а на основе прогноза своевременно принимать организационные и управленческие решения по снижению уровня заболеваемости населения округа, а также оптимизировать использование финансовых средств, направленных на проведение профилактических и противоэпидемических мероприятий.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.