Научная статья на тему 'АПРОБАЦИЯ ОТЕЧЕСТВЕННОГО НАБОРА "МПК-МИКРО", ПРЕДНАЗНАЧЕННОГО ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АНТИБИОТИКОЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ МИКРООРГАНИЗМОВ МЕТОДОМ СЕРИЙНЫХ МИКРОРАЗВЕДЕНИЙ'

АПРОБАЦИЯ ОТЕЧЕСТВЕННОГО НАБОРА "МПК-МИКРО", ПРЕДНАЗНАЧЕННОГО ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АНТИБИОТИКОЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ МИКРООРГАНИЗМОВ МЕТОДОМ СЕРИЙНЫХ МИКРОРАЗВЕДЕНИЙ Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
174
34
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
АНТИБИОТИКОРЕЗИСТЕНТНОСТЬ / МЕТОД СЕРИЙНЫХ МИКРОРАЗВЕДЕНИЙ / КОЛИСТИН / МИНИМАЛЬНАЯ ПОДАВЛЯЮЩАЯ КОНЦЕНТРАЦИЯ

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Самойлова Анна Андреевна, Краева Л.А., Лихачев И.В., Рогачева Е.В., Вербов В.Н.

Цель. Апробация набора «МПК-МИКРО», разработанного в отделе новых технологий ФБУН «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера», на эталонных штаммах и клинических изолятах бактерий. Материалы и методы. Для апробации набора «МПК-МИКРО» использовали несколько вариантов его исполнения, включающих антибиотики разных групп: азтреонам, амикацин, гентамицин, колистин, меропенем, нитрофурантоин, хлорамфеникол, цефотаксим, цефтриаксон, ципрофлоксацин, эритромицин. Для определения диапазона концентраций антибиотиков использовали базу данных EUCAST-2020. Контроль качества сорбированных антибиотиков проводили, используя следующие референтные штаммы: Escherichia coli ATCC 25922, Staphylococcus aureus ATCC 29213 и Escherichia coli NCTC 13846 (резистентный к колистину). Допустимые и целевые диапазоны значений МПК для контрольных штаммов оценивали согласно «Routine and extended internal quality control for MIC determination and disk diffusion as recommended by EUCAST» (версия 10.0). В работе использованы 28 клинических изолятов K. pneumoniae, выделенных от пациентов с нозокомиальными инфекциями в стационарах Санкт-Петербурга в 2018-2019 гг. Согласование результатов испытаний проводили по ГОСТ Р ИСО 20776-1-2010. Результаты определения чувствительности интерпретировали в соответствии с рекомендациями EUCAST (версия 10.0). Результаты. Значения МПК в отношении контрольных штаммов, полученные при помощи набора «МПК-МИКРО», определены в диапазоне рекомендованных значений стандарта EUCAST-2020. Результаты, полученные при работе с клиническими изолятами K. pneumoniae, показали, что категории чувствительности, определенные с помощью разработанного набора и методом серийных микроразведений, совпали для всех исследуемых штаммов. Доля резистентных к колистину (МПК > 2 мг/л) изолятов, определенная методом серийных микроразведений и с помощью набора «МПК-МИКРО», составила 35,7%. Доля чувствительных штаммов также совпала при двух видах исследования и составила 64,3%. Выводы. При изучении чувствительности штаммов K. pneumoniae к колистину с помощью диагностического набора «МПК-МИКРО» и референтного метода серийных микроразведений в планшете были получены сопоставимые результаты. Диагностическая эффективность, удобство в использовании и простота учета результатов свидетельствуют о возможности применения разработанного набора «МПК-МИКРО» в клинической лабораторной практике.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Самойлова Анна Андреевна, Краева Л.А., Лихачев И.В., Рогачева Е.В., Вербов В.Н.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

APPRAISAL OF THE DOMESTIC KIT "MIC-MICRO" FOR ANTIMICROBIAL SUSCEPTIBILITY TESTING BY SERIAL MICRODILUTION METHOD

Objective. To assess efficiency of the “MIC-MICRO” kit developed in the Department of New Technologies of the Saint-Petersburg Pasteur Institute, on reference strains and clinical bacterial isolates. Materials and methods. In order to assess the “MIC-MICRO” kit, several options of its execution were used, including different groups of antibiotics: aztreonam, amikacin, gentamicin, colistin, meropenem, nitrofurantoin, chloramphenicol, cefotaxime, ceftriaxone, ciprofloxacin, erythromycin. In order to determine the range of antibiotic values, the EUCAST-2020 database was used. The quality control of adsorbed antibiotics was carried out using reference strains: Escherichia coli ATCC 25922, Staphylococcus aureus ATCC 29213 and Escherichia coli NCTC 13846 (colistin-resistant). Acceptable and target ranges of MIC values for control strains are evaluated according to “Regular and extended internal quality control for determining MIC and disk diffusion according to EUCAST recommendations” (v10.0). A total of 28 clinical isolates of K. pneumoniae obtained from patients with nosocomial infections in St. Petersburg hospitals in 2018-2019 was used in the study. The coordination of test results was obtained in accordance with GOST R ISO 20776-1-2010. Susceptibility testing results were interpreted in accordance with EUCAST recommendations (v10.0). Results. The MIC values in relation to the reference strains obtained using the “MIC-MICRO” kit were determined in the range of recommended values of the EUCAST-2020 standard. The results obtained in relation to clinical isolates of K. pneumoniae showed that the sensitivity categories determined using the developed kit and the serial microdilution method were the same for all the studied strains. The percentage of colistin-resistant isolates (MIC > 2 mg/ml) in the serial microdilution method and determined using the “MIC-MICRO” kit was 35.7%. The percentage of susceptible strains was also similar for two types of methods (64.3%). Conclusions. Colistin susceptibility testing of K. pneumoniae strains using the “MIC-MICRO” diagnostic kit and the reference serial microdilution method in a tablet, showed comparable results. Diagnostic efficiency, ease to use and simple interpretation of results make it possible to use the developed “MIC-MICRO” kit in clinical laboratory practice.

Текст научной работы на тему «АПРОБАЦИЯ ОТЕЧЕСТВЕННОГО НАБОРА "МПК-МИКРО", ПРЕДНАЗНАЧЕННОГО ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АНТИБИОТИКОЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ МИКРООРГАНИЗМОВ МЕТОДОМ СЕРИЙНЫХ МИКРОРАЗВЕДЕНИЙ»

КЛИНИЧЕСКАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ И АНТИМИКРОБНАЯ ХИМИОТЕРАПИЯ

Том 22 №3

2020

Межрегиональная ассоциация по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии

Научно-исследовательский институт антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО СГМУ Минздрава России Учредитель

Межрегиональная ассоциация по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии Издатель

Межрегиональная ассоциация по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии www.iacmac.ru Журнал зарегистрирован Комитетом РФ по печати 30.09.1999 г. (№019273) Тираж 3000 экз.

Подписные индексы По каталогу «Журналы России» на 2020 г. агентства «Роспечать»:

82125 - для индивидуальных

подписчиков;

82126 - для организаций.

Подписка на сайте издателя

https://service.iacmac.ru

Адрес для корреспонденции

214019, г. Смоленск, а/я 5. Тел./факс: (4812)45 06 02

Электронная почта: cmac@antibiotic.ru Электронная версия журнала: www.cmac-journal.ru

Журнал входит в Перечень рецензируемых научных изданий, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук. Присланные в редакцию статьи проходят рецензирование

Мнение редакции может не совпадать с точкой зрения авторов публикуемых материалов

Ответственность за достоверность рекламных публикаций несут рекламодатели При перепечатке ссылка на журнал обязательна

© Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия, 2020.

Содержание

164

175

Болезни и возбудители

Колбин А.С.

Лечение COVID-19 антималярийными средствами с клинико-фармакологических позиций Кулабухов В.В., Шабанов А.К., Андреева И.В., Стецюк О.У., Андреев В.А.

Биомаркеры инфекции в оптимизации антибактериальной терапии: оправданные ожидания Попов Д.А.

189 Нерешенные вопросы антибиотикотерапии инфекций, вызванных золотистыми стафилококками

Антимикробные препараты

Веселов А.В.

197 Современное место эхинокандинов в терапии и профилактике инвазивных микозов: краткий обзор

Бонцевич Р.А., Адонина А.В., Гаврилова А.А., Батищева Г.А., Черенкова О.В., Гончарова Н.Ю., Биккинина Г.М., Барышева В.О., Кетова Г.Г., Бочанова Е.Н., Даулетбеков Н.Д., Тилекеева У.М. 212 Оценка уровня знаний студентов старших курсов медицинских вузов по вопросам рационального применения антимикробных препаратов в клинической практике: результаты проекта «KANT»

Опыт работы

Гордеева С.А., Золотарёв А.Ю., Мовсисян М.Г., Розинко А.В. 221 Опыт практического применения микробиологического анализатора BactoSCREEN в работе лаборатории клинической микробиологии

Самойлова А.А., Краева Л.А., Лихачев И.В., Рогачева Е.В., Вербов В.Н., Михайлов Н.В., Зуева Е.В.

231 Апробация отечественного набора «МПК-МИКРО», предназначенного для определения антибиотикочувствительности микроорганизмов методом серийных микроразведений

Иванцов В.А., Богданович И.П., Лашковский В.В., Аносов В.С. 237 Клинические и микробиологические характеристики перипротезной инфекции тазобедренного и коленного суставов

Зырянов С.К., Ченкуров М.С., Ивжиц М.А., Батечко Ю.А., Иванова Е.Б., Якунина М.А. 242 Исследование структуры сопутствующих заболеваний и этиологии внебольничной пневмонии у пациентов пожилого и старческого возраста

RM'AX

www.cmac-journal.ru

КЛИНИЧЕСКАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ И АНТИМИКРОБНАЯ ХИМИОТЕРАПИЯ

КЯМЕИ Ш

2020

DOI: 10.36488/cmac.2020.3.231 -236

Оригинальная статья

Апробация отечественного набора «МПК-МИКРО», предназначенного для определения антибиотикочувствительности микроорганизмов методом серийных микроразведений

Самойлова А.А., Краева Л.А., Лихачев И.В., Рогачева Е.В., Вербов В.Н., Михайлов Н.В., Зуева Е.В.

ФБУН «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера» Роспотребнадзора, Санкт-Петербург, Россия

Контактный адрес:

Анна Андреевна Самойлова

Эл. почта: samanta1906@mail.ru

Ключевые слова: антибиотикорези-стентность, метод серийных микроразведений, колистин, минимальная подавляющая концентрация.

Конфликт интересов: авторы заявляют об отсутствии конфликтов интересов.

Внешнее финансирование: исследование проведено без внешнего финансирования.

Цель. Апробация набора «МПК-МИКРО», разработанного в отделе новых технологий ФБУН «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера», на эталонных штаммах и клинических изолятах бактерий.

Материалы и методы. Для апробации набора «МПК-МИКРО» использовали несколько вариантов его исполнения, включающих антибиотики разных групп: азтреонам, амикацин, гентамицин, колистин, меропенем, нитрофурантоин, хлорамфеникол, цефотаксим, цефтриаксон, ципрофлокса-цин, эритромицин. Для определения диапазона концентраций антибиотиков использовали базу данных EUCAST-2020. Контроль качества сорбированных антибиотиков проводили, используя следующие референтные штаммы: Escherichia coli ATCC 25922, Staphylococcus aureus ATCC 29213 и Escherichia coli NCTC 13846 (резистентный к колистину). Допустимые и целевые диапазоны значений МПК для контрольных штаммов оценивали согласно «Routine and extended internal quality control for MIC determination and disk diffusion as recommended by EUCAST» (версия 10.0). В работе использованы 28 клинических изолятов K. pneumoniae, выделенных от пациентов с нозокомиальными инфекциями в стационарах Санкт-Петербурга в 2018-2019 гг. Согласование результатов испытаний проводили по ГОСТ Р ИСО 20776-1-2010. Результаты определения чувствительности интерпретировали в соответствии с рекомендациями EUCAST (версия 10.0).

Результаты. Значения МПК в отношении контрольных штаммов, полученные при помощи набора «МПК-МИКРО», определены в диапазоне рекомендованных значений стандарта EUCAST-2020. Результаты, полученные при работе с клиническими изолятами K. pneumoniae, показали, что категории чувствительности, определенные с помощью разработанного набора и методом серийных микроразведений, совпали для всех исследуемых штаммов. Доля резистентных к колистину (МПК > 2 мг/л) изолятов, определенная методом серийных микроразведений и с помощью набора «МПК-МИКРО», составила 35,7%. Доля чувствительных штаммов также совпала при двух видах исследования и составила 64,3%.

Выводы. При изучении чувствительности штаммов K. pneumoniae к колистину с помощью диагностического набора «МПК-МИКРО» и референтного метода серийных микроразведений в планшете были получены сопоставимые результаты. Диагностическая эффективность, удобство в использовании и простота учета результатов свидетельствуют о возможности применения разработанного набора «МПК-МИКРО» в клинической лабораторной практике.

Original Article

Appraisal of the domestic kit «MIC-MICRO» for antimicrobial susceptibility testing by serial microdilution method

Samoilova A.A., Kraeva L.A., Likhachev I.V., Rogacheva E.V., Verbov V.N., Mikhailov N.V., Zueva E.V.

Pasteur Research Institute of Epidemiology and Microbiology, Saint-Petersburg, Russia

Objective. To assess efficiency of the "MIC-MICRO" kit developed in the Department of New Technologies of the Saint-Petersburg Pasteur Institute, on reference strains and clinical bacterial isolates. Materials and methods. In order to assess the "MIC-MICRO" kit, several options of its execution were used, including different groups of antibiotics: aztreonam, amikacin, gentamicin, colistin, meropenem, nitrofurantoin, chloramphenicol, cefotaxime, ceftriaxone, ciprofloxacin, erythromycin. In order to determine the range of antibiotic values, the EUCAST-2020 database was used. The quality control of adsorbed antibiotics was carried out using reference strains: Escherichia coli ATCC 25922, Staphylococcus aureus ATCC 29213 and Escherichia coli NCTC 13846 (colistin-resistant). Acceptable and target ranges of MIC values for control strains are evaluated according to "Regular and extended internal quality control for determining MIC and disk diffusion according to EUCAST recommendations" (v10.0). A total of 28 clinical isolates of K. pneumoniae obtained from patients with nosocomial infections in St. Petersburg hospitals in 2018-2019 was used in the study. The coordination of test results was obtained in accordance with

Самойлова А.А. и соавт.

Contacts:

Anna A. Samoilova E-mail: samanta1906@mail.ru

Key words: antimicrobial resistance, serial microdilution method, colistin, minimum inhibitory concentration.

Conflicts of interest: all authors report no conflicts of interest relevant to this article.

External funding source: no external funding received.

GOST R ISO 20776-1-2010. Susceptibility testing results were interpreted in accordance with EUCAST recommendations (v10.0).

Results. The MIC values in relation to the reference strains obtained using the "MIC-MICRO" kit were determined in the range of recommended values of the EUCAST-2020 standard. The results obtained in relation to clinical isolates of K. pneumoniae showed that the sensitivity categories determined using the developed kit and the serial microdilution method were the same for all the studied strains. The percentage of colistin-resistant isolates (MIC > 2 mg/ml) in the serial microdilution method and determined using the "MIC-MICRO" kit was 35.7%. The percentage of susceptible strains was also similar for two types of methods (64.3%).

Conclusions. Colistin susceptibility testing of K. pneumoniae strains using the "MIC-MICRO" diagnostic kit and the reference serial microdilution method in a tablet, showed comparable results. Diagnostic efficiency, ease to use and simple interpretation of results make it possible to use the developed "MIC-MICRO" kit in clinical laboratory practice.

Введение

Приобретенная резистентность бактерий к антимикробным препаратам (АМП) - одна из наиболее важных проблем современного здравоохранения [1]. В настоящее время около 700 тыс. человек ежегодно умирает от инфекций, вызванных антибиотикорезистентными микроорганизмами. В отсутствие радикальных действий к 2050 г. ежегодная смертность населения от инфекционных заболеваний в мире может достигнуть 10 млн человек [2]. Несмотря на то что бактерии все быстрее приспосабливаются к АМП, создание новых антибиотиков в последние годы оказалось у критической черты [3]. Особое беспокойство вызывают случаи нозокомиаль-ных инфекций, вызванных грамотрицательными бактериями [4, 5].

В течение последних 20 лет бактерии порядка Enterobacterales являются наиболее частыми возбудителями нозокомиальных инфекций в стационарах России [6]. Более 50% изолятов, принадлежащих к этому порядку, представлены видом Klebsiella pneumoniae, который отличается множественной устойчивостью к антибиотикам, в особенности к бета-лактамам [7, 8]. Устойчивость этого микроорганизма ко всем широко используемым классам антибиотиков (цефалоспорины, карбапенемы, аминогликозиды, фторхинолоны) на фоне отсутствия перспективы появления в ближайшие годы новых АМП привели в начале 2000-х гг. к возврату в клиническую практику парентеральных полимиксинов, в том числе колистина [9]. Важной особенностью колис-тина является его способность изменять структуру клеточной мембраны бактерий, что вызывает ее гибель. Это отличие механизма действия колистина от других антибиотиков позволяет бороться с полирезистентными возбудителями в различных отделениях многопрофильных клиник [10, 11]. Резистентность нозокомиальных штаммов к колистину развивается при этом гораздо медленнее, чем к другим классам АМП: например, 77,7% штаммов порядка Enterobacterales, выделенных в стационарах России, сохранили чувствительность к колистину [12]. Поскольку колистин является препаратом выбора при резистентности к бета-лактамам, крайне важным представляется определение чувствительности к нему у выделенных клинических изолятов [13].

Согласно ISO 207761:2006 и Национальному стандарту ГОСТ Р ИСО 20776-1-2010, чувствительность клинических изолятов к колистину следует определять методом серийных разведений в бульоне, а не

диско-диффузионным методом (ДДМ) из-за нестабильной диффузии АМП из диска [14].

Метод серийных разведений считается наиболее информативным и точным, но при постановке в лабораторных условиях без использования коммерческих наборов возможно возникновение методических трудностей, к которым относятся необходимость тщательного контроля качества питательных сред, сложность приготовления рабочих растворов АМП и строгое соблюдение режимов их хранения [15]. Применение тест-систем, основанных на методе серийных микроразведений (МСМ), позволяет получить достоверные количественные результаты при определении категорий антибиотикоре-зистентности и избежать трудоемких подготовительных этапов.

В настоящее время в России для определения чувствительности микроорганизмов к АМП применяют импортные тест-системы. Они весьма дорогостоящи, что ограничивает их применение в бактериологических лабораториях и диктует необходимость разработки тест-систем отечественного производства.

Распоряжением Правительства Российской Федерации от 25 сентября 2017 г. №2045-р введена в действие «Стратегия предупреждения распространения антибиотикорезистентности в Российской Федерации на период до 2030 года». В документе указывается, что внедрение современных методов диагностики инфекционных заболеваний и определение чувствительности возбудителей инфекционных заболеваний к АМП должно обеспечить снижение риска развития резистентности патогенных микроорганизмов. На основании вышеизложенного вполне очевидно, что создание отечественного медицинского изделия для количественного определения чувствительности возбудителей инфекций к АМП представляется актуальным.

Цель исследования - апробация набора «МПК-МИКРО», разработанного в отделе новых технологий ФБУН «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера», на эталонных штаммах и клинических изоля-тах бактерий.

Материалы и методы

Набор «МПК-МИКРО», разработанный в соответствии с Методическими указаниями МУК 4.2.1890-04 «Определение чувствительности микроорганизмов к

Самойлова А.А. и соавт.

антибактериальным препаратам», предназначен для оценки чувствительности бактерий к АМП МСМ. Для апробации набора были выбраны АМП, принадлежащие к разным группам: азтреонам (монобактам), амикацин (аминогликозид), гентамицин (аминогликозид), колистин (полимиксин), меропенем (карбапенем), нитрофурантоин (нитрофуран), хлорамфеникол (амфеникол), цефотаксим (цефалоспорин), цефтриаксон (цефалоспорин), ципро-флоксацин (фторхинолон), эритромицин (макролид). Для определения диапазона концентраций АМП использовали базу данных EUCAST-2020: Antimicrobial wild type distributions of microorganisms, а именно - таблицы распределения значений минимальных подавляющих концентраций (МПК) для широкого спектра микроорганизмов и АМП, а также предварительные значения ECOFF (эпидемиологические точки отсечения) [16]. Используя эти таблицы, проводили оценку наиболее распространенных значений МПК для клинически значимых микроорганизмов, на основании которых определяли подходящий диапазон концентраций для каждого АМП.

Контроль качества сорбированных АМП для определения чувствительности проводили с использованием следующих референтных штаммов: Escherichia coli ATCC 25922, Staphylococcus aureus ATCC 29213 и Escherichia coli NCTC 13846 (резистентный к колис-тину). Допустимые и целевые диапазоны значений МПК для контрольных штаммов согласовывали с данными документа «Routine and extended internal quality control for MIC determination and disk diffusion as recommended by EUCAST» (версия 10.0).

Рост исследуемого микроорганизма в лунках стрипа оценивали визуально через 16 ч. по появлению мутности по сравнению с контрольными лунками. Отсутствие видимых изменений свидетельствовало о подавлении роста микроорганизма. Значение МПК соответствовало наименьшей концентрации АМП в той лунке, где визуально не определялся рост бактерий.

Определение чувствительности к колистину проводили двумя методами согласно ГОСТ Р ИСО 207761-2010: референтным МСМ и при помощи набора

«МПК-МИКРО». В работе использовали 28 клинических изолятов K. pneumoniae, выделенных от пациентов с нозокомиальными инфекциями в стационарах Санкт-Петербурга. Идентификацию всех исследуемых клинических изолятов до вида проводили методом вре-мяпролетной масс-спектрометрии с матрично-ассоци-ированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF MS) с использованием спектрометра Microflex LRF и программным обеспечением «Biotyper RTC» (Bruker Daltonics, Германия). Значения score > 2,0 использовали в качестве критерия надежной видовой идентификации.

Для контроля определения чувствительности указанных штаммов к колистину использовали МСМ в бульоне Мюллера - Хинтон (HiMedia, Индия), приготовленном в соответствии с инструкцией производителя, в 96-лу-ночных полистироловых планшетах («Медполимер», Россия). Для приготовления рабочего раствора коли-стина использовали субстанцию колистина сульфата (Номер CAS: 1264-72-8) в форме порошка (Sigma Aldrich, Германия). Колистин растворяли в стерильной дистиллированной воде до концентрации 6,4 мг/мл. Внесение раствора антибиотика в лунки планшетов проводили методом серийных двукратных разведений, при этом две последние лунки оставляли пустыми для положительного и отрицательного контролей.

Из суточной культуры исследуемых клинических изо-лятов готовили суспензию микроорганизмов в физиологическом растворе плотностью 0,5 ед. по Мак-Фарланду (соответствует 1,5 х 108 КОЕ/мл). Из полученной суспензии готовили необходимое количество посевного инокулята плотностью 0,5 х 106 КОЕ/мл в бульоне Мюллера - Хинтон. Во все лунки планшетов, кроме отрицательного контроля, вносили по 100 мкл инокулята. Планшеты инкубировали при температуре 35°С в течение 18 ± 2 ч. Рост исследуемого микроорганизма в лунках планшета оценивали визуально через 16 ч. по появлению мутности по сравнению с контрольными лунками.

Результаты определения чувствительности интерпретировали в соответствии с рекомендациями EUCAST (версия 10.0) - «Breakpoint tables for interpretation of

Таблица 1. Расчет коэффициентов эффективности и допустимые критерии приемлемости

Коэффициент эффективности Формула расчета Значение переменных в формуле Критерии приемлемости

Категорийное согласование (Categorical agreement, CA) NCA NT X 100 - число бактериальных изолятов той же категории, что и категории по референтному методу; ^ - общее число исследованных бактериальных изолятов > 90% CA

Существенное согласование (Essential agreement, EA) Nea x 100 NT - число бактериальных изолятов со значением МПК, находящимся в пределах одного двукратного разведения от МСМ; ^ - общее число исследованных бактериальных изолятов > 90% EA

Большое расхождение (Major discrepancy, MD) NMD MD x 100 NRefS N/^[3 - число бактериальных изолятов, оцененных как резистентные тестируемым методом, но как чувствительные при помощи МСМ; - число бактериальных штаммов, оцененных как чувствительные при помощи МСМ < 3% MD

Очень большое расхождение (Very major discrepancy, VMD) Nvmd X 100 N RefR N«^5 - число бактериальных изолятов, оцененных как чувствительные тестируемым методом, но как резистентные при помощи МСМ; N1« - число бактериальных штаммов, оцененных как резистентные при помощи МСМ < 3% VMD

Самойлова А.А. и соавт.

MICs and zone diameters», в которых указано, что микроорганизмы порядка Enterobacterales являются чувствительными к колистину при значении МПК < 2 мг/л.

Согласно ГОСТ Р ИСО 20776-1-2010, для оценки результатов определения чувствительности референтным методом (МСМ) и результатов, полученных при помощи тестируемого изделия (набора «МПК-МИКРО»), определяли согласование результатов испытаний (кате-горийное согласование (CA) и существенное согласование (EA)) и расхождения результатов испытаний (большое расхождение (MD) и очень большое расхождение (VMD)). Дизайн расчета коэффициентов эффективности и критериев приемлемости представлен в Таблице 1.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Результаты

В ходе исследования на эталонных штаммах микроорганизмов были апробированы 11 АМП, каждый из которых проверяли 3 раза для учета воспроизводимости результатов. Результаты определения значений МПК при помощи набора «МПК-МИКРО» для указанных АМП представлены в Таблице 2.

Как видно из Таблицы 2, значения МПК, полученные при помощи набора «МПК-МИКРО», находятся в диапазоне допустимых значений стандарта EUCAST-2020. Согласно национальному стандарту ГОСТ Р ИСО 20776-1 -2010, значения МПК, полученные методом серийных разведений, должны быть воспроизводимы в пределах одного двойного разведения реальной конечной точки (т.е. ± 1 лунка), что и было получено по результатам исследования.

Исследование чувствительности клинических изоля-тов K. pneumoniae к колистину проводилось параллельно референтным и тестируемым методами в один день с использованием одного и того же источника инокулюма. Значения МПК, определенные МСМ и с помощью набора «МПК-МИКРО», представлены на Рисунке 1.

Доля изолятов, резистентных к колистину (МПК > 2 мг/л), составила 35,7% (n = 10) для МСМ. Доля резистентных изолятов, определенная с помощью набора «МПК-МИКРО», также составила 35,7% (n = 10).

8 ...............................................................................................................................................................................................................

^ 1 ш

0,031 0,063 0,125 0,25 0,5 1 2 4 8 16 32 «г/л

■ МПК-МИКРО ■ МСМ

Рисунок 1. Значения МПК колистина, определенные методом серийных микроразведений (МСМ) и с помощью набора «МПК-МИКРО»

Таблица 2. Результаты определения МПК при помощи набора «МПК-МИКРО» для эталонных штаммов микроорганизмов

№ АМП Диапазон концентраций АМП, мг/л Контрольный штамм Диапазон значений МПК для данного штамма, EUCAST, мг/л Значение МПК*, мг/л

1 Азтреонам 0,032 -256 E. coli ATCC 25922 0,06-0,25 0,25

2 Амикацин 0,032-256 E. coli ATCC 25922 0,5-4,0 2,0

3 Гентамицин 0,032-256 E. coli ATCC 25922 0,25-1,0 1,0

4 Колистин 0,032-256 E. coli ATCC 25922 0,25-2,0 0,5

E. coli NCTC 13846 4,0 4,0

5 Меропенем 0,004-32 E. coli ATCC 25922 0,008-0,06 0,06

6 Нитрофурантоин 0,064-512 E. coli ATCC 25922 4,0-16,0 8,0

7 Хлорамфеникол 0,032-256 E. coli ATCC 25922 2,0-8,0 4,0

8 Цефотаксим 0,008-64 E. coli ATCC 25922 0,03-0,125 0,125

9 Цефтриаксон 0,008-64 E .coli ATCC 25922 0,03-0,125 0,125

10 Ципрофлоксацин 0,004-32 E. coli ATCC 25922 0,004-0,016 0,004

11 Эритромицин 0,032-256 S. aureus ATCC 29213 0,25-1,0 1,0

* Указано среднее значение МПК, полученное в результате трех экспериментов. Таблица 3. Коэффициенты эффективности, рассчитанные для МСМ и набора «МПК-МИКРО»

Метод Число чувствительных изолятов, п (%) Число резистентных изолятов, n (%) CA, n (%) EA, n (%) MD, n (%) VMD, n (%)

МСМ 18 (64,3%) 10 (35,7%)

«МПК-МИКРО» 18 (64,3%) 10 (35,7%) 100% 89,3% 0,0 % 0,0%

Самойлова А.А. и соавт.

Для определения эффективности апробируемого набора по сравнению с референтным методом были рассчитаны коэффициенты эффективности: категорийное согласование (CA), существенное согласование (EA), большое расхождение (MD), очень большое расхождение (VMD). Результаты определения коэффициентов эффективности представлены в Таблице 3.

Значение CA превысило критерий приемлемости 90% для тестируемого метода и составило 100%, а значение EA оказалось незначительно меньше - 89,3%. Значение большого расхождения (MD) и очень большого расхождения (VMD) составили 0,0% (критерий приемлемости < 3%), поскольку категории чувствительности, определенные МСМ и с помощью набора «МПК-МИКРО», совпали для всех исследованных клинических изолятов. Таким образом, значения коэффициентов эффективности, определенные в ходе исследования, удовлетворяют критериям приемлемости, за исключением незначительного отклонения значения EA.

Обсуждение

В результате проведенных экспериментов был апробирован набор «МПК-МИКРО», предназначенный для определения чувствительности микроорганизмов к АМП, и проведено сравнение полученных значений МПК с референтным методом серийных разведений. Значения МПК, определенные при помощи разработанного набора, для контрольных штаммов микроорганизмов были воспроизводимы и находились в диапазоне значений, рекомендуемых Европейским комитетом по определению чувствительности к антимикробным препаратам (EUCAST).

При работе с клиническими изолятами K. pneumoniae было установлено, что категории чувствительности, определенные с помощью разработанного набора и МСМ, совпали для всех исследуемых штаммов. Значения коэффициентов эффективности CA, EA, MD и VMD составили 100%, 89,3%, 0% и 0% соответственно.

По сравнению с референтным методом значения катего-рийного согласования результатов (CA) и значения расхождения результатов испытаний (MD и VMD) оказались приемлемыми, а частота существенного согласования на 0,7% ниже допустимого значения. Однако согласно ГОСТ Р ИСО 20776-1-2010, «...показатель существенного согласования (ЕА) представляет собой результат МПК, полученный с применением устройства для испытания антимикробной чувствительности, который находится в пределах плюс или минус одно двойное разведение от значения МПК, установленного референтным методом (ИСО 20776-1)», что согласуется с результатами проведенных экспериментов.

Поскольку определение чувствительности бактерий к колистину невозможно достоверно оценить не только с помощью ДДМ, но даже с помощью автоматизированных систем [14], настоящая разработка и ее дальнейшее совершенствование могут быть полезными и востребованными, особенно при работе с нозокомиаль-ными штаммами бактерий [15].

Заключение

В данной работе была проведена апробация разработанного авторами статьи набора «МПК-МИКРО» на эталонных штаммах микроорганизмов и клинических изолятах K. pneumoniae. Значения МПК для эталонных штаммов не выходили за пределы диапазона допустимых значений стандарта EUCAST-2020. При изучении чувствительности штаммов K. pneumoniae к колистину с помощью диагностического набора «МПК-МИКРО» и референтного МСМ в планшете были получены сопоставимые результаты. Преимуществами набора «МПК-МИКРО» являются удобство в использовании и простота учета результатов. Полученные в ходе исследования результаты свидетельствуют о возможности применения разработанного набора «МПК-МИКРО» в клинической лабораторной практике.

Литература

1. Sidorenko S.V., Kolbin, A. S., Balykina J.E. The social 4. and economic issues of acquired bacterial resistance. Klinicheskaja farmakologija i terapija. 2010;5:16-22. Russian. (Сидоренко С.В., Колбин А.С., Балыкина Ю.Е. Социально-экономические аспекты приобретенной бактериальной резистентности. Клиническая фармакология и терапия. 2010;5:16-22.)

2. O'Neill J. Tackling drug-resistant infections globally: final report and recommendations; 2016. O'Neill J. Review on Antimicrobial Resistance. Tackling drug resistant infections globally: final report and recommendations. 2016. Available at https://amr-review. org/sites/default/files/160518_Final%20paper_with%20cover.

pdf. Accessed October 2020. 5.

3. Cerceo E., Deitelzweig S.B., Sherman B.M., Amin A.N. Multidrug-resistant gram-negative bacterial infection in the hospital setting: overview, implications for clinical practice, and 6. emerging treatment options. Microb Drug Resist. 2016;2:46-53.

DOI: 10.1089/mdr.2015.0220

Edelstein M.V., Skleenova E.Yu., Shevchenko O.V., Tapalski D.V., Azizov I.S., D'souza J.W. et al. Prevalence and Molecular Epidemiology of Gram-negative Bacteria Producing Metallo-b-lactamases (MBLs) in Russia, Belarus and Kazakhstan. Klinicheskaja mikrobiologija i antimikrobnaja himioterapija. 2012;14(2):132-152. Russian. (Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Шевченко О.В., Тапальский Д.В., Азизов И.С., Д'соуза Дж.В. и соавт. Распространенность и молекулярная эпидемиология грамотрицательных бактерий, продуцирующих ме-талло-бета-лактамазы, в России, Беларуси и Казахстане. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2012;14(2):132-152.)

Kaye K.S., Pogue J.M. Infections caused by resistant gramnegative bacteria: epidemiology and management. Pharmacotherapy. 2015;35(10):949-962. DOI: 10.1002/phar.1636

Sukhorukova M.V., Edelstein M.V., Ivanchik N.V., Skleenova E.Yu., Shajdullina E.R., Azyzov I.S. et al. Antimicrobial resistance of nosocomial Enterobacterales isolates in Russia: results of multicenter

Самойлова А.А. и соавт.

epidemiological study "MARATHON 2015-2016". Klinicheskaja mikrobiologija i antimikrobnaja himioterapija. 2019;21(2):147-159. Russian. (Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Иван-чик Н.В., Склеенова Е.Ю., Шайдуллина Э.Р., Азизов И.С. и соавт. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacterales в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «МАРАФОН 2015-2016». Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019;21(2):147-159.) DOI: 10.36488/ cmac.2019.2.147-159

7. Shamina O.V., Kryzhanovskaya O.A., Lazareva A.V., Polikarpova S.V., Karaseva O.V., Chebotar I.V., et al. The comparison of methods for determination of Colistin susceptibility in carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae. Klinicheskaja laboratornaja diagnostika. 2018;63(10):646-650. Russian. (Шамина О.В., Крыжановская О.А., Лазарева А.В., Поликарпова С.В., Карасёва О.В., Чеботарь И.В. и соавт. Сравнение методов определения устойчивости к колистину у карбапенемрезистентных штаммов Klebsiella pneumoniae. Клиническая лабораторная диагностика. 2018;63(10):646-650.) DOI: 10.18821/0869-2084-2018-63-10-646-650

8. Weiner L.M., Fridkin S.K., Aponte-Torres Z., Avery L., Coffin N., Dudeck M., et al. Vital Signs: Preventing Antibiotic-Resistant Infections in Hospitals. Morb Mortal Wkly Rep. 2016;65(9):235-241. DOI: 10.15585/mmwr.mm6509e1

9. Liu Y., Wang Y., Walsh T.R., Yi L.-X., Zhang R., Spencer J., et al. Emergence of plasmid-mediated colistin resistance mechanism MCR-1 in animals and human being in China: a microbiological and molecular biological study. Lancet Infect Dis. 2016;16:161-168. DOI: 10.1016/S1473-3099(15)00424-7

10. Zuzov S.A., Zubkov M.M., Kononets P.V. Multidrug-resistant bacterial infections in the local general oncology hospital. Klinicheskiji jeksperimental'nyjhirurgicheskijzhurnal im. akademika B.V. Petrovskogo. 2016;2:25-34. Russian. (Зу-зов С.А., Зубков М.М., Кононец П.В. Проблема полирезистентности основных возбудителей нозокомиальной инфекции у хирургических пациентов в многопрофильном онкологическом стационаре. Клинический и экспериментальный хирургический журнал им. академика Б.В. Петровского. 2016;2:25-34.)

11. Kuzovlev A.N., Shabanov A.K., Golubev A.M, Moroz V.V. Assessment of aerosolized colistin efficacy for nosocomial

pneumonia. Obshhaja reanimatologija. 2017;13(6):60-73. Russian. (Кузовлев А.Н., Шабанов А.К., Голубев А.М., Мороз В.В. Оценка эффективности ингаляционного коли-стина при нозокомиальной пневмонии. Общая реаниматология. 2017;13(6):60-73.) DOI: 10.15360/1813-9779-20176-60-73

12. Sukhorukova M.V., Edelstein M.V., Skleenova E.Yu., Ivanchik N.V., Mikotina A.V., Dekhnich A.V., and the «MARATHON» study group. Antimicrobial resistance of nosocomial Enterobacteriaceae isolates in Russia: results of multicenter epidemiological study «MARATHON» 2013-2014. Klinicheskaja mikrobiologija i antimikrobnaja himioterapija. 2017;19(1):49-56. Russian. (Сухорукова М.В. Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В., Микотина А.В., Дехнич А.В. и исследовательская группа «МАРАФОН». Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacteriaceae в стационарах России. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(1):49-56.)

13. Volkova Y.V. Role of colistin in the treatment of nosocomial infection in patients of various types of intensive care units. Medicina neotlozhnyh sostojanij. 2018;2(89):17-22. Russian. (Волкова Ю.В. Роль колистина в лечении нозокомиальной инфекции у пациентов ОИТ различного профиля. Медицина неотложных состояний. 2018;2(89):17-22.) DOI: 10.22141/22240586.2.89.2018.126597

14. Vasoo S. Susceptibility testing for the polymyxins: two steps back, three steps forward? J Clin Microbiol. 2017;9:2573-2582. DOI: 10.1128/JCM.00888-17

15. Tapalskiy D.V., Bilskiy I.A. Antimicrobial susceptibility testing by broth microdilution method: widely available modification. Klinicheskaja mikrobiologija i antimikrobnaja terapija. 2018;20(1):62-67. Russian. (Тапальский Д.В., Бильский И.А Определение чувствительности к антибиотикам методом микроразведений в бульоне: модификация, доступная для всех. Клиническая микробиология и антимикробная терапия. 2018;20(1):62-67.) DOI: 10.36488/ cmac.2018.1.62-67

16. Turnidge J., Kahlmeter G., Kronvall G. Statistical characterisation of bacterial wild-type MIC value distributions and the determination of epidemiological cut-off values. Clin Microbiol Infect. 2006;12:418-425. DOI: 10.1111/j.1469-0691.2006.01377.x

Самойлова А.А. и соавт.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.