АНАЛИЗ ВКЛАДА ИЗМЕНЕНИЯ НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ГЕНА IL6 В РАЗВИТИИ РАКА ЯИЧНИКОВ Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

УДК 61.618.11

Шаяхметова А.К. студент магистратуры биологический факультет Прокофьева Д.С., к.биол.н.

доцент

кафедра «Генетики и фундаментальной медицины»

Мингажева Э. Т. аспирант

кафедра «Генетики и фундаментальной медицины» Башкирский государственный университет Хуснутдинова Э.К., доктор биологических наук

профессор

Институт биохимии и генетики Уфимский научный центр Российской академии наук Россия, Республика Башкортостан, г. Уфа АНАЛИЗ ВКЛАДА ИЗМЕНЕНИЯ НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ГЕНА IL6 В РАЗВИТИИ РАКА

ЯИЧНИКОВ

Аннотация:

Рак яичников является важнейшей социально-экономической проблемой современности. В России были зарегистрированы более 14000 новых случаев заболевания в 2016 году, более 50% из них закончились летально[1]. Около 15% всех случаев заболевания связаны с нарушениями в генах BRCA1/2, однако остальные случаи связаны с изменениями в других генах[2]. Идентификация новых генов, вовлеченных в патогенез рака яичников, будет способствовать усовершенствованию мер профилактики и лечения больных[3]. Одним из генов-кандидатов выступает ген IL6. Белок IL6 активно функционирует в очагах острого и хронического воспаления[4]. Нами был проведен анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs1800795 в гене IL-6 среди больных РЯ и здоровых женщин из Республики Башкортостан. Выявлена ассоциация полиморфного варианта rs1800795 гена IL6 с риском развития рака яичников у женщин из Республики Башкортостан (CG: OR=1.6, 95% CI 1.1-2.3, p=0.007; GG: OR=0,7, 95% CI 0.5-1, p=0.04).

Ключевые слова: рак яичников, иммунная система, интерлейкин 6, риск развития рака яичников, частота встречаемости, ассоциация.

Shayakhmetova A.K. graduate student of theFaculty of Biology

Bashkir State University Russia, the Republic of Bashkortostan, Ufa Prokofieva DS Candidate of Biological Sciences, Associate Professor Associate Professor of the Department of Genetics and Fundamental

Medicine

Bashkir State University Russia, the Republic of Bashkortostan, Ufa Mingajeva E. T. Post-graduate student of the Department of Genetics and

Fundamental Medicine Bashkir State University Russia, the Republic of Bashkortostan, Ufa Khusnutdinova E. K. doctor of biological sciences, professor Institute of Biochemistry and Genetics of the Ufa Science Center of the

Russian Federation Academy of Sciences Russia, the Republic of Bashkortostan, Ufa ANALYSIS OF THE CONTRIBUTION OF CHANGES IN THE NUCLEOTIDE SEQUENCE OF THE IL6 GENE IN OVARIAN CANCER PATHOGENESIS IN WOMEN FROM BASHKORTOSTAN

Abstract: Ovarian cancer is the most important social and economic problem of our time. In Russia, more than 14,000 new cases were registered in 2016, more than 50% of them ended lethal[1]. About 15% of all cases are associated with impairments in BRCA1 / 2 genes, but the remaining cases are associated with changes in other genes[2]. Identification of new genes involved in the pathogenesis of ovarian cancer will help improve the prevention and treatment of patients[3]. One of the candidate genes is the IL6 gene. IL6 protein actively functions in the centers of acute and chronic inflammation[4]. We analyzed the frequency distribution of alleles and genotypes of the polymorphic locus rs1800795 in the IL-6 gene among patients with OC and healthy women from the Republic of Bashkortostan. Was revealed the association of the polymorphic variant rs1800795 of the IL6 gene with the risk of ovarian cancer in women from the Republic of Bashkortostan (CG: OR=1.6, 95% CI 1.1-2.3, p=0.007; GG: OR=0,7, 95% CI0.5-1, p=0.04).

Key words: ovarian cancer, immune system, interleukin 6, risk of ovarian cancer, frequency of occurrence, association.

Рак яичников — злокачественная опухоль, поражающая яичники. Каждый год в мире регистрируются более 225 тысяч новых случаев рака яичников, более 60% из которых завершаются летально. К сожалению более 2/3 заболевших выявляются на поздних стадиях. Вместе с тем пятилетняя выживаемость при 3 стадии составляет чуть более 20%, а при 4 стадии-менее 5%[5].

Около 15% всех случаев заболевания раком яичников ассоциированы с нарушениями в генах репарации BRCA1/2, однако остальные случаи связаны с изменениями в других генах[2]. В настоящее время мало информации о том, какой вклад вносят эти малоизученные гены.

Иммунная защита организма от новообразований осуществляется комплексно с участием множества иммунокомпетентных клеток и цитокинов. Большой вклад в создание нормального иммунного ответа

вносят различные интерлейкины, обладающие способностью стимулировать рост и дифференцировку клеток. Однако, при нарушении их работы, они могут перестать сдерживать развитие опухоли, а также стать индукторами ее эволюции[6,7,8,9].

Целью исследования было изучить роль изменения нуклеотидной последовательности -174 G>C гена ^6 в патогенезе рака яичников Республики Башкортостан.

Материалами для исследования послужили образцы ДНК, выделенные из венозной крови 262 женщин с установленным диагнозом «рак яичников» и 284 здоровых доноров. Выделение осуществляли методом фенольно-хлороформной экстракции. Генотипирование образцов ДНК гена ^6 проводили с помощью ПЦР-ПДРФ анализа.

Амплификацию полиморфного локуса ^1800795 в гене ^6 проводили методом полимеразной цепной реакции. Скрининг полиморфного варианта гена ^6 осуществляли с помощью анализа полиморфизма длин рестрикционных фрагментов с использованием рестриктазы МаШ с детекцией продуктов реакции в полиакриламидном геле. Были получены фрагменты ДНК размером 306 п.н для аллеля G и 133 и 173 п.н. для аллеля С соответственно.(Рис. 1)

1 2 3 4 5 6 7

Рис. 1 Электрофореграмма рестрикционного анализа (рестриктаза МаШ) полиморфного варианта -174 G>C в гене ^6. Дорожки 1,3,4,6-генотип CG; 2,7 -генотип СС; 5- генотип GG.

В результате сравнительного анализа распределения частот аллелей достоверных различий между исследуемыми группами не было выявлено (Р>0,05). При сравнении общей выборки больных РЯ и контрольной группы было выявлено достоверное увеличение генотипа CG (р=0.004) в группе пациенток и генотипа GG (р=0.02) среди здоровых женщин.(рис.2)

0°о 100 O 200 o 300 О 400 0 500 0 контроль ■ больные РЯ

Рис. 2 Распределение частот аллелей и генотипов полиморфного локуса -rs1800795174 G>C гена IL6 у больных раком яичников и контрольной группы

Полученные нами результаты гласят: выявлена ассоциация полиморфного варианта -174 G>C гена IL6 с риском развития рака яичников у женщин из Республики Башкортостан (CG: OR=1.6, 95% CI 1.1-2.3, p=0.007; GG: OR=0,7, 95% CI 0.5-1, p=0.04).

Использованные источники:

1. Каприн А.Д., Старинский В.В., Петрова Г.В. Злокачественные новообразования в России в 2016 году (заболеваемость и смертность) □ М.: МНИОИ им. П.А. Герцена □ филиал ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России, 2018. 250 с.

2. Любченко Л.Н., Батенева Е.И. Медико-генетическое консультирование и ДНК-диагностика при наследственной предрасположенности к раку молочной железы и раку яичников. Пособие для врачей. М.: ИГ РОНЦ, 2014. 64 с.

3. Новикова Е.И. Снигирева Г.П. Секвенирование «нового поколения» (NGS): применение для молекулярно-генетических исследований в онкологии. Журнал Вестник Российского научного центра рентгенорадиологии Минздрава России 2016

4. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/announcements/2015/

5. Маринюк А. С. Роль маркеров экстрацеллюлярных везикул в диагностике рака яичников //Sciences of Europe. - 2017. - №. 14-1. - С. 64-69.

6.Balkwill F. Cancer and the chemokine network. Nat Rev Cancer. 2004 Jul; 4 (7): 540-50. doi: 10.1038/nrc1388

7. Fidler IJ. The organ microenvironvent and cancer metastasis. Differentiation. 2002 Dec; 70 (9-10): 498-505.

8. Lewis CE, Pollard JW. Distinct role of macrophages in different tumor microenvirontments. Cancer Res. 2006 Jan 15; 66 (2): 605-12.

9. Бережная Н. М., Чехун В. Ф. Иммунология злокачественного роста. К.:

Наукова Думка; 2005. 792 с.

УДК 61.618.11

Шаяхметова А.К. студент магистратуры биологический факультет Прокофьева Д.С., к.биол.н.

доцент

кафедра «Генетики и фундаментальной медицины»

Мингажева Э. Т. аспирант

кафедра «Генетики и фундаментальной медицины» Башкирский государственный университет Хуснутдинова Э.К., доктор биологических наук

профессор

Институт биохимии и генетики Уфимский научный центр Российской академии наук Россия, Республика Башкортостан, г. Уфа АНАЛИЗ ВКЛАДА ИЗМЕНЕНИЯ НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ДНК C.C4366T ГЕНА MYH14 РАЗВИТИИ РАКА ЯИЧНИКОВ В РЕСПУБЛИКЕ БАШКОРТОСТАН Аннотация: Злокачественные новообразования занимают второе место по смертности, уступая только сердечнососудистым заболеваниям. К большему числу смертей в год, чем любой другой рак репродуктивной системы, приводит рак яичников (РЯ). В России ежегодно диагностируют более 14000 новых случаев заболевания, половина из которых имеют смертельный исходом[1]. Не более 15% всех случаев РЯ можно объяснить нарушениями в генах BRCA1/2, большая часть патологии вызвана изменениями в других генах[2]. Поиск и идентификация новых генов-кандидатов РЯ будет способствовать ранней диагностики заболевания и созданию персонифицированной терапии[3]. Важнейшим геном-кандидатом выступает ген MYH14. Нарушение C.C4366T (p.Q1456X) в гене MYH14 было впервые выявлено при экзомном секвенировании; высокий уровень этого белка был обнаружен при различных злокачественных новообразованиях, в том числе при карциноме яичников[4,5]. Нами был проведен поиск ранее неизвестного варианта c.C4366T гена MYH14 у женщин из Республики Башкортостан. В результате было установлено, что вариант p.Q1456X в гене MYH14 встречается с низкой частотой (0,4%) только у больных раком яичников.

Ключевые слова: рак яичников, секвенирование нового поколения, ген MYH14, риск развития рака яичников, частота встречаемости.

Shayakhmetova A.K. graduate student of the Faculty of Biology

Bashkir State University