Научная статья на тему 'Анализ методов обработки интерферометрических данных в спектральной оптической когерентной томографии'

Анализ методов обработки интерферометрических данных в спектральной оптической когерентной томографии Текст научной статьи по специальности «Компьютерные и информационные науки»

CC BY
248
73
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ОПТИЧЕСКАЯ КОГЕРЕНТНАЯ ТОМОГРАФИЯ / OPTICAL COHERENCE TOMOGRAPHY / МЕТОД ЛОГАРИФМИЧЕСКОГО ПРЕОБРАЗОВАНИЯ / LOGARITHMIC TRANSFORMATION METHOD

Аннотация научной статьи по компьютерным и информационным наукам, автор научной работы — Гуров Игорь Петрович, Киракозов Александр Христофорович

Выполнен сравнительный анализ двух методов восстановления томографических изображений в спектральной оптической когерентной томографии: стандартного метода, основанного на обратном преобразовании Фурье, и метода логарифмического преобразования. Показаны преимущества метода логарифмического преобразования, заключающиеся в получении изображений более высокого качества за счет устранения искажений, вносимых сопутствующими неинформативными составляющими интерферометрических сигналов в спектральной оптической когерентной томографии.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по компьютерным и информационным наукам , автор научной работы — Гуров Игорь Петрович, Киракозов Александр Христофорович

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

ANALYSIS OF INTERFEROMETER DATA PROCESSING METHODS IN SPECTRAL OPTICAL COHERENCE TOMOGRAPHY

Comparative analysis is performed applied to the two methods of tomography images reconstruction in spectral optical coherence tomography: conventional method based on inverse Fourier transformation and logarithmic transformation method. Advantages of the logarithmic transformation method are shown expressed in obtaining images of higher quality due to elimination of distortions introduced by accompanying non-informative components of interferometer signals in spectral optical coherence tomography.

Текст научной работы на тему «Анализ методов обработки интерферометрических данных в спектральной оптической когерентной томографии»

2

ФОТОНИКА И ОПТОИНФОРМАТИКА

УДК 535.8, 57.087, 681.787

АНАЛИЗ МЕТОДОВ ОБРАБОТКИ ИНТЕРФЕРОМЕТРИЧЕСКИХ ДАННЫХ В СПЕКТРАЛЬНОЙ ОПТИЧЕСКОЙ КОГЕРЕНТНОЙ

ТОМОГРАФИИ И.П. Гуров, А.Х. Киракозов

Выполнен сравнительный анализ двух методов восстановления томографических изображений в спектральной оптической когерентной томографии: стандартного метода, основанного на обратном преобразовании Фурье, и метода логарифмического преобразования. Показаны преимущества метода логарифмического преобразования, заключающиеся в получении изображений более высокого качества за счет устранения искажений, вносимых сопутствующими неинформативными составляющими интерферометрических сигналов в спектральной оптической когерентной томографии. Ключевые слова: оптическая когерентная томография, метод логарифмического преобразования.

Введение

Исследования внутренней микроструктуры различных объектов неразрушающими методами имеют важное значение для биомедицины и материаловедения. В последние годы получили активное развитие методы оптической когерентной томографии (ОКТ) [1, 2], обеспечивающие наиболее высокое разрешение (в настоящее время - до долей микрометра) при восстановлении томографических изображений, которые представляют трехмерную внутреннюю микроструктуру неоднородных сред на глубине проникновения оптического излучения со значительным диффузным рассеянием.

Основной частью систем ОКТ является двухлучевой интерферометр с освещением от источника излучения с широким спектром. Расстояние до внутреннего слоя исследуемого объекта определяется оптической разностью хода между предметной и опорной волнами в интерферометре. Как известно, в оптическом интерферометре регистрируется суммарная интенсивность предметной и опорной волн, поэтому информация об исследуемом объекте, заключенная в амплитуде и фазе отраженной предметной волны, доступна в «закодированном» виде в поле интерференции, и для извлечения полезной информации требуется обработка интерферометрических данных.

Существуют два основных вида методов ОКТ, определяемых особенностями получения и обработки данных: во временной области и в спектральной области. При реализации методов ОКТ во временной области сканирование объекта по глубине осуществляется при помощи управляемого механического перемещения опорного отражателя и регистрации значений огибающей интерферометрического сигнала при условии нулевой разности хода в интерферометре, характеризующих степень отражения излучения по глубине исследуемой среды. В ОКТ в спектральной области нет необходимости в перемещении опорного отражателя, поскольку требуемые данные регистрируются и извлекаются вычислительными методами одновременно для всех слоев среды, что является существенным преимуществом для повышения быстродействия систем ОКТ.

В последующих разделах работы рассмотрены особенности методов формирования и обработки данных в ОКТ в спектральной области (спектральной ОКТ), которые обеспечивают восстановление томографических изображений внутренней микроструктуры многослойных и случайно-неоднородных сред.

Метод обратного преобразования Фурье

В спектральной интерферометрии регистрируют интерферометрические сигналы, пропорциональ-

ные значениям интенсивности [3]

I (к) = О(к)

, ехр(-у' 2кг) +1 а( г) ехр{-у 2к[г + п( г) г ] }&

(1)

где О (к) - спектр источника излучения; аК - амплитуда опорной волны; ' = >/-1; к = 2п / X - волновое число, определяемое длиной волны X; 2г - оптическая длина пути опорной волны; а(г) - амплитуда предметной волны, отраженной на глубине г в исследуемом образце в диапазоне глубин Ь; п(г) - изменение показателя преломления по глубине среды. Полезная информация содержится в значениях а(г), характеризующих степень отражения предметной волны по глубине исследуемой среды, которые необходимо определить в результате обработки полученных значений I (к). В результате нормировки выражения (1) относительно спектра источника излучения и в предположении отсутствия дисперсии в среде (т.е. п( г) = 1) интерферометрический сигнал в спектральной ОКТ определяется в области волновых чисел формулой

2

АНАЛИЗ МЕТОДОВ ОБРАБОТКИ ИНТЕРФЕРОМЕТРИЧЕСКИХ ДАННЫХ...

S (k) =

1 + J a( z) exp(- jkz)dz

(2)

Стандартный метод вычисления искомой амплитуды предметной волны a(z) состоит в применении обратного преобразования Фурье к значениям S (k). Обозначим через A(k) интеграл под модулем в выражении (2). В результате разложения A(k) на вещественную и мнимую части, A(k) = х + jy, получим

S(k) =|1 + A(k) |2 =|1 + х + jy |2 = 1 + 2х + х2 + у2 =

= 1 + (х2 + у2) + (х + jy) + (х - jy) = 1+1 A(k) |2 + A(k) + A* (k), где A*(k) - комплексно сопряженная величина. Применив обратное преобразование Фурье к выражению (3), получим

s(z) = S(z) + raa(z) +a(z) + a(-z), (4)

где 5(z) - дельта-функция; a(z) - искомая функция распределения коэффициента отражения по глубине; a(-z) - ее зеркальное (мнимое) отображение; raa (z) - автокорреляционная функция распределения коэффициента отражения по глубине среды. Из (4) видно, что применение метода преобразования Фурье к данным вида (2) требует рассмотрения трех сопутствующих компонентов в сигнале s( z), помимо искомой функции a(z).

Первое слагаемое в (4) легко устраняется, поскольку дельта-функция 5(z) имеет ненулевое значение только при z = 0, поэтому следует использовать значения s(z) при z > 0. При правильной настройке томографа, когда начало оси координат соответствует значению z = 0 на границе (поверхности) образца, слагаемые a(z) и a(-z) можно разделить так, что a(z) относится к положительной области оси координат (внутри образца), а a(-z) - к отрицательной области. Таким образом, следует использовать только полезные значения на положительной полуоси при z > 0, тем самым устранив неинформативные значения a(-z) на отрицательной полуоси. Однако оставшееся автокорреляционное слагаемое, raa (z), в (4) может вносить существенные искажения в получаемое томографическое изображение.

Метод логарифмического преобразования

В работе [4] рассматривается новый метод обработки данных в спектральной ОКТ, который учитывает тот факт, что амплитуда предметной волны, отраженной от объекта, обычно намного меньше, чем амплитуда опорной волны. В спектральной области с учетом выражения (2) это соответствует условию | A(k) |<< 1, Vk . При этом, взяв логарифм от обеих частей в выражении (2), получим

log(S(k)) = log(1 + A(k)) + log(1 + A* (k)) = A(k) + O(A2 (k)) + A*(k) + O(A*2 (k)), (5)

где O(-) обозначает малую величину. Вследствие того, что область определения функции a(z) находится на положительной полуоси координаты z, величины A(k) и A" (k) для n = 2 в правой части выражения (5) обладают каузальной инверсией, соответствующей известному принципу причинности. Симметричным образом, A*(k) и A*" (k) обладают антикаузальной инверсией. Это означает, что метод логарифмического преобразования позволяет разделить сигнал на каузальную и антикаузальную части и выделить полезную каузальную часть. Таким образом, чтобы найти величину log(1 + A(k)) в (5), необходимо вначале применить к левой части этого выражения обратное преобразование Фурье и, как рассмотрено выше, обнулить часть, относящуюся к отрицательной области оси координат (z < 0), и затем выполнить прямое преобразование Фурье. После операции потенцирования, вычитания единицы и повторного обратного преобразования Фурье получаем искомую функцию a( z) без сопутствующих ложных составляющих в (4).

Метод логарифмического преобразования в форме вычислительного псевдокода представлен ниже. Алгоритм принимает на вход значения сигнала S(k) и обеспечивает восстановление функции a(z) методом логарифмического преобразования.

Алгоритм. Восстановление томограмм методом логарифмического преобразования.

Дано: Массив значений интенсивности S.

1: for z = 0..length(S)-1

2: logSz <- log(Sz)

3: invLogS <- IFFT(logS)

4: for z = length(S)/2..length(S)-1

5: invLogSz <- 0

2

6: logA <- FFT(invLogS) 7: for z = 0..length(logA)-1 8: Az <- exp(logAz)-1 9: r <- IFFT(A) 10: return Re(r)

В строках 1-3 вычисляется логарифм от значений сигнала S, после чего применяется обратное преобразование Фурье. Согласно (5), это позволяет разделить сигнал на две независимые части. В строках 4-5 часть, принадлежащая отрицательной области оси координат, отбрасывается. Для получения величины log(1 + A(k)) применяется прямое преобразование Фурье (строка 6). Далее, чтобы восстановить исходный сигнал, необходимо провести комплексное потенцирование (строки 7-8) и еще раз применить обратное преобразование Фурье (строка 9). В строке 10 получаем действительную часть сигнала, соответствующую искомой функции a(z).

Сравнение методов обработки данных в спектральной ОКТ

Для демонстрации преимуществ метода логарифмического преобразования вначале был использован модельный сигнал, определяемый выражениями

a( z) = e [3 cos( z / 7) + cos( z /9)], z = 0,...,511;

a(z) = 0, z = 512,...,1023, (6)

где e - коэффициент масштабирования, позволяющий изменять величину сигнала. Отметим, что сигнал (6) каузален, т.е. соответствует принципу причинности, поскольку его значения в области отрицательных значений независимой переменной z (соответствующей значениям части дискретной последовательности z = 512,...,1023 ) равны нулю.

На рис. 1 приведены зависимости среднего квадратического отклонения (СКО) восстановленных значений сигнала от модельных как функции от коэффициента масштабирования e. Значения СКО выражены в единицах 8-битного представления данных (256 уровней). Из графиков видно, что влияние автокорреляционного слагаемого raa (z) в (4) приводит к квадратичному возрастанию СКО стандартного метода обратного преобразования Фурье при увеличении параметра e, тогда как СКО метода логарифмического преобразования возрастает линейно.

8

Рис. 1. Значения СКО восстановленных сигналов: ♦ - метод преобразования Фурье; ■ - метод логарифмического преобразования

а б в

Рис. 2. Исходная томограмма свиной кожи (а), томограмма, восстановленная методом обратного преобразования Фурье (б) и томограмма, восстановленная методом логарифмического преобразования (в). Формат изображений 334x256 пикселей

Метод логарифмического преобразования был исследован также применительно к двумерным сигналам в ОКТ. В качестве тестового образца была взята томограмма свиной кожи [5] (рис. 2, а).

ВОССТАНОВЛЕНИЕ ИЗОБРАЖЕНИЯ С ЦИФРОВОЙ ФУРЬЕ-ГОЛОГРАММЫ

Для каждого столбца данных в томограмме в соответствии с формулой (2) вычисляли значения сигнала спектральной интерференции S(k). После этого независимо для каждого столбца восстанавливали функцию a( z ) методом обратного преобразования Фурье и методом логарифмического преобразования. На рис. 2 иллюстрируются полученные результаты. Из рисунков видно, что использование метода обратного преобразования Фурье приводит к значительным искажениям восстановленного изображения. Метод логарифмического преобразования позволяет устранить влияние ложных составляющих в (4) и восстановить исходную томограмму с существенно более высоким качеством. Отличия в яркости изображений (рис. 2, а, в) обусловлены нелинейностью логарифмического преобразования и не снижают информативности томограмм.

Заключение

В работе проведен сравнительный анализ двух методов восстановления томографических изображений в спектральной ОКТ: стандартного метода, основанного на обратном преобразовании Фурье, и метода логарифмического преобразования. Приведенные результаты демонстрируют, что при больших значениях исходного сигнала автокорреляционные артефакты, присутствующие в стандартном методе, ведут к существенным искажениям восстановленного изображения, тогда как метод логарифмического преобразования позволяет устранить искажения и повысить качество восстановленных томограмм в спектральной ОКТ. Следует отметить, что повышение качества изображений достигается за счет более высокой вычислительной сложности алгоритма обработки интерферометрических данных, поскольку в методе логарифмического преобразования используются три операции преобразования Фурье. Повышение вычислительной мощности современных компьютерных систем позволяет преодолеть указанный недостаток и обеспечивает возможность использования метода логарифмического преобразования в практических разработках систем спектральной ОКТ.

Работа выполнена при финансовой поддержке Министерства образования и науки Российской Федерации.

Литература

1. Гуров И.П. Оптическая когерентная томография: принципы, проблемы и перспективы II Проблемы когерентной и нелинейной оптики I Под ред. И.П. Гурова и С.А. Козлова. - СПб: СПбГУ ИТМО, 2004. - С. б-З0.

2. Tomlins P.H., Wang R.K. Theory, developments and applications of optical coherence tomography II J. Phys. D: Appl. Phys. - 2005. - V. З8. - P. 2519-25З5.

3. Häusler G., Lindner M.V. «Coherence radar» and «Spectral radar» - new tools for dermatogical diagnostics II J. Biomed. Opt. - 1998. - V. З. - P. 21-З1.

4. Sekhar S.C., Leitgeb R.A., Bachmann A.H., Unser M. Logarithmic transformation technique for exact signal recovery in frequency-domain optical-coherence tomography II Proc. SPIE. - 2007. - V. бб27. - P. бб2714-1.

5. Boer J., Srinivas S., Malekafzali A., Chen Z., Nelson J. Imaging thermally damaged tissue by polarization sensitive optical coherence tomography II Optics Express. - 1998. - V. З. - № б. - P. 212-218.

Гуров Игорь Петрович - Санкт-Петербургский национальный исследовательский университет

информационных технологий, механики и оптики, доктор технических наук, профессор, зав. кафедрой, gurov@mail.ifmo.ru Киракозов Александр Христофорович - Санкт-Петербургский национальный исследовательский университет

информационных технологий, механики и оптики, аспирант, kirakozov@rain.ifmo.ru

УДК 535.417 + 681.787

ВОССТАНОВЛЕНИЕ ИЗОБРАЖЕНИЯ С ЦИФРОВОЙ ФУРЬЕ-ГОЛОГРАММЫ В УСЛОВИЯХ ПРЕВЫШЕНИЯ ЧАСТОТЫ НАЙКВИСТА К. А. Гребенюк, А. А. Гребенюк, В.П. Рябухо

Проведено экспериментальное исследование особенностей регистрации цифровых безлинзовых внеосевых Фурье-голограмм в условиях превышения несущей частотой голограммной структуры частоты Найквиста. Показано, что превышение несущей частотой голограммной структуры частоты Найквиста ведет не к исчезновению изображения, а к постепенному уменьшению его интенсивности, что свидетельствует о снижении дифракционной эффективности голограммы. Ключевые слова: цифровая голография, Фурье-голограмма, голограммная структура, пространственный спектр, частота Найквиста.

Введение

Цифровые оптические методы, основанные на принципе внеосевой голографии, находят широкое применение при анализе динамических фазовых объектов, в первую очередь, объектов медико-биологических исследований in vivo [1-5]. Одно из основных ограничений этих методов связано с отно-

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.