CC BY
19
Оригинальные статьи |
Original Articles
https://doi.org/10.31631/2073-3046-2022-21-6-59-64
Актуальные серотипы Streptococcus pneumonia, циркулировавшиe на территории Свердловской области в 2020-2021 годах
Е. В. Болгарова*1, Ю. А. Захарова1, И. С. Мухачев2, И. А. Короткова1, И. А. Иващенко1, А. В. Остапчук1, О. И. Мамонтов2
1 Екатеринбургский НИИ вирусных инфекций ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора, г. Екатеринбург, Россия
2 ФГКУ «1026 Центр государственного санитарно-эпидемиологического надзора» Минобороны России, г. Екатеринбург, Россия
Резюме
Актуальность. Изучение распространения отдельных серотипов S. pneumoniae имеет важное эпидемиологическое и клиническое значение. Особую актуальность в аспекте данной проблемы имеет Свердловская область, где 20% внебольничной пневмонии (ВП) вызывает S. pneumoniae и до 70% ВП заканчивается летальным исходом. Цель. Изучить особенности сероти-пового пейзажа S. pneumoniae среди невакцинированных детей (от 0 до 5 лет) и вакцинированных взрослых (от 19 до 27лет). Материалы и методы. В эпидемиологическом наблюдательном описательно-оценочном исследовании анализировались данные, полученные при исследовании носоглоточных мазков, взятых в двух группах наблюдения: невакцинированные дети в возрасте от 0 до 5 лет с диагнозом «острая респираторная инфекция (ОРИ)» - 159 человек и вакцинированные взрослые в возрасте от 19 до 27 лет с диагнозом «практически здоров» - 392. Методом мультиплексной ПЦР выполнено молекуляр-но-генетическое типирование 20 распространённых серотипов/серогрупп S. рneumoniae (1, 2, 3, 4, 5, 14, 16F, 19A, 19F, 23A, 23F, 6ABCD, 7AF, 9AV, 9LN, 11AD, 15AF, 18ABCF, 22AF, 12FAB/44/46, 33AF/37). Результаты и обсуждение. У 27,0% и 28,1% лиц изучаемых групп наблюдения установлено присутствие в биологическом материале 12 серотипов S. pneumoniae: вакцинных - 19F - 2,6%, 6ABCD - 2,6%, 4 - 2,0%, 23F - 2,0%, 9AV - 1,3%, 9LN - 0,6%, 11AD - 1,3%, 18ABCF - 2,0% и невакцинных - 15AF - 0,7%, 16F - 0,6%. В структуре доминировали нетипируемые штаммы с наибольшей долей (77,3%) среди взрослого иммунизированного населения и 53,5% среди невакцинированных детей. Среди типируемых штаммов, выявленных у детей,70,0% относились к вакцинным (чаще определяли серотипы 19F и 23F), среди взрослых преобладали 3 и 12F/A/B/44/46. Заключение. На примере детского неиммунизированного и взрослого иммунизированного населения Свердловской области подтверждена тенденция роста циркуляции на территории РФ нетипируемых штаммов S. pneumoniae, что делает актуальными задачи по совершенствованию мониторинга и оптимизации молекулярно-генетических методов идентификации возбудителя с целью дальнейшей разработки современных средств специфической и неспецифической профилактики, включая современные антимикробные средства и отечественную вакцину.
Ключевые слова: Streptococcus рneumoniae, серотипы/серогруппы, мониторинг циркуляции, Свердловская область Конфликт интересов не заявлен.
Для цитирования: Болгарова Е. В., Захарова Ю. А., Мухачев И. С. и др. Актуальные серотипы Streptococcus pneumonia, циркулировавшиe на территории Свердловской области в 2020-2021 годах. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2022;21(6):59-64 https://doi:10.31631/2073-3046-2022-21-6-59-64_
Current Streptococcus Pneumoniae Serotypes in Sverdlovsk Region in 2020-2021
EV Bolgarova*1, YuA Zakharova1, IS Mukhachev2, IA Korotkova1, IA Ivashchenko1, AV Ostapchuk1, OI Mamontov2
1 Ekaterinburg Research Institute of Viral Infections, Federal Budgetary Research Institution «State Research Center of Virology and Biotechnology «Vector», Rospotrebnadzor (Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Well-Being), Ekaterinburg, Russia
2 Federal State-Owned Enterprise «1026 Center of State Sanitary and Epidemiological control», Ministry of Defense of the Russian Federation, Ekaterinburg, Russia
* Для переписки: Болгарова Екатерина Викторовна, научный сотрудник Екатеринбургского НИИ вирусных инфекций ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора, 620030, г. Екатеринбург, ул. Летняя, 23. +7(912) 208-59-02, bolgarova_ev@eniivi.ru. ©Болгарова Е. В. и др. ** Ekaterina V. Bolgarova, researcher, laboratory of respiratory viral infections, Ekaterinburg Research Institute of Viral Infections, Federal Budgetary Research Institution «State Research Center of Virology and Biotechnology «Vector», Rospotrebnadzor, Ekaterinburg, Russia. +7 (912) 208-59-02, bolgarova_ev@eniivi.ru.
ЩИ Оригинальные статьи
Original Articles
Abstract
Relevance. Studying the spread of individual S. pneumoniae serotypes is of special epidemiologic and clinical importance. Sverdlovsk Region with the 20% proportion of community-acquired pneumonia and its proportion among the causes of mortality of up to 70% is of special concern. Aims. Studying the features of the S. pneumoniae serotype landscape in individual socially significant population groups in Sverdlovsk Region in 2020 and 2021. Materials and methods. The work presents the results of testing nasopharyngeal smears collected in two observation groups, namely, that of 159 unvaccinated children aged 0 to 5 with acute respiratory infections (ARI), and that of 392 apparently healthy adults aged 19 to 27. We performed molecular genetic typing for identification of 20 leading S. pneumoniae serotypes/serogroups (1, 2, 3, 4, 5, 14, 16F, 19A, 19F, 23A, 23F, 6ABCD, 7AF, 9AV, 9LN, 11AD, 15AF, 18ABCF, 22AF, 12FAB/44/46, 33AF/37) using multiplex polymerase chain reaction (PCR). Results and discussion. In the individuals of the studied groups of observation, in 27.0% and 28.1% of the cases the study detected the S. pneumoniae in the biological material with circulation of 12 «vaccine»(19F - 2,6%, 6ABCD - 2,6%, 4 - 2,0%, 23F - 2,0%, 9AV - 1,3%, 9LN - 0,6%, 11AD - 1,3%, 18ABCF - 2,0%) and «nonvaccine» (15AF - 0.7%, 16F - 0.6%) serotypes. Nontypable strains with the highest proportion (77.3%) among the immunized adult population were predominant in the structure; in the unvaccinated children, this rate was 53.5%. Among the typable strains in children, 70.0% belonged to the vaccine ones, and most frequently the study identified 19F and 23F serotypes, while serotypes 3 and 12F/A/B/44/46 dominated among the adults. Conclusion. The study of unimmunized pediatric and immunized adult populations of Sverdlovsk Region confirmed a trend toward an increase in the circulation of nontypable S. pneumoniae strains in the Russian Federation, which sets the agenda to improve the monitoring system and optimize molecular genetic techniques for identification of the pathogens and upgrade the present specific and nonspecific preventive remedies, including the current antimicrobial ones and locally-produced vaccine. Keywords: Streptococcus pneumoniae, serotypes/serogroups, monitoring of circulation, Sverdlovsk Region No conflict of interest to declare.
For citation: Bolgarova EV, Zakharova YuA, Mukhachev IS et al. Current Streptococcus Pneumoniae Serotypes in Sverdlovsk Region in 2020-2021. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2022;21(6): 59-64 (In Russ.). https://doi:10.31631/2073-3046-2022-21-6-59-64
Введение
Несмотря на наличие эффективных вакцин, пневмококковая инфекция остается актуальной медицинской проблемой в силу серотипового разнообразия пневмококков [1,2]. Более 90 се-ротипов S. pneumoniae идентифицировано по биохимической структуре капсульного полисахарида, что свидетельствует о высокой пластичности и ре-комбинантной изменчивости его генома, приводящей на фоне неконтролируемого использования антимикробных средств к формированию устойчивости. Учитывая, что капсула является основным фактором вирулентности возбудителя, серотипи-рование по капсульному полисахариду необходимо не только для внутривидовой идентификации, но для определения тяжести инфекционного процесса [3,4]. Известно, что распространение актуальных серотипов S. pneumoniae на определённых территориях и в отдельных группах населения зависит от возраста, практики применения антибактериальной терапии, клинических проявлений инфекции, демографических характеристик региона, охвата населения вакцинацией, штаммого состава вакцин [5,6]. Результаты исследований, проведённых в разных странах, свидетельствуют, что более 80% наиболее тяжёлых инвазивных случаев пневмококковой инфекции, как правило, обусловлены 20 серотипами, в их числе 13 вызывают до 70-75% случаев манифестных форм. Повышенной устойчивостью к основным классам антибиотиков характеризуются представители се-ротипов 23, 19 и 6 [4,7]. Наиболее часто инвазив-ные формы у детей до 5 лет вызывают серотипы
4, 6, 9, 14, 18, 19 и 23, в остальных возрастных группах преобладают 4, 6, 9, 12, 14, 19 и 23 [4,8,9].
Ряд серотипов S. pneumoniae (6АВ, 9V, 14, 18АС, 19A F и 23F) приводят к тяжёлому течению заболевания, серотипы 1, 7F, 8, 4 и 5 - не осложнённому [10]. При этом штаммы, отнесённые к вариантам 6B, 9V, 14, 19A, 19F и 23F, обладают устойчивостью к антибиотикам, что снижает эффективность традиционной этиотропной терапии. Особого внимания заслуживает информация о циркуляции в РФ серотипов 19F, 14, 9VA, 15 AF, 6 ABCD, 3 и 23F [11-14], часть из них не представлена в современных вакцинах (15 AFC; 6 CD; 9A).
Не вызывает сомнений факт, что вакцинация позволяет существенно снизить заболеваемость от пневмококковой инфекции детей раннего возраста (до 3 лет) и лиц старшей возрастной группы (после 65 лет) [15]. Однако, несмотря на значительные успехи, достигнутые в ходе иммунизации, на отдельных территориях возникают новые угрозы, связанные с колонизацией локусов организма человека невакцинными и безкапсульными вариантами
5. pneumoniae [4]. Особую актуальность в аспекте изучения проблемы имеет Свердловская область, где на долю внебольничных пневмоний в структуре инфекционной заболеваемости (без учета гриппа и острых респираторных инфекций) приходится до 20%, а среди причин смерти - до 70% [12].
Цель работы - изучить особенности серотипового пейзажа S. pneumoniae, циркулирующих в Свердловской области среди не вакцинированных детей (от 0 до 5 лет) и вакцинированных взрослых (от 19 до 27 лет).
Оригинальные статьи
Original Articles
Материалы и методы
В 2020-2021 гг. в Свердловской области в ходе эпидемиологического наблюдательного описательно-оценочного исследовании проведено изучение циркуляции S. pneumoniae в двух группах населения. Обследовано 551 человек, включая 159 детей (первая группа) в возрасте от 0 до 5 лет, находившихся на госпитализации в медицинских организациях г. Екатеринбурга с диагнозом «острая респираторная инфекция (ОРИ)» и 392 взрослых (вторая группа) в возрасте от 19 до 27 лет из организованных коллективов с диагнозом «практически здоров». Все обследованные лица (в случае детского населения их официальные представители) дали письменное информированное согласие на участие в исследовании, прошли анкетирование, в ходе которого установлено, что в первой группе (дети с диагнозом ОРИ) полностью отсутствовала вакцинация от пневмококковой инфекции, во второй группе (взрослые с диагнозом «практически здоров») показатель иммунизации, напротив, составил 100%, использовалась вакцина Пневмовакс 23.
Забор биоматериала (носоглоточные мазки) осуществляли при поступлении детей в стационар в процессе медицинского осмотра, у взрослых - при проведении плановой диспансеризации. Образцы биологического материала после взятия помещали в коммерческие транспортные системы с жидкой питательной средой Амиеса (Deltalab, Испания). Тотальную ДНК выделяли из транспортной среды с использованием набора ДНК-Сорб или «РИБО-преп» (ФБУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва) в соответствии с инструкцией изготовителя.
Для подтверждения присутствия генетического материала (нуклеотидных последовательностей) S. pneumoniae в биологической пробе проводили
детекцию видоспецифических генов cpsA (протеин, участвующий в биосинтезе полисахаридовов капсулы) и lytA (ген вирулентности, кодирующий фермент аутолизин) методом ПЦР. Серотипирование S. pneumoniae методом капсульного ПЦР-типирования включало использование специфической комплексной панели (ФГБУ ДНКЦ ИБ ФМБА, Санкт-Петербург), включающей детекцию 20 ведущих серотипов/серогрупп 1, 2, 3, 4, 5, 14, 16F, 19A, 19F, 23A, 23F, 6ABCD, 7AF, 9AV, 9LN, 11AD, 15AF, 18ABCF, 22AF, 12FAB/44/46, 33AF/37.
Статистическую обработку результатов осуществляли с использованием методов описательной статистики Microsoft Excel и STATISTICA 12.0 (StatSoft, США) и определением 95% доверительного интервала по методу Клоппера-Пирсона (точный метод) [95%ДИ]. Различия считали значимыми при р < 0,05.
Результаты и обсуждение
При исследовании проб носоглоточных смывов, отобранных у 551 человек, входящих в обе группы наблюдения, ДНК S. pneumoniae была обнаружена в 153 образцах, что составило 27,8%. Только в 29,4% положительных проб (n = 153), удалось определить серотип S. pneumoniae (n = 45), возможной причиной было наличие в образцах ДНК се-ротипов, не включенных в диагностическую панель, присутствие бескапсульных или дефектных штаммов. Всего идентифицировано 12 серотипов/серогрупп S. pneumoniae. Наибольшую долю в структуре имели серотип 3 (7,8%) и серогруппа 12F/A/44/46 (5,9%). Были выявлены вакцинные» (19F - 2,6%, 6ABCD - 2,6%, 4-2,0%, 23F - 2,0%, 9AV - 1,3%, 9LN - 0,6%, 11AD - 1,3%, 18ABCF - 2,0%) и «не вакцинные» серотипы (15AF - 0,7%, 16F - 0,6%).
Полученные результаты свидетельствуют об увеличении доли нетипируемых штаммов S. pneumoniae,
Рисунок 1. Серотипы Streptococcus pneumoniae, выделенные у невакцинированных детей Свердловской области с диагнозом острая респираторная инфекция, % (2020-2021 гг.)
Figure 1. Streptococcus pneumoniae serotypes isolated in unvaccinated children with acute respiratory infections in Sverdlovsk Region, % (2020-2021)
4,7%
4,7%
53,5% V
4,7%
2,3% 2,3%
9,3%
3 (ПВК13, ППВ23)
4 (ПВК13, ППВ23)
6 ABCD (ПВК13, ППВ23) 11AD(ППВ23)
15 AF (н/в)
18 ABCF (ПВК13, ППВ23) 19F (ПВК13, ППВ23) 23 F (ПВК13, ППВ23)
16 F (н/в) 9L/N (ППВ23)
12F/A/B/ (ППВ23) 44/46 (н/в) нетипирован
Оригинальные статьи
Original Articles
циркулирующих в 2020-2021 гг. на территории Свердловской области относительно 2006-2016 гг. (70,6% против 12,8%, р < 0,05), где, по данным ранее проведённых исследований, в группах детского и взрослого населения отмечены наиболее актуальные и значимые в этиологии серотипы 14 (14,7%), 6ABCD (17,3%), 15A/F (13,3%) и 19F (9,3%) [12]. Таким образом, за период наблюдения произошла смена серотипового пейзажа S. pneumoniae. В динамике существенно утратили свои основные позиции серо-типы 6A/B/C/D (2,6%) и 19F (2,6%), ранее суммарно занимавшие 26,6%, а серотип 14, активно циркулировавший на территории Свердловской области в предшествующий период (14,7%), в 2020-2021 гг. не был выявлен.
В первой группе, включавшей невакци-нированных детей с диагнозом ОРИ (n = 43), S. pneumoniae был обнаружен у 27,0% обследованных. Среди выявленных S. pneumoniae 46,5% (n = 20) принадлежали к 11 серотипам [ДИ 95%: 31,2-61,9] (рис. 1).
Ведущие ранговые места заняли серотипы 19F (9,3%) и 23F (7,0%). По данным научной литературы известно, что оба ассоциированы с лекарственной устойчивостью, чаще других вызывают инвазивные формы болезни [4,12,15,16].
При сопоставлении серотипов, входящих в состав 13-валентной конъюгированной пневмококковой вакцины (чаще используемой при иммунизации детского населения) и серотипов S. pneumoniae, циркулирующих в первой группе, установлено 70,0% соответствие (таб. 1).
Таким образом, среди невакцинированных детей с диагнозом ОРИ доминировали серотипы, входящие в состав пневмококковой вакцины.
Во второй группе (вакцинированные взрослые с диагнозом «практически здоров») из 392 проб S. pneumoniae выявлен в 28,1% случаев (n = 110), из них только в 22,7% [ДИ 95%: 14,9-30,6] определена серотиповая принадлежность (n = 25) (рис. 2).
Наибольший удельный вес имел серотип 3 -9,1%, второй по значимости была серогруппа 12F/A/B/44/46 - 7,3%.
Установлено полное (100%) совпадение серотипов Streptococcus pneumoniae, выделенных во второй группе, с серотипами, входящими в состав 23-валентной коньюгированной полисахаридной пневмококковой вакцины (табл. 2).
Таким образом, во второй группе наблюдалось полное перекрытие выделенных серотипов вакцинными штаммами.
Проведённое исследование позволило установить существенные изменения в серотиповом пейзаже Streptococcus pneumoniae в 2020-2021 гг. по сравнению с 2006-2016 гг. в двух группах населения (невакцинированные дети с диагнозом ОРИ и вакцинированные взрослые с диагнозом «практически здоров»). В структуре выделенных серотипов Streptococcus pneumoniae доминировали нетипиру-емые штаммы (70,6% против 12,8%, p < 0,05), сменились отдельные представители (с серогрупп 14, 6А/В/С^, 15A/F и 19F на 3 и 12F/A/44/46), часть серотипов утратили свою актуальность (6A/B/C/D и 19F) или исчезли совсем (14).
Заключение
Анализ серотиповой структуры S. pneumoniae в двух группах наблюдения позволил прийти к заключению о существенном и достоверно значимом (р < 0,001) преобладании среди взрослого
Таблица 1. Соответствие серотипого пейзажа Streptococcus pneumoniae в составе 13-валентной конъюгированной пневмококковой вакцины и Streptococcus pneumoniae от невакцинированных детей Свердловской области с диагнозом острая респираторная инфекция, % (2020-2021 гг.) Table 1. Concordance between Streptococcus pneumoniae serotype landscape as part of 13-valent conjugated pneumococcal vaccine and Streptococcus pneumoniae from unvaccinated children with acute respiratory infections in Sverdlovsk Region, % (2020-2021)
Серотипы S. Pneumoniae Serotypes of S. pneumoniae
и т
Конъюгированная пневмококковая вакцина Conjugated pneumococcal vaccine - со ю со го со го со сч не вакцинные nc vaccinated % перекрываемое % overlap
Серотипы у детей с ОРИ, абс (%)
ON %) %) ) %) %) %) %
О о о % s о ю о со о о"
со CD
13-валентная
вакцина 13-valent vaccine + + + + + + + + + + +
Оригинальные статьи |
Original Articles
Рисунок 2. Серотипы Streptococcus pneumoniae, выделенные у взрослых лиц из организованных коллективов Свердловской области с диагнозом «практически здоров», % (2020-2021 гг.)
Figure 2. Streptococcus pneumoniae serotypes isolated in apparently healthy adults from organized groups in Sverdlovsk Region, % (2020-2021)
9,1%
3 (ПВК1З, ППВ2З)
4 (ПВК1З, ППВ2З)
6 ABCD (ПВК1З, ППВ2З) 9V/9A (ПВК1З, ППВ2З)
■ 18 ABCF (ПВК1З, ППВ2З)
■ 12F/A/B/ (ППВ2З) 44/46 (н/в) нетипирован
Таблица 2. Соответствие серотипого пейзажа Streptococcus pneumoniae в составе 23-валентной конъюгированной полисахаридной пневмококковой вакцины и Streptococcus pneumoniae от иммунизированных взрослых лиц из организованных коллективов Свердловской области с диагнозом «практически здоров», % (2020-2021 гг.)
Table 2. Concordance between Streptococcus pneumoniae serotype landscape as part of 23-valent conjugated polysaccharide pneumococcal vaccine and Streptococcus pneumoniae from apparently healthy immunized adults from organized groups in Sverdlovsk Region, % (2020-2021) )
Полисахаридная пневмококковая вакцина
Polysaccharide pneumococcal
Серотипы S. Pneumoniae Serotypes of S. pneumoniae
о тз 3 Ф
12
о о X с
Серотипы у взрослых, абс (%)
0)
p
й ™
е р
е
23-валентная вакцина 23-valent vaccine
иммунизированного населения нетипируемых штаммов 77,3% [ДИ 95%: 69,4 - 85,2]. Среди детского населения отмечался более широкий спектр серотипов (11 против 6) с преобладанием вариантов 19F (9,3%) и 23F (7,0%), у взрослых выделялся серотип 3 (9,1%) и серогруппа ^/А/В/44/46 (7,3%). Известно, что «детские» серотипы 19 и 23 до введения вакцинации от пневмококковой инфекции имели одни из самых высоких показателей встречаемости среди населения, вызывали инвазивные формы заболевания [18]. В изучаемой
группе взрослого населения их циркуляцию мы не наблюдали.
Большинство серотипов S. pneumoniae, обнаруженных у непривитых детей, соответствовали вакцинным штаммам (3, 4, 19F, 23F, 6ABCD, 9LN, 11AD, 18ABCF, 12FAB/44/46), что свидетельствует об эффективности рекомендуемых к использованию современных вакцин. Однако заслуживает особого внимания факт выделения у невакциниро-ванных детей серотипов, отсутствующих в составе пневмококковых вакцин (15AF, 16F).
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
ЩИ Оригинальные статьи
Original Articles
Таким образом, на фоне массовой вакцинопро-филактики от пневмококковой инфекции, прогнозируемый рост циркуляции в человеческой популяции серотипов S. pneumoniae, не входящих в состав и не определяемых современными лабораторными методами, делает актуальными задачи по совершенствованию мониторинга за серотиповым пейзажем S. рпеитотае, на территориях с высокой заболеваемостью и в группах риска населения (эпидемиологический компонент надзора), оптимизации и расширению мультиплексного серотипиро-вания возбудителя с внедрением новых методов микробиологической и молекулярно-биологической
диагностики (лабораторный компонент надзора). На основе полученных данных и эффективной организации эпидемиологического надзора за пневмококковой инфекцией разработка эффективных методов специфической и неспецифической профилактики, включая современные антимикробные средства и отечественную пневмококковую вакцину, позволит существенно снизить циркуляцию актуальных клинических изолятов S. pneumoniae, общую заболеваемость и тяжелые инвазивные формы инфекции.
Работа выполнена за счет гранта Российского научного фонда (проект № 22-25-20129).
Литература
1. Баранов А. А., Брико Н. И., Намазова-Баранова Л.С. и др. Стрептококки и пневмококки: Руководство для врачей. М.: Феникс; 2013.
2. Ceyhan M., Ozsurekci Y., Gürler N., et al. Serotype distribution of Streptococcus pneumoniae in children 102 with invasive diseases in Turkey: 2008-2014 // Human Vaccines Immunotherapeutics. 2016. Vol. 12, N2. P. 308-313.
3. Messaoudi M., Milenkov M., Albrich W.C., et al. The Relevance of a Novel Quantitative Assay to Detect up to 40 Major Streptococcus pneumoniae Serotypes Directly in Clinical Nasopharyngeal and Blood Specimens // PLoS ONE 2016. Vol. 11, N3.
4. Зарипова А. З., БаязитоваЛ. Т., Тюпкина О. Ф. и др. Фенотипические и генотипические свойства Streptococcus pneumoniae при бактерионосительстве// Практическая медицина. 2018. Т. 16, №9. С. 106-112.
5. Feldman C., Anderson R. Epidemiology, virulence factors and management of the pneumococcus. F1000Research. 2016. Vol. 5.2320.
6. Зайцев А. А., Акимкин В. Г., Брико Н. И. Вакцинопрофилактика пневмококковых инфекций: в фокусе взрослые из организованных коллективов //Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2018. №4. С.72-81.
7. Протасова И. Н., Бахарева Н.В., Перьянова О.В., и др. Смена серотипов Streptococcus pneumoniae у детей, вакцинированных 7-валентной конъюгированной вакциной. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2014. №5 (78). С. 67-71.
8. Намазова-Баранова Л. С., Федосеенко М. В., Вишнёва Е. А. и др. Теоретические основы и реальные результаты: обзор материалов по вакцинопрофилактике пневмококковой инфекции в мире // Педиатрическая фармакология. 2018. Т. 15, №1. С. 58-74.
9. Брико Н. И., Коршунов В. А., Ломоносов К. С. Пневмококковая инфекция в Российской Федерации: состояние проблемы. Вестник РАМН. 2021. Т.76, №1. С. 28-42.
10. Белошицкий Г. В., Королева И. С. Серотиповой пейзаж пневмококков, выделенных при пневмококковом менингите, в Российской Федерации //Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2015. №2 (81). С. 19-25. Козлов Р. С., Чагарян А. Н., Козлова Л. В. и др. Серологическая характеристика и чувствительность к антибиотикам пневмококков, выделенных у детей в возрасте до 5 лет в отдельных регионах Российской Федерации //Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2001. Т. 13, №2, С.177-187.
12. Голубкова А. А., Сомова А. В. Роль Streptococcus pneumoniae в этиологии внебольничных пневмоний в крупном промышленном регионе Российской Федерации. Тихоокеанский медицинский журнал. 2018. № 3. С. 29-33.
13. van Gils E.J., Veenhoven R.H., Hak E., et al. Pneumococcal conjugate vaccination and nasopharyngeal acquisition of pneumococcal serotype 19A strains //JAMA. 2010. Vol. 304, N10. P. 1099-1106.
14. Reinert R.R. The antimicrobial resistance profile of Streptococcus pneumoniae // Clin Microbiol Infect. 2009. Vol. 15, Suppl. 3. Р. 7-11.
15. Фельдблюм И. В., Семериков В. В., Голоднова С. О. и др. Результаты серотипирования Str. pneumoniae, циркулирующих на территории г. Перми //Здоровье семьи - 21 век. 2013. Т. 2. №2. С. 200-210. Hausdorff W.P., Bryant J., Paradiso P.R., Siber G.R. Which pneumococcal serogroups cause the most invasive diseases: implications for conjugate vaccine formulation and use Clin Infect Dis 2000. Vol. 30, N1. Р. 100-121. Маянский Н. А., Алябьева Н. М., Лазарева А. В. и др. Серотиповое разнообразие и резистентность пневмококков. Вестник Российской академии медицинских наук. 2014. Т.69, №7-8. С. 38-45. Hausdorff WP, Feikin DR, Klugman KP Epidemiological differences among pneumococcal serotypes. Lancet Infect Dis 2005. Vol. 5. P. 83-93.
References
1. Baranov A.A, Briko N.I., Namazova-Baranova L.S., et al. Streptococci andpneumococci: Manual for doctors. Moscow: Feniks; 2013 (In Russ).
2. Ceyhan M., Ozsurekci Y., Gürler N., et al. Serotype distribution of Streptococcus pneumoniae in children 102 with invasive diseases in Turkey: 2008-2014. Human Vaccines Immunotherapeutics. 2016. Vol. 12, N2. P. 308-313. doi: 10.1080/21645515.2015.1078952
3. Messaoudi M., Milenkov M., Albrich WC., et al. The Relevance of a Novel Quantitative Assay to Detect up to 40 Major Streptococcus pneumoniae Serotypes Directly in Clinical Nasopharyngeal and Blood Specimens. PLoS ONE. 2016. Vol. 11, N3.DOI:10.1371/journal.pone.0151428
4. Zaripova A.Z., Bayazitova L.T., Tyupkina O.F., et al. Fenotipicheskiye I genotipicheskiye svoistva Streptococcus pneumoniae pri bakterionositel'stve. Prakticheskaya meditsina. 2018;16 (9):106-112 (In Russ).
5. Feldman C., Anderson R. Epidemiology, virulence factors and management of the pneumococcus. F1000Research. 2016. Vol. 5.2320. DOI:10.12688/f1000research.9283.1
6. ZaytsevA.A., Akimkin V.G., Briko N.I. Vaktsinoprofilaktikaphevmokokkovyh infektsiy: v fokuse vzrosliye is organizovannyh kollektivov. Epidemiologija I infektsionniye bolezni. Aktual'niye voprosy. 2018; (4):72-81 (In Russ). DOI: https//dx.doi.org/10.18565/epidem.2018.4.72-81
7. Protasova I.N., Bahareva N.V., Per'yanova O.V., et al. Smena serotipov Streptococcus pneumoniae u detey, vaktsinirovannyh 7-valentnoi konjugirovannoy vaktsinoy. Epidemioligiya I vaktsinoprofilaktika; 2014. No. 5 (78). P. 67-71. (In Russ).
8. Namazova-Baranova L.S., Fedoseienko M.V, Vishneva E.A., et al. Teoreticheskiye osnovy i real'niye rezul'taty: obzor materialov po vaktsinoprofilaktike pnevmokokkovoy infektsiyi v mire. Pediatricheskaya farmakologiya. 2018;15(1):58-74 (In Russ). doi: 10.15690/pf.v15i1.1844
9. Briko N.I., Korshunov V.A., LomonosovK.S. Pneumokokkovaya infektsiya vRossiyskoiFederatsiyi: sostoyaniyeproblemy. Vestnik RAMN. 2021; 76(1):28-42 (In Russ). doi: https://doi.org/10.15690/vramn1404 Beloshitskiy G.V., Korolyova I.S. Serotipovoy peizazh pnevmokokkov, vydelennyh pri pnevmokokkovom meningite, v Rossiiskoy Federatsiyi. Epidemioligija I vaktsinoprofilaktika;. 2015. No.2 (81). P. 19-25 (In Russ). KozlovR.S, Chagarian AN., Kozlova L.V., et al. Serologitcheskaya haraktersistika I chuvstvilel'nost k antibiotikam pnevmokokkov, vydelennyh u detey vvozraste do 5 let v otdel'nyh regionah Rossiiskoy Federatsii. Klinicheskaya mikrobioligiya I antimikrobnaya himioterapiya. 2001; 13(2):177-187 (In Russ).
12. Golubkova A.A., Somova A.V. Rol'Streptococcus pneumoniae v etiologii vnebol'nychnyh pnevmoniy v krupnom promyshlennom regione Rossiiskoy Federatsiyi. Tihookeanskiy meditsinskiy zhurnal. 2018. No 3. P 29-33 (In Russ).
13. van Gils E.J., Veenhoven R.H., Hak E, et al. Pneumococcal conjugate vaccination and nasopharyngeal acquisition of pneumococcal serotype 19A strains. JAMA. 2010. Vol. 304, N10. P. 1099-106. DOI:10.1001/jama.2010.1290
14. Reinert R.R. The antimicrobial resistance profile of Streptococcus pneumoniae. Clin Microbiol Infect. 2009. Vol. 15, Suppl. 3. Р. 7-11. DOI:10.1111/j.1469-0691.2009.02724.x
15. Feldblum I.V., Semerikov V.V., Golodnova S.O., et al. Rezultaty serotipirovaniya Str. Pneumoniae, tsirkuliruyushchih na territoriyi g. Permi. Zdorov'ye sem'yi -21 vek. 2013;2(2):200-210 (In Russ). Hausdorff W.P., Bryant J., Paradiso P.R., Siber G.R. Which pneumococcal serogroups cause the most invasive diseases: implications for conjugate vaccine formulation and use. Clin Infect Dis 2000. Vol. 30, N1. Р. 100-121. DOI:10.1086/313608
Mayanskiy N.A., Alyab'yeva N.M., Lazareva A.V., et al. Serotipovoye raznoobraziye Ireziztentnost' pnevmokokkov. Vestnik Rossiyskoy akademiyi meditsinskih nauk. 2014;69 (7-8):38-45 (In Russ). Hausdorff WP, Feikin DR, Klugman KP. Epidemiological differences among pneumococcal serotypes. Lancet Infect Dis 2005. Vol. 5. P. 83-93. DOI 10.1016/S1473-3099(05)70083-9
Об авторах
* Екатерина Викторовна Болгарова - научный сотрудник лаборатории респираторных вирусных инфекций, Екатеринбургского НИИ вирусных инфекций ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора, Екатеринбург, Россия. +7 (912) 208-59-02, bolgarova_ev@eniivi.ru. ОРСЮ: https://orcid.org/0000-0001-6140-2546.
* Юлия Александровна Захарова - д. м. н, заместитель руководителя по научной работе, главный научный сотрудникЕкатеринбургского НИИ вирусных инфекций ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора, Екатеринбург, Россия. +7 (912) 643-50-60, zakharova_ya@eniivi.ru. ОРСЮ: https://orcid.org/0000-0003-3416-0902.
* Иван Семенович Мухачев - начальник центра, Федеральное государственное казенное учреждение «1026 Центр государственного санитарно-эпидемиологического надзора» Министерства обороны Российской Федерации, Екатеринбург, Россия. +7 (912) 260-61-31, faust.78@ mail.ru. ОРСЮ https://orcid.org/0000-0003-2669-7144.
* Инна Александровна Короткова - младший научный сотрудник лаборатории респираторных вирусных инфекций, Екатеринбургского НИИ вирусных инфекций ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора, Екатеринбург, Россия. +7 (914) 463-49-10, korotkova_ia@eniivi.ru. ОРСЮ: https://orcid.org/0000-0002-5074-7925.
* Иван Александрович Иващенко - старший лаборант лаборатории клеточных культур, Екатеринбургский Екатеринбургского НИИ вирусных инфекций ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора, Екатеринбург, Россия. +7 (922) 100-46-90, chizzarp@mail.ru. ОРСЮ https://orcid.org/0000-0002-3584-9528.
* Анна Владимировна Остапчук - младший научный сотрудник, Екатеринбургского НИИ вирусных инфекций ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора, Екатеринбург, Россия. +7 (982) 773-16-96, ostapchuk_av@eniivi.ru. ОРСЮ https://orcid.org/0000-0002-8157-6866.
* Олег Игоревич Мамонтов - начальник отдела, Федеральное государственное казенное учреждение «1026 Центр государственного санитарно-эпидемиологического надзора» Министерства обороны Российской Федерации, Екатеринбург, Россия. +7 (982) 735-24-25, evildoctor47@mail.ru.
Поступила: 13.07.2022. Принята к печати: 14.10.2022.
Контент доступен под лицензией СС БУ 4.0.
About the Authors
• Ekaterina V. Bolgarova - researcher, laboratory of respiratory viral infections, Ekaterinburg Research Institute of Viral Infections, Federal Budgetary Research Institution «State Research Center of Virology and Biotechnology «Vector», Rospotrebnadzor (Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Well-Being), Ekaterinburg, Russia. +7 (912) 208-59-02, bolga-rova_ev@eniivi.ru. ORCID: https://orcid.org/0000-0001-6140-2546.
• Yulia A. Zakharova - Dr. Sci. (Med.), deputy Head of Scientific work, head researcher, Ekaterinburg Research Institute of Viral Infections, Federal Budgetary Research Institution «State Research Center of Virology and Biotechnology «Vector», Rospotrebnadzor (Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Well-Being), Ekaterinburg, Russia. +7 (912) 643-50-60, zakha-rova_ya@eniivi.ru. ORCID: https://orcid.org/0000-0003-3416-0902.
• Ivan S. Mukhachev - head of the center, Federal State-Owned Enterprise «1026 Center of State Sanitary and Epidemiological control», Ministry of Defense of the Russian Federation, Ekaterinburg, Russia. +7 (912) 260-61-31, faust.78@mail.ru. ORCID https://orcid.org/0000-0003-2669-7144.
• Korotkova Inna A. - junior researcher, laboratory of respiratory viral infections, Ekaterinburg Research Institute of Viral Infections, Federal Budgetary Research Institution «State Research Center of Virology and Biotechnology «Vector», Rospotrebnadzor (Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Well-Being), Ekaterinburg, Russia. +7 (914) 463-49-10, korotkova_ia@eniivi.ru. ORCID: https://orcid.org/0000-0002-5074-7925.
• Ivan A. Ivashchenko - senior technician, cell culture laboratory, Ekaterinburg Research Institute of Viral Infections, Federal Budgetary Research Institution «State Research Center of Virology and Biotechnology «Vector», Rospotrebnadzor (Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Well-Being), Ekaterinburg, Russia. +7 (922) 100-46-90, chizzarp@mail.ru. ORCID https://orcid.org/0000-0002-3584-9528.
• Anna V. Ostapchuk - junior researcher, Ekaterinburg Research Institute of Viral Infections, Federal Budgetary Research Institution «State Research Center of Virology and Biotechnology «Vector», Rospotrebnadzor (Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and HumanWell-Being), Ekaterinburg, Russia. +7 (982) 773-16-96,ostapchuk_av@eniivi.ru. ORCID https://orcid.org/0000-0002-8157-6866.
• Oleg I. Mamontov - department head, Federal State-Owned Enterprise «1026 Center of State Sanitary and Epidemiological control», Ministry of Defense of the Russian Federation, Ekaterinburg, Russia. +7 (982) 735-24-25, evildoctor47@mail.ru.
Received: 13.07.2022. Accepted: 14.10.2022.
Creative Commons Attribution CC BY 4.0.
