CC BY
100
НЕПРЕРЫВНОЕ МЕДИЦИНСКОЕ ОБРАЗОВАНИЕ
Актуальные подходы к анализу вирусных геномов в интересах биобезопасности
Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Национальный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. акад. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России, Москва, Россия ФГБУ «48 Центральный научно-исследовательский институт» Минобороны России, Сергиев Посад, Московская область, Россия
В обзоре приведены современные представления об основных угрозах, связанных с появлением вирусных патогенов человека в контексте проблемы «новых и возвращающихся» инфекций. На примере вируса оспы, вирусов гриппа и некоторых арбовирусов представлены возможности использования современных методов геномного анализа для изучения их эволюции и мониторинга.
Ключевые слова:
новые и возвращающиеся инфекции, оспа, грипп, технологии секвенирования нового поколения
Для цитирования: Львов Д.К., Борисевич С.В., Альховский С.В., Бурцева Е.И. Актуальные подходы к анализу вирусных геномов в интересах биобезопасности // Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2019. Т. 8, № 2. С. 96-101. сЫ: 10.24411/2305-3496-2019-12012.
Статья поступила в редакцию 11.10.2018. Принята в печать 25.03.2019.
Relevant approaches to analysis of viral genomes for biosafety Lvov D.K.1, Borisevich S.V.2, 1 D.I. Ivanovsky Institute of Virology of N.F. Gamaleya National Center Alkhovsky S.V.1, Burtseva E.I.1 for Epidemiology and Microbiology, Moscow, Russia 2 48 Central Scientific Research Institute, Sergiev Possad, Moscow Region, Russia
The review summarizes the current understanding of the basic threats posed by the emergence of new human viral pathogens, in the context of emerging and re-emerging infections. On the example of the smallpox virus, influenza virus and some arboviruses the review presents the new possibility of using modern genomic approaches to study viral evolution and circulation.
Keywords: emerging and reemerging infections, smallpox, influenza, next-generation sequencing For citation: Lvov D.K., Borisevich S.V., Alkhovsky S.V., Burtseva E.I. Relevant approaches to analysis of viral genomes for biosafety. Infektsionnye bolezni: novosti, mneniya, obuchenie [Infectious Diseases: News, Opinions, Training]. 2019; 8 (2): 96-101. doi: 10.24411/2305-3496-2019-12012. (in Russian) Received 11.10.2018. Accepted 25.03.2019.
Львов Д.К.1, Борисевич С.В.2, Альховский С.В.1, Бурцева Е.И.1
i
2
Особую угрозу национальной и глобальной биологической безопасности представляют «новые и вновь возвращающиеся» инфекции. Они могут возникать в результате природных катаклизмов или террористических (биотерроризм) действий, непредсказуемы и способны вызывать чрезвычайные ситуации (ЧС), борьба с которыми на этапе их возникновения трудна или невозможна. Эти ситуа-
ции возникают в мире все чаще и становятся все более грозными [1, 2]. Одним из важных блоков проблемы является биотерроризм. Использование биологических агентов с террористическими целями может иметь различные сценарии. Некоторые из них, с точки зрения террористов, достаточно просты, дешевы и эффективны [3]. С самого начала возникновения ЧС применение новых методов геномного
анализа, основанных на технологии секвенирования следующего поколения (NGS, next generation sequencing), можно без выделения биологического агента определить и проанализировать его генетические свойства. Это дает реальную возможность установить природу эпидемической ситуации и составить план по минимизации последствий или ее ликвидации.
По крайней мере 2 возбудителя с аспирационным механизмом передачи могут в обозримом будущем поставить на колени цивилизацию - это вирусы оспы и гриппа. Практически все известные инфекционные болезни людей были интродуцированы из популяций диких животных в популяции домашних животных, а затем и людей. Процесс продолжается и в наше время [4]. Существенное значение в формировании природных очагов вирусов имеют грызуны, птицы и летучие мыши. Грызуны, например, - основной резервуар различных видов ортопоксвирусов (см. таблицу). Их природные очаги расположены на огромной территории - от тропических пустынь до субарктической тундры. Эволюционные процессы, протекающие в этих экосистемах, теоретически могут привести к формированию новых, патогенных для человека вариантов вирусов, как это по крайней мере трижды происходило в прошлом. Использование вируса оспы террористами, по мнению американских аналитиков, сравнимо по ущербу с взрывом водородной бомбы [5-7]. Контагиозность вируса оспы достигает 60% при воздушно-капельном пути передачи. Очевидно, что подобный ход эволюции зоонозных ортопоксвирусов нельзя исключить в будущем, с постепенным переходом вируса от диких животных к домашним, а затем к человеку [8, 9]. Тревогу вызывают участившиеся в последние годы массовые вспышки оспы обезьян среди людей в Африке.
Исследования показали, что природным резервуаром вируса являются грызуны - по крайней мере 4 вида белок в Западной и Центральной Африке. У этих животных установлено носительство при бессимптомном течении инфекции [9-14]. В последние годы в Бразилии, Индии, Пакистане вспышки, вызываемые зоонозными осповирусами, связанными с грызунами, регистрируют среди домашних животных и контактирующих с ними людей [15-18]. В незаселенной Ловозерской тундре Кольского полуострова от полевки-экономки М1'сгоШ овсопотиБ был изолирован осповирус Мурман [19]. Всего на основе секвенирования генома вирусологами выявлено 11 видов ортопоксвирусов, циркулирующих в Африке, Азии и Америке.
По расчету специалистов Новосибирского ФГУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора, сделанному по анализу скорости накопления мутаций в геноме, разделение поксвирусов из вируса-прародителя началось около 500 тыс. лет назад. Расчеты показали, что эволюционно близкие к вирусу натуральной оспы виды оспы верблюдов и африканских голола-пых песчанок (ТаЬега) выделились из единого предка около 4 тыс. лет назад [9, 20-23]. Все это определяет возможность выплеска вируса в население на фоне практического отсутствия коллективного иммунитета [8, 9]. Это обосновывает необходимость разработок противооспенной вакцины IV поколения, иммуноглобулинов и эффективных и безопасных химиопрепаратов, например ингибирующих вирусную ДНК-полимеразу производных цитозина [8, 9, 20-22].
Особенно опасны вирусы с высокой степенью изменчивости генома - в первую очередь вирусы семейства 0гМотухоУ1'пс1ае. Вирусы гриппа А, В и С передаются в ходе
Вирусы семейства Poxviridae
Подсемейство Род Число видов Хозяева
Entomopoxvirinae (осповирусы 3 рода 31 Насекомые беспозвоночных)
Chordopoxvirinae (осповирусы позвоночных) Avipoxvirus 10 Птицы (>250 видов)
Capripoxvirus 3 Овцы, крупный рогатый скот
Centapoxvirus 1 -
Cervidpoxvirus 1 Олени
Crocodylidpoxvirus 1 -
Leporipoxvirus 4 Зайцеобразные, белки (грызуны)
Molluscipoxvirus 1 Человек, лошади, обезьяны
Orthopoxvirus Camel poxvirus Cowpox virus Ectromelia poxvirus Monkeypox virus Racconpox virus Skunkpox virus Teteropox virus Vaccinia poxvirus Variolapox virus Volepox virus Животные, человек Животные, человек Грызуны Животные, человек Еноты Скунсы Грызуны Животные, человек Человек Грызуны
Parapoxvirus 4 Верблюды, крупный рогатый скот, олени, тюлени
Suipoxvirus 1 Свиньи
Yatapoxvirus 2 Обезьяны
Неклассифицированные 4 Дельфины, тюлени, кенгуру, белки, обезьяны и др.
реализации аспирационного механизма, а также через воду и корм, вызывая ежегодные вспышки и эпидемии среди людей, диких и домашних животных.
Вирусы родов Thogotovirus и Quaranjavirus, которые обнаружены и на территории России, передаются восприимчивым позвоночным животным и человеку при присасывании иксодовых и аргасовых клещей.
Вирусы рода Isavirus инфицируют рыб [24-26]. Наибольшее медицинское значение имеют вирусы гриппа А (род Influenzavirus A). Геном вируса гриппа А содержит 8 сегментов, что создает условия для рекомбинаций и реассортаций (обмена генов) в случае одновременной репликации в одной клетке двух и более вирусов. Возникающие рекомбинанты, обеспечивая высокую степень изменчивости, могут иметь различные биологические и антигенные свойства, что помогает им преодолевать защитные клеточные системы хозяина и обеспечивает в ряде случаев возникновение панзоотий и пандемий [27]. Вирусы гриппа А широко распространены в биосфере, по последним данным, даже в океанском планктоне. В ходе исследования, проведенного в Северной Евразии, была выявлена циркуляция среди птиц 15 из 18 известных субтипов вирусов гриппа А, в том числе субтипа Н5 [27].
В 2003 г. возникла интенсивная эпизоотия, а затем панзоотия среди домашних птиц. Погибли и были уничтожены сотни миллионов птиц в 8 странах Юго-Восточной Азии и Океании. Зарегистрированы случаи заражения и гибели людей. В апреле 2005 г. на озере Кукунор, в провинции Цинхай КНР, в северо-восточной части Тибетского плато вспыхнула эпизоотия среди диких птиц. Во время весеннего перелета птиц вирусные штаммы начали распространяться на север, вдоль Джунгарского миграционного русла, между Тянь-Шанем и Монгольским Алтаем, связывающего Юго-Восточную Азию со Средней Азией и западной Сибирью. Западно-сибирские высокопатогенные штаммы гриппа птиц формируют достаточно компактную генетическую Цинхай-Сибирскую группу 2.2 [27].
В начале апреля 2008 г. вирус гриппа птиц с мигрирующими птицами проник на территорию юга Приморского края, распространившись далее на север. С появлением Уссурийского клайда в Северной Евразии сформировалась генетическая стратификация: Цинхай-Сибирский кластер (2.2) -в западном, Уссурийский (2.3.2.1) - в восточном секторе Северной Евразии [27]. Летальность при заболевании, обусловленном вирусом гриппа птиц А субтипа H5N1, остается очень высокой (до 60%). Это выше, чем при натуральной оспе.
Инфекционный процесс при заражении вирусом гриппа начинается с прикрепления его к клеточному рецептору -производному сиаловой кислоты. Она присоединена к галактозе или глюкозамину а2-3- или а2-6-связью, которая опознается вирусами гриппа в зависимости от хозяйской принадлежности. Вирусы гриппа человека инфицируют клетки, на которых представлены а2-6-рецепторы, расположенные на слизистой оболочке носоглотки. Содержание этих рецепторов постепенно убывает в ряду: носоглотка, трахея, бронхи, бронхиолы. а2-3-рецепторы выявлены на брон-хиолярных и альвеолярных клетках с убыванием вверх по респираторному тракту, а у птиц - на клетках эпителия кишечника [27, 28].
Новый пандемический вирус гриппа А субтипа HlNlpdm09, который появился в 2009 г., является реассортантом двух свиных вирусов гриппа А американского и евроазиатского генотипов. У данного субтипа изменена рецепторная специфичность, в результате чего он приобрел способность инфицировать клетки, несущие а2-6-рецепторы. В результате вирус гриппа А субтипа HlNlpdm09 приобрел способность инфицировать и распространяться среди людей [27, 28]. Повышенная вирулентность субтипа HlNlpdm09 также связана с мутацией в рецептор-связывающем сайте гемагглю-тинина - с заменой аспарагиновой кислоты на глицин или аспарагин [27]. Вирус в этом случае меняет рецепторную специфичность с а2-6 на а2-3 и приобретает способность к поражению нижних отделов респираторного тракта, вызывая пневмонию с летальным исходом.
Генетическая экспертиза вирусов гриппа, выделенных из легких более чем l00 пациентов с летальным исходом, показала наличие мутантных по рецептор-связывающему сайту форм вируса HlNlpdm09 не только в легочной ткани, но и в бронхах или трахее у 70% умерших пациентов. Нужно отметить, что все погибшие пациенты были невакциниро-ванными и они не получали противовирусные препаратов на ранних сроках болезни [27, 29].
Наибольшее число госпитализаций и летальных случаев от гриппа было зарегистрировано в эпидемическом сезоне 20l5-20l6 гг., в котором абсолютно доминировал вирус HlNlpdm09. Последние 2 сезона доминировали вирусы гриппа А H3N2 и вирус гриппа В, что при существенном охвате населения прививками обусловило меньшую интенсивность эпидемического процесса.
С февраля 20l3 г., т.е. в начале сезона весенней миграции птиц, в Китае была выявлена заболеваемость людей, этиологически связанная с вирусом птичьего гриппа A субтипа H7N9. На середину сентября 20l8 г. лабораторно были подтверждены l567 случаев заражения людей с 40% летальностью [30]. Вирус появился в результате реассортации вирусов гриппа А диких птиц. По оценкам, местом возникновения реассортанта могло стать озеро Тайху на границе провинций Чжэцзян, Цзянсу и Шанхай в КНР, которое представляет собой один их крупнейших «перекрестков» миграционных потоков диких птиц.
Этот вирус был занесен на территорию России дикими птицами с образованием природных очагов инфекции. Результаты экспериментов in vitro, проведенных в НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского, показали, что вирус был резистентен к римантадину и чувствителен к осельтамивиру и рибавирину. Далее вирус проник в Америку с перелетными птицами из Сибири.
Таким образом, учитывая выявленные тенденции, необходимо заблаговременное изготовление кандидатов вакцинных штаммов для использования при будущих пандемиях. К настоящему времени в мире уже сконструировано около 20 вакцинных штаммов ко всем известным генетическим клайдам вируса Н5 и другим зоонозным вирусам гриппа [30, 3l].
Сравнение механизмов развития двух вирусных эпизо-отий в Северной Америке, вызванных вирусами Западного Нила и вирусом гриппа птиц, указывает на схожесть их при-
родных процессов. Вирус птичьего гриппа А был занесен мигрирующими птицами из Азиатской тундры на Тихоокеанское побережье Америки, а затем по миграционным руслам за 2-3 года проник в Центральную и Восточную часть континента. Вирус Западного Нила попал на территорию США из Южной Европы, вероятно, с зараженными комарами в трюмах кораблей. После попадания на Атлантическое побережье Америки вирус Западного Нила адаптировался к местным видам синантропных и диких птиц и комаров-переносчиков, затем по миграционным руслам за 3-4 года освоил практически весь континент [27].
В классической вирусологии существуют 2 важных этапа -это изоляция вируса на модельной системе (лабораторные животные или культура клеток) и его дальнейшая идентификация. Если вирус не способен культивироваться на используемой модели, он невидимым для исследователя. С другой стороны, вирусы, в отличие от клеточных организмов, не имеют универсальных генов, поэтому анализ геномов новых и дивергентных вирусов представляет собой нетривиальную задачу.
Метагеномный подход, основанный на технологии сек-венирования нового поколения и дальнейшем биоинформационном анализе, предоставляет новые возможности для быстрой идентификации уже изолированных вирусов и для поиска новых вирусов непосредственно в пробах тканей животных или человека. С использованием этого подхода было проведено изучение генетических характеристик, эволюции и таксономии более чем 80 зоонозных вирусов, изолированных в результате многолетнего мониторинга в разных экосистемах Северной Евразии.
Результаты этой работы показали, что на территории Северной Евразии циркулируют зоонозные вирусы, принадле-
жащие как минимум к 17 родам и 8 семействам, что изложено в англоязычной монографии, вышедшей в 2015 г. в издательстве «Elsevier Academic Press». Описаны геномы широко распространенных передаваемых комарами ортобуньявирусов комплекса калифорнийского энцефалита. Летние спорадические случаи и вспышки ОРЗ-подобных заболеваний, пневмоний, менингитов чаще всего связаны с этими вирусами. В результате филогенетического анализа выделенных штаммов выявлены новые виды наировирусов, включая связанный с летучими мышами наировирус Иссык-Кульской лихорадки.
Технологии секвенирования нового поколения дают возможность анализировать всю совокупность вирусов, ассоциированных с определенным позвоночным хозяином или переносчиком (виром). Эти исследования показывают, что вирусное разнообразие намного больше, чем представлялось ранее. Например, в членистоногих переносчиках выявляют множество новых вирусов, в том числе имеющих патогенный для человека потенциал. Таким образом, метагеномное сек-венирование дает возможность быстро идентифицировать новые или дивергентные вирусы, определять возможный источник появления новых зоонозных инфекций, анализировать структуру вирома животных с целью контроля изменений в его структуре, которые приводят к появлению новых патогенов, проводить геномный анализ дивергентных штаммов для усовершенствования молекулярных методов диагностики. Эти методы могут служить универсальным инструментом для диагностики вирусных инфекций непосредственно в клинических образцах.
Конфликт интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
СВЕДЕНИЯ ОБ АВТОРАХ
Львов Дмитрий Константинович (Lvov Dmitriy K.) - академик РАН, доктор медицинских наук, профессор, заведующий отделом экологии вирусов с научно-практическим центром по экологии и эпидемиологии гриппа ФГБУ «Национальный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. акад. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России, Москва, Россия E-mail: [email protected] https://orcid.org/0000-0001-8176-6582
Борисевич Сергей Владимирович (Borisevich Sergey V.) - член-корреспондент РАН, доктор биологических наук, начальник ФГБУ «48 Центральный научно-исследовательский институт» Минобороны России, Москва, Россия E-mail: [email protected] https://orcid.org/0000-0002-6742-3919
Альховский Сергей Владимирович (Alkhovsky Sergey V.) - доктор биологических наук, заведующий лабораторией биотехнологии ФГБУ «Национальный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. акад. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России, Москва, Россия E-mail: [email protected]
https://orcid.org/0000-0001-6913-5841
Бурцева Елена Ивановна (Burtseva Elena I.) - доктор медицинских наук, заведующая лабораторией этиологии и эпидемиологии гриппа ФГБУ «Национальный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. акад. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России, Москва, Россия E-mail: [email protected]
ЛИТЕРАТУРА
1. Львов Д.К. Значение вновь возникающих инфекций и 2. Emerging Viruses. New York : Oxford University Press. 1993.
биобезопасности // Вопр. вирусологии. 2002. № 5. С. 4-7. Vol. xxiii. 317 p.
3. Kaufmann A.F., Meltzer M.I., Schmid G.P. The economic impact of a bioterrorist attack: are prevention and postattack intervention programs justifiable? // Emerg. Infect. Dis. 1997. Vol. 3, N 2. P. 83-94.
4. Львов Д.К. Экология вирусов // Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных / под ред. Д.К. Львова. М. : МИА, 2013. С. 66-86.
5. Goodman R.A., Bauman C.F., Gregg M.B., Videtto J.F. et al. Epidemiologic field investigations by the Centers for Disease control and Epidemic Intelligence Service, 1946-87 // Public Health Rep. 1990. Vol. 105, N 6. P. 604-610.
6. Langmuir A.D. The Epidemic Intelligence Service of the Center for Disease Control // Public Health Rep. 1980. Vol. 95, N 5. P. 470-477.
7. Langmuir A.D., Andrews J.M. Biological warfare defense. 2. The Epidemic Intelligence Service of the Communicable Disease Center // Am. J. Public Health Nations Health. 1952. Vol. 42, N 3. P. 235-238.
8. Львов Д.К., Зверев В.В., Гинцбург А.Л. Натуральная оспа - дремлющий вулкан // Вопр. вирусологии. 2008. Т. 53, № 4. С. 4-8.
9. Щелкунов С.Н. Возможен ли возврат оспы // Молекул. мед. 2011. № 4. С. 36-41.
10. Львов Д.К. Оспа обезьян // Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных / под ред. Д.К. Львова. М. : МИА, 2013. С. 670-671.
11. Di Giulio D.B., Eckburg P.B. Human monkeypox // Lancet Infect. Dis. 2004. Vol. 4, N 4. P. 199.
12. Formenty P., Muntasir M.O., Damon I., Chowdhary V. et al. Human monkeypox outbreak caused by novel virus belonging to Congo Basin clade, Sudan, 2005 // Emerg. Infect. Dis. 2010. Vol. 16, N 10. P. 1539-1545.
13. Rimoin A.W., Mulembakani P.M., Johnston S.C., Lloyd Smith J.O. et al. Major increase in human monkeypox incidence 30 years after smallpox vaccination campaigns cease in the Democratic Republic of Congo // Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2010. Vol. 107, N 37. P. 16 262-16 267.
14. Tesh R.B., Watts D.M., Sbrana E., Siirin M. et al. Experimental infection of ground squirrels (Spermophilus tridecemlineatus) with monkeypox virus // Emerg. Infect. Dis. 2004. Vol. 10, N 9. P. 1563-1567.
15. Kapil S., Yeary T., Evermann J.F. Viral diseases of new world camelids // Vet. Clin. North Am. Food Anim. Pract. 2009. Vol. 25, N 2. P. 323-337.
16. Medaglia M.L., Pessoa L.C., Sales E.R., Freitas T.R. et al. Spread of cantagalo virus to northern Brazil // Emerg. Infect. Dis. 2009. Vol. 15, N 7. P. 1142-1143.
17. Schulze C., Alex M., Schirrmeier H., Hlinak A. et al. Generalized fatal Cowpox virus infection in a cat with transmission to a human contact case // Zoonoses Public Health. 2007. Vol. 54, N 1. P. 31-37.
18. Vorou R.M., Papavassiliou V.G., Pierroutsakos I.N. Cowpox virus infection: an emerging health threat // Curr. Opin. Infect. Dis. 2008. Vol. 21, N 2. P. 153-156.
19. Львов Д.К., Громашевский В.Л., Маренникова С.С. и др. Изоляция поксвируса (Poxviridae, Poxvirus) от полевки-экономки Microtus (M.) oeconomus Pall., 1778 в лесотундре Кольского полуострова // Вопр. вирусологии. 1998. № 1. С. 92-24.
20. Emerson G.L., Li Y., Frace M.A., Olsen-Rasmussen M.A. et al. The phylogenetics and ecology of the orthopoxviruses endemic to North America // PLoS One. 2009. Vol. 4, N 10. Article ID e7666.
21. Skinner M.A., Buller R.M., Danon L.K., Lefkowitz E.J. Family poxviridae // Virus Taxonomy: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses / eds A. King, M. Adams, E. Carstens, E. Lefkowitz. San Diego : Elsevier; Academic Press, 2012. P. 291-309.
22. Foege W.H. House on Fire: The Fight to Eradicate Smallpox. New York, 2011. Vol. 21. 218 p.
23. Kerrod E., Geddes A.M., Regan M., Leach S. Surveillance and control measures during smallpox outbreaks // Emerg. Infect. Dis. 2005. Vol. 11, N 2. P. 291-297.
24. McCauley J.W., Hongo S., Kaverin N.V., Kochs G. et al. Orthomyxo-viridae // Virus Taxonomy: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses / eds A. King, M. Adams, E. Carstens, E. Lefkowitz. San Diego : Elsevier; Academic Press. 2012. P. 749 - 761.
25. Lvov D.K., Shchelkanov M.Y., Alkhovsky S.V., Deryabin P.G., Zoonotic Viruses of Northern Eurasia. Taxonomy and Ecology. London : Academic Press; Elsevier, 2015. 430 p.
26. Львов Д. К., Альховский С. В., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М. и др. Таксономический статус вируса Тюлёк (TLKV-Tyulek) (Orthomyxoviridae, Quaranjavirus, группа Кваранфил), изолированного в Киргизии из клещей Argas vulgaris Filippova, 1961 (Argasidae) из норовых биотопов с гнездами птиц // Вопр. вирусологии. 2014. Т. 59, № 3. С. 28-34.
27. Львов Д.К. Рождение и развитие вирусологии - история изучения новых и возвращающихся инфекций // Вопросы вирусологии. Прил. 1. 2012. С. 5-20.
28. Львов Д.К. Грипп и другие новые и возвращающиеся инфекции Северной Евразии: глобальные последствия // Федеральный справочник. Здравоохранение России. 2010. Вып. 11. С. 209-219.
29. Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Бовин Н.В., Малышев Н.А. и др. Корреляция между рецепторной специфичностью штаммов пандемического вируса гриппа A(H1N1)pdm09, изолированных в 2009-2011 гг., структурой рецепторсвязывающего сайта и вероятностью развития летальной первичной вирусной пневмонии // Вопр. вирусологии. 2012. Т. 57, № 1. С. 14-20.
30. WHO. Antigenic and Genetic Characteristics of Zoonotic Influenza Viruses and Development of Candidate Vaccine Viruses for Pandemic Preparedness. 28 September 2017.
31. Львов Д.К., Алипер Т.И., Дерябин П.Г., Забережный А.Д. и др. Вакцина против гриппа птиц инактивированная эмульгированная ФЛУ ПРО-ТЕКТ Н5 и способ профилактики гриппа птиц. Пат. РФ № 23503350. 2009.
REFERENCES
1. Lvov D.K. The value of re-emerging infections and biosafety. Voprosy virusologii [Problems of Virology]. 2002; (5): 4-7. (in Russian)
2. Emerging viruses. 1993. New York: Oxford University Press; xxiii: 317 p.
3. Kaufmann A.F., Meltzer M.I., Schmid G.P. The economic impact of a bioterrorist attack: are prevention and postattack intervention programs justifiable? Emerg Infect Dis. 1997; 3 (2): 83-94.
4. Lvov D.K. Ecology of viruses. In: Lvov D.K., eds. Guide to virology. Viruses and viral infections of humans and animals. Moscow: 1^; 2013: 66-86. (in Russian)
5. Goodman R.A., Bauman C.F., Gregg M.B., Videtto J.F., et al. Epidemiologic field investigations by the Centers for Disease control and Epidemic Intelligence Service, 1946-87. Public Health Rep. 1990; 105 (6): 604-10.
6. Langmuir A.D. The Epidemic Intelligence Service of the Center for Disease Control. Public Health Rep. 1980; 95 (5): 470-7.
7. Langmuir A.D., Andrews J.M. Biological warfare defense. 2. The Epidemic Intelligence Service of the Communicable Disease Center. Am J Public Health Nations Health. 1952; 42 (3): 235-8.
8. Lvov D.K., Zverev V.V., Gintsburg A.L. Smallpox - dormant volcano. Voprosy virusologii [Problems of Virology]. 2008; 53 (4): 4-8. (in Russian)
9. Shchelkunov S.N. Is it possible to return smallpox? Molekulyarnaya meditsina [Molecular Medicine]. 2011; (4): 36-41. (in Russian)
10. Lvov D.K. Monkeypox. In: Lvov D.K., eds. Guide to virology. Viruses and viral infections of humans and animals. Moscow: МIА; 2013: 670-1. (in Russian)
11. Di Giulio D.B., Eckburg P.B. Human monkeypox. Lancet Infect Dis. 2004; 4 (4): 199.
12. Formenty P., Muntasir M.O., Damon I., Chowdhary V., et al. Human monkeypox outbreak caused by novel virus belonging to Congo Basin clade, Sudan, 2005. Emerg Infect Dis. 2010; 16 (10): 1539-45.
13. Rimoin A.W., Mulembakani P.M., Johnston S.C., Lloyd Smith J.O., et al. Major increase in human monkeypox incidence 30 years after smallpox vaccination campaigns cease in the Democratic Republic of Congo. Proc Natl Acad Sci USA. 2010; 107 (37): 16 262-7.
14. Tesh R.B., Watts D.M., Sbrana E., Siirin M., et al. Experimental infection of ground squirrels (Spermophilus tridecemlineatus) with monkeypox virus. Emerg Infect Dis. 2004; 10 (9): 1563-7.
15. Kapil S., Yeary T., Evermann J.F. Viral diseases of new world camelids. Vet Clin North Am Food Anim Pract. 2009; 25 (2): 323-37.
16. Medaglia M.L., Pessoa L.C., Sales E.R., Freitas T.R., et al. Spread of cantagalo virus to northern Brazil. Emerg Infect Dis. 2009; 15 (7): 1142-3.
17. Schulze C., Alex M., Schirrmeier H., Hlinak A., et al. Generalized fatal Cowpox virus infection in a cat with transmission to a human contact case. Zoonoses Public Health. 2007; 54 (1): 31-7.
18. Vorou R.M., Papavassiliou V.G., Pierroutsakos I.N. Cowpox virus Infection: an emerging health threat. Curr Opin Infect Dis. 2008; 21 (2): 153-6.
19. Lvov D.K., Gromashevskiy V.L., Marennikova S.S., et al. Isolation of a poxvirus (Poxviridae, Poxvirus) from Microtus vole housekeeper (M.) oeconomus Pall., 1778 in the Kola Peninsula forest-tundra. Voprosy viruso-logii [Problems of Virology]. 1998; (1): 92-4. (in Russian)
20. Emerson G.L., Li Y., Frace M.A., Olsen-Rasmussen M.A., et al. The phylogenetics and ecology of the orthopoxviruses endemic to North America. PLoS One. 2009; 4 (10): e7666.
21. Skinner M.A., Buller R.M., Danon L.K., Lefkowitz E.J. Family poxviridae. In: King A., Adams M., Carstens E., Lefkowitz E. (eds). Virus Taxonomy: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. San Diego: Elsevier; Academic Press, 2012: 291-309.
22. Foege W.H. House on fire: the fight to eradicate smallpox. New York, 2011; 21: 218 p.
23. Kerrod E., Geddes A.M., Regan M., Leach S. Surveillance and control measures during smallpox outbreaks. Emerg Infect Dis. 2005; 11 (2): 291-7.
24. McCauley J.W., Hongo S., Kaverin N.V., Kochs G., et al. Ortho-myxoviridae. In: King A., Adams M., Carstens E., Lefkowitz E. (eds). Virus Taxonomy: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. San Diego: Elsevier; Academic Press, 2012: 749-61.
25. Lvov D.K., Shchelkanov M.Y., Alkhovsky S.V., Deryabin P.G. Zoonotic viruses of Northern Eurasia. Taxonomy and ecology. London: Academic Press. Elsevier, 2015: 430 p.
26. Lvov D.K., Alkhovskly S.V., Shchelkanov M.Yu., Shchetlnln A.M., et al. Taxonomlc status of the Tyulek virus (TLKV) (Orthomyxoviridae, Quar-anjavlrus, Quaranfil group) isolated from the ticks Argas vulgaris Filippova, 1961 (Argasldae) from the birds burrow nest blotopes in the Kyrgyzstan. Voprosy virusologii [Problems of Virology]. 2014; 59 (3): 28-34. (in Russian)
27. Lvov D.K. Birth and development of virology - a history of learning new and recurring infections. Voprosy virusologii [Problems of Virology]. Supl. 1. 2012: 5-20. (in Russian)
28. Lvov D.K. Influenza and other new and recurring infections of Northern Eurasia: global consequences. In: Federal directory. Health of Russia. 2010; 11: 209-19. (in Russian)
29. Lvov D.K., Shchelkanov M.Yu., Bovln N.V., Malyshev N.A., et al. Correlation between the receptor specificity of pandemic influenza A (H1N1) pdm09 virus strains isolated in 2009-2011 and the structure of the receptor-binding site and the probability of fatal primary viral. Voprosy virusologii [Problems of Virology]. 2012; 57 (1): 14-20. (in Russian)
30. WHO. Antigenic and genetic characteristics of zoonotic influenza viruses and development of candidate vaccine viruses for pandemic preparedness. 28 September 2017.
31. Lvov D.K., Allper T.I., Deryabin P.G., Zaberezhnyy A.D., et al. Vaccine against avian influenza inactivated emulsified FLU PROTECT H5 and method for the prevention of avian influenza Patent RF №23503350. 2009. (in Russian)
