Научная статья на тему 'Об особенностях молекулярных структур полиазамакроциклических лигандов и их изменении при координации с ионами 3 d-элементов по данным квантово-химического расчета методом функционала плотности. IX. 1,4,8,11-тетраазациклотетрадекадиен-1,7-тетратион-2,3,9,10, образующийся при «Самосборке» металлохелатов в системах ион m(II) 3 D-элемента– этандитиоамид– 3-гидроксиропаналь'

Об особенностях молекулярных структур полиазамакроциклических лигандов и их изменении при координации с ионами 3 d-элементов по данным квантово-химического расчета методом функционала плотности. IX. 1,4,8,11-тетраазациклотетрадекадиен-1,7-тетратион-2,3,9,10, образующийся при «Самосборке» металлохелатов в системах ион m(II) 3 D-элемента– этандитиоамид– 3-гидроксиропаналь Текст научной статьи по специальности «Химические науки»

CC BY
64
27
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
МОЛЕКУЛЯРНАЯ СТРУКТУРА / ХЕЛАНТ / МЕТАЛЛОХЕЛАТ / 11-ТЕТРААЗАЦИКЛОТЕТРАДЕКАДИЕН-1 / 7-ТЕТРАТИОН-2 / DFT / 1 / 4 / 8 / 3 / 9 / 10 / MOLECULAR STRUCTURE / CHELANT / METALCHELATE / 11-TETRAZACYCLOTETRADECADIEN-1 / 7-TETRATHIONE-2

Аннотация научной статьи по химическим наукам, автор научной работы — Михайлов О. В., Чачков Д. В., Шамсутдинов Т. Ф.

С использованием метода функционала плотности в варианте OPBE/TZVP и программы Gaussian09 определены ключевые параметры молекулярной структуры 14-членного макроциклического хеланта1,4,8,11-тетраазацикло-тетрадекадиен-1,7-тетратиона-2,3,9,10, возникающего в результате деметаллирования и последующей протонизации содержащих его во внутренней координационной сфере металлохелатов M(II) (M= Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn). Отмечено, что во всех рассматриваемых металлохелатах 14-членный макроцикл имеет меньшее отклонение от компланарности, нежели аналогичный макроцикл в хеланте.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по химическим наукам , автор научной работы — Михайлов О. В., Чачков Д. В., Шамсутдинов Т. Ф.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Using the OPBE/TZVP method and Gaussian09 program, the basic parameters of the molecular structure of 14-membered macrocyclic chelant, 1,4,8,11-tetrazacyclotetradecadien-1,7-tetrathione-2,3,9,10 which is formed as a result of demetallation containing it in the inner coordination sphere of the M(II) metal chelates (M = Cr, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn) have been identified. It has been noted that in the all metalchelates under examination, 14-membered macrocycle has lesser deviation from co-planarity than similar macrocycle in the chelant.

Текст научной работы на тему «Об особенностях молекулярных структур полиазамакроциклических лигандов и их изменении при координации с ионами 3 d-элементов по данным квантово-химического расчета методом функционала плотности. IX. 1,4,8,11-тетраазациклотетрадекадиен-1,7-тетратион-2,3,9,10, образующийся при «Самосборке» металлохелатов в системах ион m(II) 3 D-элемента– этандитиоамид– 3-гидроксиропаналь»

УДК 541.49

О. В. Михайлов, Д. В. Чачков, Т. Ф. Шамсутдинов

ОБ ОСОБЕННОСТЯХ МОЛЕКУЛЯРНЫХ СТРУКТУР ПОЛИАЗАМАКРОЦИКЛИЧЕСКИХ ЛИГАНДОВ

И ИХ ИЗМЕНЕНИИ ПРИ КООРДИНАЦИИ С ИОНАМИ 3й?-ЭЛЕМЕНТОВ

ПО ДАННЫМ КВАНТОВО-ХИМИЧЕСКОГО РАСЧЕТА МЕТОДОМ ФУНКЦИОНАЛА ПЛОТНОСТИ.

IX. 1,4,8,11-ТЕТРААЗАЦИКЛОТЕТРАДЕКАДИЕН-1,7-ТЕТРАТИОН-2,3,9,10,

ОБРАЗУЮЩИЙСЯ ПРИ «САМОСБОРКЕ» МЕТАЛЛОХЕЛАТОВ В СИСТЕМАХ ИОН M(II) 3^-ЭЛЕМЕНТА-

ЭТАНДИТИОАМИД- 3-ГИДРОКСИРОПАНАЛЬ

Ключевые слова: молекулярная структура, хелант, металлохелат, DFT, 1,4,8,11-тетраазациклотетрадекадиен-1,7-

тетратион-2,3,9,10.

С использованием метода функционала плотности в варианте OPBE/TZVP и программы Gaussian09 определены ключевые параметры молекулярной структуры 14-членного макроциклического хеланта - 1,4,8,11-тетраазацикло-тетрадекадиен-1,7-тетратиона-2,3,9,10, возникающего в результате деметаллирования и последующей протонизации содержащих его во внутренней координационной сфере металлохелатов M(II) (M= Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn). Отмечено, что во всех рассматриваемых металлохелатах 14-членный макроцикл имеет меньшее отклонение от компланарности, нежели аналогичный макроцикл в хеланте.

Key words: molecular structure, chelant, metalchelate, DFT, 1,4,8,11-tetrazacyclotetradecadien-1,7-tetrathione-2,3,9,10.

Using the OPBE/TZVP method and Gaussian09 program, the basic parameters of the molecular structure of 14-membered macrocyclic chelant, 1,4,8,11-tetrazacyclotetradecadien-1,7-tetrathione-2,3,9,10 which is formed as a result of demetallation containing it in the inner coordination sphere of the M(II) metal chelates (M = Cr, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn) have been identified. It has been noted that in the all metalchelates under examination, 14-membered macrocycle has lesser deviation from co-planarity than similar macrocycle in the chelant.

Этандитиоамид Н2Ы-С(=8)-С(=8)-ЫН2, более известный в аналитической химии под названием «ру-беановодородная кислота», обладает четырьмя потенциальными донорными центрами (два атома N и два атома 8) и двумя достаточно подвижными атомами водорода, благодаря чему он, с одной стороны, легко образует очень прочные и интенсивно окрашенные хелатные комплексы с рядом ионов 3й?-элементов [1], с другой - способен участвовать в реакциях «самосборки» и темплатного синтеза в качестве лигсона [27]. Ранее в ряде работ нами был осуществлен кванто-во-химический расчет по методу функционала плотности (ОРТ) (5656) макротетрациклических соединений, образующихся в результате темплатных процессов с участием данного лигсона, в частности в системах ион 3^-элемента - этандитиоамид - пропанон (ацетон) НзС—С(=0)—СНз, в состав которых входит хелатный лиганд формулы I [8,9] НзС

H3O

\cH3 CH3

I

При замене ацетона на 3-гидроксипропаналь Н2С(0Н)-СН2-СН(=0)-СН3 могут быть получены (5656)макротетрациклические металлохелаты, содержащие во внутренней координационной сфере лиганд II, аналогичный I, но без «периферийных» метильных групп:

II

В [8] было констатировано, что в случае хелатов Мп(11), Ре(11), Со(11) и N1(11) удаление иона металла из 14-членного макроцикла способствует уменьшению его искажения (под которым понимается прежде всего степень отклонения этого макроцикла от плоскостности), тогда как в двух в случае хелатов Си(11) и 2п(И) - напротив, усилению этого искажения. В связи с этим представляется интересным проследить, как изменится положение дел, если из макроцикли-ческого хеланта I удалить все шесть метильных групп; теоретическому рассмотрению этого вопроса и посвящено настоящее краткое сообщение.

Расчет структуры макроциклического хеланта был проведен методом РРТ 0РББ/Т2УР с использованием программы с использованием программного пакета Саизз1ап09 [10], апробированным нами ранее в предшествующей работе [11]. Соответствие найденных стационарных точек минимумам энергии во всех случаях доказывалось вычислением вторых производных энергии по координатам атомов; при этом все частоты имели положительные значения. Квантово-химические расчеты были осуществлены в Казанском Филиале Межведомственного суперкомпьютерного центра РАН (http://kbjscc.knc.ru).

Результаты

Молекулярная структура хеланта II представлена на рис. 1. Как можно видеть из него, это соединение не является плоским и в этом отношении напоминает

Н8

Рис. 1 - Молекулярная структура 1,4,8,11-

тетраазациклотетрадекадиен-1,7-тетратиона-

2,3,9,10

рассмотренное в [8] соединение I. В качестве количественного критерия степени некомпланарности макроцикла как в самом II, так и в образуемых им метал-локомплексах наиболее адекватной представляется разность между суммой внутренних валентных углов в макроцикле (^N10509 + ZC5C9C6 + ZC9C6N2 + ZC6N2C3 + ZN2C3C4 + ZC3C4N3 + ZC4N3C8 + ZN3C8C10 + ZC8C10C7 + ZC10C7N4 + ZC7N4C1 + ZN4C1C2 + ZC1C2N1 + ZC2N1C5) и суммой внутренних углов в плоском 14-угольнике (2160°). Данные расчета этого параметра для вышеуказанных химических соединений представлены в таблице 1. Как можно видеть из нее, значения этих сумм как в самом хеланте II, так и в образуемых им металлоком-плексах всегда меньше 2160о, при этом степень отклонения суммы поименованных выше углов от значения 2160о, соответствующей плоскому 14-угольнику [от 51.2о в случае 2п(1!) до 61.4° в случае Co(II)] меньше, нежели аналогичный параметр для хеланта (68.1о). При переходе от Мп к ^ эти значения по модулю повышаются, при переходе же от ^ к N1 - понижаются. Соответственно, разности между суммой внутренних углов в 14-членном макроцикле хеланта и суммами внутренних углов в в 14-членном макроциклах образуемых им металлохелатах при переходе Мп - ^ убывают, при переходе ^ - 2п убывают. Таким образом, можно утверждать, что во всех рассматриваемых нами координационных соединениях деметаллирование хелатов 3 ^-элементов с 1,4,8,11-тетраазациклотетрадекадиен-1,7-тетратионе-2,3,9,10 способствует усилению искажения вышеуказанного 14-членного макроцикла. Сопоставляя эти данные с аналогичными результатами, представленными в работе [8], можно заметить, что для каждого из рассматриваемых ионов М(11) степень отклонения

макроцикла от плоскостности в комплексах с гекса-метилзамещенным 1,4,8,11 -тетраазациклотетрадека-диен-1,7-тетратиона-2,3,9,10 весьма существенно (более чем на 40о) больше, чем в комплексах с незамещенным 1,4,8,11-тетраазациклотетрадекадиен-1,7-тетратионом-2,3,9,10, причем динамика изменения этого показателя в зависимости от природы иона металла практически одинакова.

Таблица 1 - Суммы валентных углов в 1,4,8,11-тетраазациклотетрадекадиен-1,7-тетратионе-2,3,9,10 и в его координационных соединениях с различными ионами М(М) 3^-элементов

Объект Сумма Различие Различие

[М(!!)] углов между между

в 14-членном суммой углов суммой углов

макроцикле в 14-членном в 14-членном

град макроцикле и макроцикле

суммой углов в хеланте

плоского и комплексе,

14-угольника, град

град

Хелант 2091.9 - 68.1 0.0

Мп(!!) 2107.2 - 52.8 + 15.3

Рв(!!) 2102.4 - 57.6 + 10.5

Co(!!) 2098.6 - 61.4 + 6.7

^Л(!!) 2099.0 - 61.0 + 7.1

Cu(!!) 2108.6 - 51.4 + 16.7

гп(!!) 2108.8 - 51.2 + 16.9

Таблица 2 - Суммы валентных углов в 5,5,7,12,12,14-гексаметильном замещенном 1,4,8,11-тетраазацикло- тетрадекадиен-1,7-тетратиона-2,3,9,10 и в его координационных соединениях с различными ионами М(П) 3^-элементов (данные взяты из работы [8])

Объект Сумма Различие Различие

[М(!!)] углов между между

в 14-членном суммой углов суммой углов

макроцикле в 14-членном в 14-членном

град макроцикле и макроцикле

суммой углов в хеланте

плоского и комплексе,

14-угольника, град

град

Хелант 2065.7 - 94.3 0.0

Мп(!!) 2055.4 - 104.6 - 10.3

Ре(!!) 2050.4 - 109.6 - 15.3

Co(II) 2050.2 - 109.8 - 15.5

№(!!) 2051.2 - 108.8 - 14.5

^(П) 2068.8 - 91.2 + 3.1

гп(!!) 2073.9 - 86.1 + 8.2

Авторы выражают свою искреннюю благодарность Российскому Фонду фундаментальных исследований, при финансовой поддержке которого подготовлена данная статья (грант № 09-03-97001).

Литература

1. Д. Перрин, Органические аналитические реагенты, М., Мир, 1967.

2. О.В. Михайлов, Координационная химия, 26, 10, 750762 (2000)

3. О.В. Михайлов, Химическая технология, 3, 7, 2- 10 (2001).

4. О.В. Михайлов, Химическая технология, 3, 9, 10- 15 (2001).

5. O.V. Mikhailov, A.I. Khamitova A.I., L.S. Shigapova, T.E. Busygina, Transition Metal Chemistry, 24, 5, 503-510 (1999).

6. O.V. Mikhailov, A.I. Khamitova, Transition Metal Chemistry, 25, 1, 26-31 (2000)

7. O.V. Mikhailov, International Journal of Inorganic Materials, 3, 7, 1053-1061 (2001)

8. Д.В. Чачков, О.В. Михайлов, Вестник Казанского Технологического Университета, 15, 17, 10-11 (2012)

9. Д.В. Чачков, О.В. Михайлов, Журнал неорганической химии, 58, 9, 1199-1204 (2013)

10. Gaussian 09, Revision A. 01, M.J. Frisch, G.W. Trucks, H.B. Schlegel, G.E. Scuseria, M.A. Robb, J.R. Cheeseman, G.

Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G.A. Petersson, H. Nakat-suji, M. Caricato, X. Li, H.P. Hratchian, A.F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J.L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J.A. Montgomery, Jr., J.E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J.J. Heyd, E. Brothers, K.N. Kudin, V.N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J.C. Burant, S.S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J.M. Millam, M. Klene, J.E. Knox, J.B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R.E. Stratmann, O. Yazyev, A.J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J.W. Ochterski, R.L. Martin, K. Morokuma, V.G. Zakrzewski, G.A. Voth, P. Salvador, J.J. Dannenberg, S. Dapprich, A.D. Daniels, O. Farkas, J.B. Foresman, J.V. Ortiz, J. Cioslowski, and D.J. Fox, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009 11. О.В. Михайлов, Д.В. Чачков, Вестник Казанского Технологического Университета, 15, 3, 11-14 (2012)

© О. В. Михайлов - д-р хим. наук, проф. каф. аналитической химии, сертификации и менеджмента качества КНИТУ, ovm@kstu.ru; Д. В. Чачков - канд. хим. наук, ст. науч. сотр. Казанского филиала Межведомственного Суперкомпьютерного Центра РАН, de2005c@gmail.com; Т. Ф. Шамсутдинов - канд. хим. наук, ст. препод. каф. систем автоматизированного проектирования КГАСУ, chachkov@kstu.ru.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.