Научная статья на тему 'Многолетняя заболеваемость клещевым энцефалитом и генетическое разнообразие возбудителя в Кемеровской области'

Многолетняя заболеваемость клещевым энцефалитом и генетическое разнообразие возбудителя в Кемеровской области Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
680
103
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
клещевой энцефалит / многолетняя динамика заболеваемости / группы риска / вирус клещевого энцефалита / генетическое разнообразие / tick-borne encephalitis / long!term dynamics of disease / risk groups / tick!borne encephalitis virus / the genetic diversity

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Ефимова Анна Роняевна, Дроздова Ольга Михайловна, Карань Людмила Станиславовна

Изучена многолетняя динамика заболеваемости клещевым энцефалитом (КЭ) в Кемеровской области с 1952 по 2014 годы, проведено генотипирование 11 проб РНК вируса клещевого энцефалита, изолированных из клещей I. persulcatus, собранных в 2014 году. Цель исследования – установление эпидемиологических закономерностей распространения заболеваемости КЭ и генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита. Методы исследования. Использованы метод ретроспективного эпидемиологического анализа, статистические методы, иммуноферментный анализ и полимеразная цепная реакция. Результаты. Выявлены региональные особенности распространения заболеваемости, определена цикличность КЭ. Установлена эпидемиологическая эффективность акарицидных обработок эндемичных территорий и массовой вакцинопрофилактики. Область их применения. Практическое здравоохранение. Выводы. Основными группами высокого риска на протяжении всего периода изучения были дети школьного возраста (7!16 лет) и сельское население. В последние десятилетия на территории области циркулирует вирус клещевого энцефалита только сибирского подтипа с высоким разнообразием топовариантов.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Ефимова Анна Роняевна, Дроздова Ольга Михайловна, Карань Людмила Станиславовна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

LONG-TERM INCIDENCE OF TICK-BORNE ENCEPHALITIS AND GENETIC DIVERSITY OF THE CAUSATIVE AGENT IN THE KEMEROVO REGION The study long!term dynamics of tick!borne encephalitis (TBE

The study long-term dynamics of tick-borne encephalitis (TBE) incidence within the territory of Kemerovo region since 1952 to 2014 years. TBEV genotype has been determined for 11 RNA samples isolated from ticks collected in 2014. Objective – establish genetic variety of TBE and regularities of it’s epidemiological expansion. Methods. The methods, we used, were retrospective epidemiological analysis, enzyme immunoassay (ELISA), polymerase chain reaction and different statistics. Results. As a result, regional specific features and cyclic character of TBE incidence were evaluated. We also determined epidemiological efficacy of universal vaccination campaigns and acaricide treatment at highly-epidemic areas. Conclusions. During our studies the main high-risk groups were school-aged children (7-16 years) and rural population. Over the last decade only Siberian subtype of TBE, which consists of many local variations, circulates within the territory of the region.

Текст научной работы на тему «Многолетняя заболеваемость клещевым энцефалитом и генетическое разнообразие возбудителя в Кемеровской области»

ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

Статья поступила в редакцию 26.09.2015 г.

Ефимова А.Р., Дроздова О.М., Карань Л.С.

Кемеровская государственная медицинская академия, Центр гигиены и эпидемиологии в Кемеровской области,

г. Кемерово,

Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора,

г. Москва

МНОГОЛЕТНЯЯ ЗАБОЛЕВАЕМОСТЬ КЛЕЩЕВЫМ ЭНЦЕФАЛИТОМ И ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ВОЗБУДИТЕЛЯ В КЕМЕРОВСКОЙ ОБЛАСТИ

Изучена многолетняя динамика заболеваемости клещевым энцефалитом (КЭ) в Кемеровской области с 1952 по 2014 годы, проведено генотипирование 11 проб РНК вируса клещевого энцефалита, изолированных из клещей I. per-sulcatus, собранных в 2014 году.

Цель исследования - установление эпидемиологических закономерностей распространения заболеваемости КЭ и генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита.

Методы исследования. Использованы метод ретроспективного эпидемиологического анализа, статистические методы, иммуноферментный анализ и полимеразная цепная реакция.

Результаты. Выявлены региональные особенности распространения заболеваемости, определена цикличность КЭ. Установлена эпидемиологическая эффективность акарицидных обработок эндемичных территорий и массовой вакцинопрофилактики.

Область их применения. Практическое здравоохранение.

Выводы. Основными группами высокого риска на протяжении всего периода изучения были дети школьного возраста (7-16 лет) и сельское население. В последние десятилетия на территории области циркулирует вирус клещевого энцефалита только сибирского подтипа с высоким разнообразием топовариантов.

Ключевые слова: клещевой энцефалит; многолетняя динамика заболеваемости; группы риска; вирус клещевого энцефалита; генетическое разнообразие.

Efimova A.R., Drozdova O.M., Karan L.S.

Kemerovo State Medical Academy,

Center of Hygiene and Epidemiology in Kemerovo region, Kemerovo,

Central Research Institute of Epidemiology, Moscow

LONG-TERM INCIDENCE OF TICK-BORNE ENCEPHALITIS AND GENETIC DIVERSITY OF THE CAUSATIVE AGENT IN THE KEMEROVO REGION

The study long-term dynamics of tick-borne encephalitis (TBE) incidence within the territory of Kemerovo region since 1952 to 2014 years. TBEV genotype has been determined for 11 RNA samples isolated from ticks collected in 2014.

Objective - establish genetic variety of TBE and regularities of it's epidemiological expansion.

Methods. The methods, we used, were retrospective epidemiological analysis, enzyme immunoassay (ELISA), polymerase chain reaction and different statistics.

Results. As a result, regional specific features and cyclic character of TBE incidence were evaluated. We also determined epidemiological efficacy of universal vaccination campaigns and acaricide treatment at highly-epidemic areas.

Conclusions. During our studies the main high-risk groups were school-aged children (7-16 years) and rural population. Over the last decade only Siberian subtype of TBE, which consists of many local variations, circulates within the territory of the region.

Key words: tick-borne encephalitis; long-term dynamics of disease; risk groups; tick-borne encephalitis virus; the

genetic diversity.

Кемеровская область относится к территориям, эндемичным по клещевому энцефалиту (КЭ). История его изучения насчитывает более 70 лет. Первые описания случаев КЭ относятся к 1941 году. Максимальная заболеваемость регистрировалась в 50-е годы прошлого столетия, в 60-е годы на долю Кемеровской области приходилось до 70 % всех заболеваний КЭ в Западной Сибири. Это определило организацию комплексного изучения эпиде-

Корреспонденцию адресовать:

ЕФИМОВА Анна Роняевна,

650099, г. Кемерово, пр. Шахтеров, д. 42, кв. 17. Тел.: 8 (3842) 36-81-57; +7-908-945-15-86. E-mail: annapralich1@mail.ru

миологических, клинических и зоолого-энтомологических закономерностей распространения инфекции с участием сотрудников специально созданных эпидемиологических отрядов НИИ полиомиелита и вирусных энцефалитов Академии медицинских наук (АМН) СССР, областной санитарно-эпидемиологической станции и здравоохранения Кемеровской области. В разработке специфических и неспецифических мероприятий был использован опыт борьбы с КЭ, полученный на Дальнем Востоке.

В 1960-1970-е годы основными среди неспецифических мер служили акарицидные обработки территории области, которые проводились с использованием дихлордифенилтрихлорэтана (ДДТ) в больших масштабах с привлечением авиации. Кроме того, ис-

34

T. 14 № 4 2015

Medicine

in Kuzbass

в Кузбассе

пользовали методы индивидуальной защиты от нападения клещей с применением репеллентов, специальной одежды, пропагандировали правила безопасного поведения при посещении природных и антропурги-ческих очагов, создавали «культурные» ландшафты. Используемые меры определили резкое снижение численности клещей, количества покусов и заболеваемости населения.

Одновременно использовали меры специфической профилактики, которые предполагали вакцинацию групп риска и введение специфического иммуноглобулина лицам, пострадавшим от укусов клещей. Первая вакцина против КЭ была изготовлена на основе инактивированной формалином мозговой суспензии зараженных белых мышей дальневосточного штамма вируса клещевого энцефалита. Вакцина оказалась высоко реактогенной, использовалась ограниченно и вскоре была заменена другой, изготовленной на тканевой культуре со сложной и длительной схемой иммунизации, при которой полноценный иммунитет у населения формировался только через 5 лет [1].

Современные отечественные вакцины приготовлены на основе инактивированного вируса клещевого энцефалита дальневосточного подтипа, очищены от балластных примесей, характеризуются большей эффективностью и безопасностью по сравнению с применявшимися ранее [1]. Зарегистрированы единичные случаи заболеваний КЭ среди вакцинированных лиц, которые отличались доброкачественным течением [2, 3]. Зарубежные вакцины, применяемые в России, не имеют принципиальных различий в технологии получения и реактогеннос-ти, однако в качестве производственных использованы штаммы, относящиеся к европейскому подтипу, мало распространенному на территории нашей страны [1, 3]. Дискуссионным остается вопрос эффективности вакцин, изготовленных на основе разных вирусных штаммов, для профилактики КЭ в Российской Федерации.

В последние десятилетия существенно изменились социальные и экономические условия жизни населения. К их числу относятся возросшая мобильность, увеличение количества загородных мест отдыха и проживания, освоение новых территорий в границах природных очагов и т.д. Глобальные изменения климата, антропогенная трансформация ландшафтов, совершенствование профилактических и противоэпидемических мероприятий влияют на распространение КЭ [3, 4].

Цель исследования — проанализировать эпидемиологические закономерности распространения заболеваемости КЭ и генетическое разнообразие вируса клещевого энцефалита в Кемеровской области.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

Выполнено описательное ретроспективное эпидемиологическое исследование распространения КЭ в Кемеровской области. Использованы данные форм официальной отчетности Управления Роспотребнадзора по Кемеровской области за период с 1952 по 2014 гг. В материалы исследования включены 12627 карт эпидемиологического обследования очагов заболеваний КЭ за 50 лет (1961-2014 гг.) Частоту покусов и объемы проводимой экстренной иммунопрофилактики пострадавшему от нападения клещей населению оценивали при анализе более 200 тысяч обращений жителей в медицинские организации области за 1990-2014 годы.

Вирусофорность клещей изучена при исследовании 50000 особей клещей, собранных на территории области. Имаго клещей Ixodes persulcatus (I. Persul-catus) собирали с растительности на флаг в период их максимальной активности — с мая по июнь. Исследования на наличие антигена КЭ проводили в вирусологических лабораториях на базе аккредитованных испытательных центров ФБУЗ «Центра гигиены и эпидемиологии в Кемеровской области» в городах Кемерово и Новокузнецк. Клещей исследовали пулами по 10 особей методом иммуноферментного анализа с использованием тест-систем «Векто-ВКЭ-антиген».

Генетическое разнообразие вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) было изучено при генотипирова-нии 11 проб РНК ВКЭ, изолированных из клещей I. persulcatus, собранных в 2014 году в Кемеровском, Крапивинском, Гурьевском, Ижморском, Юргинском и Топкинском районах области. Генотипирование проводилось с помощью метода полимеразной цепной реакции (ПЦР) в режиме реального времени с генотипспецифическими зондами и методом сравнения нуклеотидных последовательностей участка гликопротеина Е с изолятами, депонированными в базу данных NCBI. Анализ гомологии нуклеотидных последовательностей проводился в программе Mega 5.0.

Анализ динамических рядов проводили методом наименьших квадратов, исключение выскакивающих величин — с применением критерия Шовене. Коэффициент корреляции Спирмена вычислялся для уровня значимости p = 0,05. Доверительные интервалы интенсивных показателей рассчитывались для доверительной вероятности 95 %.

Статистическая обработка результатов исследования проводилась с использованием пакета прикладных программ Microsoft® Office Exel 2010.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

Официальная регистрация КЭ в Кемеровской области началась с 1952 года. Средняя многолетняя ин-

Сведения об авторах:

ЕФИМОВА Анна Роняевна, врач-вирусолог, ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Кемеровской области»; аспирант, кафедра эпидемиологии, ГБОУ ВПО КемГМА Минздрава России, г. Кемерово, Россия. E-mail: annapralich1@mail.ru

ДРОЗДОВА Ольга Михайловна, доктор мед. наук, профессор, кафедра эпидемиологии, ГБОУ ВПО КемГМА Минздрава России, г. Кемерово, Россия.

КАРАНЬ Людмила Станиславовна, науч. сотрудник, ФБУН Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, г. Москва, Россия.

ОК{вдицина

в Кузбассе

Medicine

in Kuzbass

T. 14 № 4 2015

35

МНОГОЛЕТНЯЯ ЗАБОЛЕВАЕМОСТЬ КЛЕЩЕВЫМ ЭНЦЕФАЛИТОМ И ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ВОЗБУДИТЕЛЯ В КЕМЕРОВСКОЙ ОБЛАСТИ

цидентность с 1952 по 2014 годы составила 11,73 %ooo [95% ДИ = 10,55-13,02], максимальный уровень зарегистрирован в 1952 году (56,3 %«» [95% ДИ = 54,4058,18]), минимальный — в 1973 году (1,1 /oooo [95% ДИ = 0,75-1,58]). Установлена тенденция снижения заболеваемости Тпр. = -2,05% (рис. 1).

Для КЭ характерна цикличность в эндемичных регионах России, которая зависит от природных и климатических условий, погодных колебаний, состояния популяций прокормителей, количества клещей, объема и качества проводимых профилактических и противоэпидемических мероприятий и т.д. Как правило, циклы с периодическими подъемами и спадами характеризуются значительными размахами и небольшими амплитудами колебаний заболеваемости в течение каждого цикла [1, 4].

Ретроспективным анализом многолетней заболеваемости КЭ в Кемеровской области выявлено три периода, отличавшихся интенсивностью и продолжительностью.

Высокие уровни заболеваемости отмечены в первом периоде. Однако отсутствие регистрации КЭ до 1952 года не позволило установить его начало. Вероятно, 1952-1957 годы могут быть отнесены к его окончанию, и в это время заболеваемость была максимальной за весь период наблюдения (средний многолетний показатель — 40,0 %ooo [95% ДИ = 38,1541,88]) и отличалась выраженной тенденцией к сни-

жению (Тпр = - 18,6%). В эти годы начались акари-цидные обработки отдельных территорий, и в 1957 году объем их составил 12000 гектаров. Вакцинация против КЭ проводилась в ограниченном количестве (не более 3000-7000 человек в год), и не имела решающего значения в профилактике инфекции [5].

Второй период продолжался более 30 лет, с 1958 до 1989 года, отличался комплексным подходом к профилактике КЭ и относительной стабилизацией заболеваемости на низком уровне (Тпр. = 0,1 %). По сравнению с первым периодом, инцидентность КЭ уменьшилась в 6 раз, средний многолетний показатель — 6,56 /oooo [95% ДИ = 5,65-7,56]. Вместе с тем, в этом периоде заболеваемость распределялась неравномерно. До 1981 года особое значение придавалось массированным акарицидным обработкам лесов высокоэндемичных территорий препаратом ДДТ, в том числе с использованием авиации. Всего за период с 1958 по 1980 гг. было обработано более 900 тыс. га. Максимально интенсивно леса обрабатывались с конца 50-х и до середины 60-х годов [6]. Акарицид-ные обработки оказали существенное влияние на уровень заболеваемости КЭ (рис. 2). Установлена высокой силы обратная корреляционная связь между заболеваемостью КЭ и объемами обработанных акарицидами территорий (R = -0,867; p = 0,05).

Одновременно широко применяли вакцинопрофилактику. С 60-х годов ежегодно прививали 150-250 тыс.

Рисунок 1

Многолетняя динамика заболеваемости клещевым энцефалитом (КЭ) в Кемеровской области за 1952-2014 гг.

Figure 1

Long-term dynamics of the incidence of tick-borne encephalitis in the Kemerovo region for the 1952-2014

Information about authors:

EFIMOVA Anna Ronyaevna, doctor virologist, Center of Hygiene and Epidemiology in Kemerovo region; postgraduate student, department of epidemiology, Kemerovo State Medical Academy, Kemerovo, Russia. E-mail: annapralich1@mail.ru

DROZDOVA Olga, doctor of medical sciences, professor, department of epidemiology, Kemerovo State Medical Academy, Kemerovo, Russia. KARAN Lyudmila, research scientist, Central Research Institute of Epidemiology, Moscow, Russia.

36

T. 14 № 4 2015 MediciinnLass

ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

Рисунок 2

Динамика акарицидных обработок и заболеваемости КЭ в 1952-1971 гг.

Figure 2

Dynamics of acaricide treatment and the incidence of tick-borne encephalitis in 1952-1971

120

100

80

60

40

20

0

о

a

H

Я

в

о

ч

G

і і Заболеваемость ---------Акарицидные обработки

человек, включая взрослых и детей с 4-7 лет, с использованием культуральной вакцины производства Института полиомиелита и вирусных энцефалитов АМН СССР. Общее количество привитых составило около 2 миллионов человек [6, 7].

Одновременное сочетание больших объемов специфической и неспецифической профилактики привело к снижению заболеваемости в 2,6 раза, с 10,0 %ооо [95% ДИ = 8,89-11,19] в 1958 году до 3,9 %oooo [95% ДИ = 3,23-4,73] в 1980 году.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

В связи с официальным запретом применения ДДТ для акарицидных обработок, высокой реактогеннос-тью вакцины против клещевого энцефалита, длительной схемой вакцинации, с 1981 года в Кемеровской области приоритет был отдан экстренной профилактике с использованием препаратов иммуноглобулина пострадавшему от нападения клещей населению. Объем ее увеличивался ежегодно. В 1981 году иммуноглобулин получили 37 % обратившихся после присасывания клещей, в 1988 г. — 98 % [7]. Для профилактики заболевания у детей применялся иммуноглобулин против ВКЭ, взрослым вводили иммуноглобулин человека нормальный с низким титром антител (1 : 20 — 1 : 40) [7]. Изменения системы профилактики сопровождались тенденцией к росту заболеваемости в конце второго периода до 9,9 °%>oo [95% ДИ = 8,86-11,15] к 1989 году (Тпр. = 8,72 %).

Третий период (1990-2014 гг.) характеризовался более высоким средним многолетним показателем инцидентности (11,15 %ooo [95% ДИ = 9,99-12,40]) по сравнению со вторым. В начале изучаемого периода (1991-2000 гг.) заболеваемость росла (Тпр. = 1,28 %), что обусловлено уменьшением объемов вакцинации населения, постепенной утратой эффективности ранее проводимых акарицидных обработок и отсутствием новых альтернативных препаратов. В связи с этим, была проведена большая работа по подбору ин-сектоакарицидных субстанций, подходящих для борь-

бы с клещами в природных биотопах. В 21 веке борьба с клещами проводится препаратами, которые обладают относительно коротким остаточным действием — фосфорорганическими соединениями (ФОС) и пиретроидами [8, 9]. В лесной подстилке акари-цидные средства, изготовленные на их основе, сохраняют свое действие не более 1-1,5 месяцев, уничтожают только активную часть популяции клещей и только в одном сезоне [8]. Регулярное применение современных препаратов и усовершенствованных вакцин определило тенденцию к снижению инцидентности КЭ во второй половине последнего периода (Тпр. = -6,37 %).

Одновременно в практике началось применение вакцин последнего поколения. Ежегодно в Кемеровской области прививали 17-19 % детского и около 5 % взрослого населения. За 8 лет (2007-2014 гг.) против КЭ было вакцинировано более 250 тыс. человек, что соответствует 20 % населения области. Кроме школьников, вакцинации подлежали лица, профессиональная деятельность которых связана с риском нападения клещей, и жители сельских районов.

Особое внимание уделяли активной иммунизации школьников, так как, независимо от периода и уровня заболеваемости КЭ, группой максимального риска были дети в возрасте от 7 до 16 лет (средний многолетний показатель инцидентности — 23,39 %ooo [95% ДИ = 21,75-24,98]) (табл. 1). Доля вакцинированных среди них к 2014 году составила 52 %, среди взрослых — только 14 %. Вакцинация детей в комплексе с другими специфическими и неспецифическими мерами позволила снизить инцидентность школьников в 5,8 раз (с 8,46 %ooo [95% ДИ = 5,67-12,71] в 2007 году до 1,45 %»о [95% ДИ = 0,40-3,68] в 2014 году) (рис. 3).

Заболеваемость всего населения КЭ зависела от частоты нападения клещей. Установлена высокой силы прямая корреляционная связь между заболева-

ОК{едицина

в Кузбассе

Medicine

in Kuzbass

T. 14 № 4 2015

37

МНОГОЛЕТНЯЯ ЗАБОЛЕВАЕМОСТЬ КЛЕЩЕВЫМ ЭНЦЕФАЛИТОМ И ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ВОЗБУДИТЕЛЯ В КЕМЕРОВСКОЙ ОБЛАСТИ

Таблица 1

Заболеваемость клещевым энцефалитом (КЭ) разных возрастных групп в Кемеровской области в 1958-2014 гг. (на 100 тысяч)

Table 1

The incidence of tick-borne encephalitis in different age groups in the Kemerovo region, 1958-2014 (per 100 thousand)

Возрастные II период III период Средняя

группы Всего 1958- Всего 1990- в т.ч. 2004- I многолетняя

(годы) 1989 годы 2014 годы 2014 годы заболеваемость

0-1 0,20 1,66 1,8 0,98

2-6 7,39 12,98 5,62 11,70

7-16 11,99 27,27 8,54 23,39

17-40 4,10 10,49 6,94 7,67

41-60 3,30 9,25 6,42 6,82

61 и старше 1,13 7,03 5,02 4,46

Всего: 6,56 11,15 6,02 8,65

емостью КЭ и частотой обращений по поводу присасывания клещей (R = 0,99; p = 0,05).

Сельские жители на протяжении всего периода 1952-2014 годов болели КЭ чаще по сравнению с городскими. Средняя многолетняя заболеваемость жителей села в 2,3 раза выше, чем городского (6,64 %ooo [95% ДИ = 5,75-7,67] и 15,55 %ooo [95% ДИ = 14,1716,94], соответственно). Одна из причин такого различия — в 2,5 раза более частое нападение клещей на жителей сельской местности (3395,96 /Oooo [95% ДИ = 3327,13-3466,53]), по сравнению с городским (1351,45 %oooo [95% ДИ = 1308,35-1396,43]).

На протяжении многих лет в Кемеровской области проводится мониторинг зараженности клещей I. per-sulcatus вирусом клещевого энцефалита. Клещи I. рег-

sulcatus составляли 96,7 % от числа всех собранных особей и встречались во всех ландшафтно-географических зонах области. Средняя многолетняя виру-софорность за период 2005-2014 гг. составила 2,2 ±

0. 28 %. Вместе с тем, установлены различия уровня зараженности клещей вирусом клещевого энцефалита на разных административных территориях области, доля положительных проб колебалась от 0,8 % до 4,1 %. Выявлены изменения вирусофорности в многолетней динамике в пределах каждого района, что обусловлено особенностями жизненного цикла

1. persulcatus и их прокормителей.

Ранее проведенными исследованиями [10-13] установлено преобладание сибирского подтипа вируса клещевого энцефалита на территории Кемеровской области. Только в 1953-1963 гг. из 4-х изученных штаммов половина были отнесены к дальневосточному подтипу. Из 62 штаммов ВКЭ, выделенных в 19671970 гг., генотипированием установлена принадлежность подавляющего большинства (93,55 ± 3,1 %) к сибирскому подтипу, и 4 (6,45 %) оказались «микстштаммами», т.к. содержали генетические структуры сибирского и дальневосточного подтипов. В 2005 и 2008 гг. в клещах, собранных на территории области, обнаруживали только РНК ВКЭ сибирского генотипа [11, 13].

В клещах, собранных в 2014 г., обнаружен ВКЭ только сибирского генотипа (табл. 2). Но при этом следует отметить высокое разнообразие топовариан-тов вируса на изученной территории. Из шести ге-нотипированных изолятов ВКЭ 2014 года из Кемеровского района выявлены 4 образца (3.7, 7.4, 8.5, 78), относящиеся к азиатскому топоварианту: группе с прототипным штаммом Васильченко, 1 (377) — к европейскому топоварианту, 1 (294) — к новому ге-

Рисунок 3

Заболеваемость КЭ городского и сельского населения в Кемеровской области в 1952-2014 гг.

Figure 3

The incidence of tick-borne encephalitis in urban and rural areas in the Kemerovo region, 1952-2014

я

0)

4

o>

о

я

я

о

я

н

о

о

я

я

я

Н

о

о

я

О)

я

я

0>

ч

о

VO

я

со

80

70

60

50

40

30

20

10

1952-1957

Годовые периоды

□ Заболеваемость городского населения 0 Заболеваемость сельского населения

38

T. 14 № 4 2015 MediciinnLass

ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

Таблица 2

Анализируемые нуклеотидные последовательности РНК вируса клещевого энцефалита, изолированной из клещей в 2014 г. в Кемеровской области Table 2

The analyzed nucleotide sequences of TBEV RNA isolated from ticks in 2014 in Kemerovo region

новарианту, отличающемуся от всех изученных последовательностей ВКЭ сибирского генотипа на участке Е гена длиной 1396 н.п. минимум на 11 процентов по нуклеотидному составу. Аналогичный 294 образцу новый геновариант ВКЭ детектирован в пробе 25.4, изолированной также в 2014 г. из клещей, собранных в соседнем с Кемеровским Крапивинском районе области. Анализ аминокислотной последовательности Е гена РНК изолятов 25.4 и 294 показал, что выше указанные последовательности имеют лейцин в позиции 206, как и все штаммы сибирского генотипа, в позициях 234 и 448 — аспарагин и лейцин, соответственно, что характерно только для дальневосточного генотипа, в позиции 317 — аланин, и это совпадает с европейским генотипом. В позициях 189

ЛИТЕРАТУРА / REFERENCES:

1. Ammosov AD. Tick-borne encephalitis. Koltsovo: Vector-Best, 2002. 115 p. Russian (Аммосов А.Д. Клещевой энцефалит. Кольцово: Вектор-Бест, 2002. 115 с).

2. Zlobin VI, Malov IV, Kozlova IV et al. Prevention strategies encephalitis. Biopreparats. Prevention. Diagnosis. Treatment. 2010; 3(39): 27-29. Russian (Злобин В.И., Малов И.В., Козлова И.В. и др. Стратегии профилактики клещевого энцефалита //Биопрепараты. Профилактика. Диагностика. Лечение. 2010. № 3(39). С. 27-29).

3. Zlobin VI. Epidemiological monitoring and prevention of Ixodes tick-borne infections in combined natural foci and anthropurgic. Epidemiology and Vaccinal prevention. 2008; (2): 10-14. Russian (Злобин В.И. Эпидемиологический мониторинг и профилактика иксодовых клещевых инфекций в условиях сочетанных природных и антропургических очагов //Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2008. № 2. С. 10-14).

4. Zlobin VI. Modern epidemiological situation and the issues of prevention of tick-borne encephalitis in the Russian Federation. Abstracts: current situation and prospects of the fight against tick-borne infections in the XXI century. Tomsk. 2006: 50-51. Russian (Злобин В.И. Современная эпидемиологическая обстановка и вопросы профилактики клещевого энцефалита в Российской Федерации //Тезисы докладов: Современная ситуация и перспективы борьбы с клещевыми инфекциями в XXI веке. Томск. 2006. С. 50-51).

5. Gorchakovskii NN, Bondarev MP, Komandenko NI. Epidemiological evaluation of the effectiveness of the method of extermination of the carrier in the centers of tick-borne encephalitis. Abstracts of reports at the enlarged meeting of the Committee against tick-borne encephalitis February 8-10, 1962 in Kemerovo. Omsk. 1962: 61-64. Russian (Горчаковская Н.Н., Бондарева М.П., Команденко Н.И. Эпидемиологическая оценка эффективности метода истребления переносчика в очагах клещевого энцефалита //Авторефераты докладов на расширенном заседании комитета по борьбе с клещевым энцефалитом 8-10 февраля 1962 года в г. Кемерово. Омск. 1962. С. 61-64).

6. Naumov RL. Tick-borne encephalitis and Lyme disease: epizootologicheskie parallels and monitoring. Med. parazitol., 1999; (2): 20-26. Russian (Наумов Р.Л. Клещевой энцефалит и болезнь Лайма: эпизоотологические параллели и мониторинг //Мед. паразитол., 1999. № 2. С. 20-26).

7. Sokolov VM, Lysenko GV. The epidemiological situation of tick-borne encephalitis and measures for its prevention in the Kemerovo region. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2010; (4): 47-50. Russian (Соколов В.М., Лысенко Г.В. Эпидемиологическая ситуация по клещевому энцефалиту и мероприятия по его профилактике в Кемеровской области //Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2010. № 4. С. 47-50).

Изолят Источник изоляции Район Населенный пункт GenBank, NCBI

3.7 . persulcatus Кемеровский д. Верхотомка KR633022

7.4 . persulcatus Кемеровский д. Старочервово KR633012

61 . persulcatus Кемеровский д. Верхотомка KR633013

78 . persulcatus Кемеровский п. Ягуновка KR633018

294 . persulcatus Кемеровский д.Денисово KR633017

377 . persulcatus Кемеровский п. Кедровка KR633020

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

8.5 . persulcatus Гурьевский п. Сосновка KR633021

15.2 . persulcatus Ижморский с. Берикуль KR633015

25.4 . persulcatus Крапивинский Комаровка KR633016

33.2 . persulcatus Юргинский с. Верх-Тайменка KR633019

156 . persulcatus Топкинский г. Топки KR633014

и 278 выявлены уникальные отличия от всех вирусов группы флавивирусов млекопитающих, передающихся клещами, — аминокислота серин вместо аланина и глицина, соответственно. В Прокопьевском районе области, относящемся к южной части Кемеровской области, выявлены образцы из двух подгрупп азиатского топоварианта: кластер «Васильченко» (49, 67) и кластер «Заусаев» (134, 167). В Юргинском, Иж-морском, Топкинском районах, относящихся к самым северным границам Кемеровской области, обнаружены изоляты, относящиеся к кластеру «Заусаев».

Таким образом, на территории Кемеровской области в настоящее время выявлены все известные крупные кластеры сибирского генотипа: «Заусаев», «Васильченко» азиатского топоварианта и европейский топовариант, а также обнаружены два изолята, относящиеся к сибирскому генотипу, но удаленные от всех изученных штаммов на генетическое расстояние, более чем в 2 раза превышающее внутригенотипическую дивергенцию (уровень отличий на данном участке Е гена длиной 1276 н.п. для 73 штаммов ВКЭ сибирского генотипа составляет 5,1 ± 0,4 %) [10-14].

ВЫВОДЫ:

Установлено 3 периода с разными уровнями и тенденциями заболеваемости КЭ в Кемеровской области.

Группы высокого риска при КЭ — дети 7-16 лет и жители сельских районов.

Установлена эпидемиологическая эффективность акарицидных обработок эндемичных территорий в сочетании с массовой вакцинопрофилактикой населения.

В последнее десятилетие на территории Кемеровской области циркулирует вирус клещевого энцефалита только сибирского подтипа с высоким разнообразием топовариантов.

ОК{вдицина

в Кузбассе

Medicine

in Kuzbass

T. 14 № 4 2015

39

МНОГОЛЕТНЯЯ ЗАБОЛЕВАЕМОСТЬ КЛЕЩЕВЫМ ЭНЦЕФАЛИТОМ И ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ВОЗБУДИТЕЛЯ В КЕМЕРОВСКОЙ ОБЛАСТИ

8. Shashina NI. Ways to solve the problems in the Russian Federation, a nonspecific prevention of tick-borne encephalitis and other infections transmitted by ticks. Dezinfec. delo. 2005; (4): 24-30. Russian (Шашина Н.И. Пути решения в Российской Федерации проблем неспецифической профилактики клещевого энцефалита и других инфекций, передаваемых иксодовыми клещами //Дез. дело. 2005. № 4. С. 24-30).

9. Shashi NI, Guermant OM, Luboshnikova VM. About nonspecific prevention of tick-borne encephalitis in the beginning of the XXI century. Bulletin SB RAMS. 2007; (4): 111-115. Russian (Шашина Н.И., Германт О.М., Лубошникова В.М. О неспецифической профилактике клещевого энцефалита в начале XXI века //Бюллетень СО РАМН. 2007. № 4. С. 111-115).

10. Kolyasnikova NM. Monitoring of the tick-borne encephalitis virus population structure in the Urals, Western Siberia and north-western regions of Russia. Medical Science Candidate's Dissertation. Moscow, 2008. 199 p. Russian (Колясникова Н.М. Мониторинг структуры популяции вируса клещевого энцефалита в Уральском, Западно-Сибирском и Северо-Западном регионах России //Дис. канд. мед. наук. М., 2008. 199 с.).

11. Malenko GV, Pogodinа VV, Karan LS et al. Monitoring of tick-borne encephalitis virus population in the Kemerovo region and features a modern epidemic situation. Med. Virusology. Moscow. 2006; (23): 103-109. Russian (Маленко Г.В., Погодина В.В., Карань Л.С. и др. Мониторинг популяций вируса клещевого энцефалита в Кемеровской области и особенности современной эпидситуации //Мед. вирусология. М., 2006. Т. 23. С. 103-109).

12. Pogodine VV, Karan LS, Levine LS et al. 75th anniversary of the discovery of the virus encephalitis. Comparison of early (1937-1945) and modern strains. Vopr. Virusol. 2012: Supplement 1: 66-75. Russian (Погодина В.В., Карань Л.С., Левина Л.С. и др. 75-летие открытия вируса клещевого энцефалита. Сравнение ранних (1937-1945) и современных штаммов //Вопросы вирусологии. 2012. Приложение 1. C. 66-75).

13. Efimova AR, Karan LS, Drozdova OM et al. Tick-borne encephalitis in Kemerovo region: epidemiology and genetic diversity of the virus. Medical Virology. 2015: http://dx.doi.org/10.15610/29_1_1 (Ефимова А.Р., Карань Л.С., Дроздова О.М. и др. ^временная эпидемиологическая ситуация по клещевому энцефалиту и генетическое разнообразие ВКЭ на территории Кемеровской области //Медицинская вирусология. 2015. http://dx.doi.org/10.15610/29_1_1).

14. Gerasimov SG, Pogodn VV, Kolyasnikova NM et al. Interaction of the Siberian and Far Eastern subtypes of tick-borne encephalitis virus in mammals with mixed infection. I. Factors influencing the type of interaction. Vopr. Virusol. 2011; (2): 19-22. Russian (Герасимов С.Г., Погодина В.В., Колясни-кова Н.М. и др. Взаимодействие сибирского и дальневосточного подтипов вируса клещевого энцефалита при микстинфекции в организме млекопитающих. Факторы, влияющие на тип взаимодействия //Вопросы вирусологии. 2011. № 2. С. 19-22).

a

Статья поступила в редакцию 8.09.2015 г.

Сармометов Е.В., Сергевнин В.И., Микова О.Е., Зимина В.Н., Варецкая Т.А., Шмагин Д.В.

Пермский краевой центр по борьбе и профилактике со СПИД и инфекционными заболеваниями, Пермский государственный медицинский университет имени академика Е.А. Вагнера,

г. Пермь

Российский университет дружбы народов,

г. Москва

ЧАСТОТА КОНТАМИНАЦИИ МИКОБАКТЕРИЯМИ ТУБЕРКУЛЕЗА ПРОИЗВОДСТВЕННОЙ СРЕДЫ МЕДИЦИНСКОЙ ОРГАНИЗАЦИИ, ОКАЗЫВАЮЩЕЙ ПОМОЩЬ ПАЦИЕНТАМ С ВИЧ-ИНФЕКЦИЕЙ

Предмет исследования. 356 смывов с объектов производственной среды пяти медицинских организаций (поликлиника Центра СПИД, противотуберкулезный стационар для лечения больных с ВИЧ-негативным статусом, стационар для лечения больных ВИЧ-инфекцией, центр лечения и реабилитации лиц, страдающих наркоманией и алкоголизмом, поликлиника общего профиля).

Цель исследования. Изучить частоту контаминации микобактериями туберкулеза производственной среды медицинской организации, оказывающей помощь пациентам с ВИЧ-инфекцией.

Методы исследования. Молекулярно-генетическое исследование смывов на наличие ДНК микобактерий туберкулеза (МБТ) осуществляли с помощью прибора «Система детекции продуктов ПЦР в реальном времени CFX-96-TOUCH «Bio Rad». Использовали тест систему «Амплитуб».

Основные результаты. По данным молекулярно-генетических исследований смывов установлена широкая циркуляция МБТ в поликлинике Центра СПИД, в меньшей степени - в противотуберкулезном стационаре для больных с ВИЧ-негативным статусом. Микробную контаминацию стационара для лечения больных ВИЧ-инфекцией, центра лечения и реабилитации лиц, страдающих наркоманией и алкоголизмом, также регистрировали, но она встречалась значительно реже. В поликлинике общего профиля ДНК МБТ не было обнаружено. Повышенный уровень контаминации микобактериями производственной среды поликлиники Центра СПИД по сравнению с противотуберкулезным стационаром может указывать на то, что контагиозность больных туберкулезом, сочетанным с ВИЧ-инфекцией, более высокая в сравнении с больными туберкулезом с ВИЧ-негативным статусом.

Ключевые слова: медицинские организации, обслуживающие и не обслуживающие ВИЧ-инфицированных; смывы с объектов производственной среды; частота выделения ДНК микобактерий туберкулеза.

40

T. 14 № 4 2015

Medicine

in Kuzbass

в Кузбассе

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.