Научная статья на тему 'Генетические маркеры патогенности и антибиотикорезистентности штаммов s. еpidermidis и s. аигеш, изолированных из различных биотопов'

Генетические маркеры патогенности и антибиотикорезистентности штаммов s. еpidermidis и s. аигеш, изолированных из различных биотопов Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
423
115
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ГЕНЫ ПАТОГЕННОСТИ / ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ДЕТЕРМИНАНТЫ / МЕТИЦИЛЛИНРЕЗИСТЕНТНОСТЬ / PATHOGENICITY GENES / GENETIC DETERMINANTS / METHICILLIN RESISTANCE

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Шаркова Валентина Александровна, Лайман Елена Федоровна

Настоящее исследование посвящено мониторированию штаммов Staphylococcus spp (S. epidermidis — 51 штамм и S. aureus — 48), изолированных из различных биотопов на присутствие генетических детерминант (fnbpA, fnbpB, luc PVS, mecA). В динамике исследования отмечен рост частоты обнаружения генов патогенности и сочетаний гено-вариантов. У штаммов S. aureus патогенность генетически детерминирована в 81,8 % случаев, S. epidermidis — 4 % (изолированы из операционных ран). Штаммы S. epidermidis, выделенные из микрофлоры медицинского персонала отделений хирургического профиля, обнаруживали гены патогенности в 14,3 % случаев (геновариант fnbpB, luc PVS), S. aureus 85 %, с сочетанием геновариантов (fnbpA, fnbpB) в 100 %, как и штаммы из операционных ран, но в отличие от последних не обнаруживали ген luc PVS. В послеоперационных ранах генетические детерминанты обнаружены с меньшей частотой (по 50 % у обоих видов). В микрофлоре внешней среды обнаружены гены патогенности лишь у S. epidermidis (11,1 %). Ген метициллинрезистентности обнаружен у штаммов S. aureus и S. epidermidis, изолированных из различных биотопов. Анализ распространенности генетических детерминант патогенности подтверждает рост патогенности клинических изолятов в динамике изучения раневых инфекций, позволяет судить о горизонтальном переносе luc PVS. Амплификация jhbpA, fnbpB, luc PVS, тес А служит объективным критерием при оценке эпидемиологического значения выявления изолятов различных видов рода Snaphyloccocus.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Шаркова Валентина Александровна, Лайман Елена Федоровна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Pathogenesis genetic markers and antibiotic-resistance of S. epidermidis and S. aureus isolated from different bioptates

The present study is devoted to monitoring the strain of Staphylococcus spp (S. epidermidis — 51 strain and S. aureus — 48), isolated from different bioptates to define the genetic determinants (fnbpA, fnbpB, luc PVS, mecA). In the process of investigation we observed the growth of pathogenicity genes occurrence and genovariant combinations. The strain S. aureus has genetically determinated pathogenicity in 81,8 % cases, S. epidermidis 4 % (isolated from operative wounds). The strains S. epidermidis, isolated from the micro flora of surgery departments’ medical personnel, contained pathogenicity genes in 14,3 %> cases (genovariant fnbpB, luc PVS), S. aureus 85 %, in combination with genovariants (fnbpA, fnbpB) in 100 %, as well as the strains from operative wounds, but in contrast to the latter, they didn’t reveal the luc PVS gene. In postoperative wounds genetic determinants are found with less occurrence (50 %> each species)/ In the micro flora of the environment there are pathogenicity genes only within S. epidermidis (11,1 %). The gene of methicillin resistance is found only within the strains S. aureus and S. epidermidis, isolated from different bioptates. The analysis of pathogenicity of genetic determinants proves the growth of pathogenicity of clinical isolates in the process of wound infection investigation, it helps to make a conclusion about horizontal shift of luc PVS. The amplification of fnbpA, fnbpB, luc PVS, mec A serves an objective criterion for the assessment of epidemiological significance of detected isolates of different types within the species of Staphylococcus.

Текст научной работы на тему «Генетические маркеры патогенности и антибиотикорезистентности штаммов s. еpidermidis и s. аигеш, изолированных из различных биотопов»

Инфекционные болезни,

иммунология, иммунотерапия

УДК: 579.252.5:579.861.2 В.А. Шаркова1, Е.Ф. Лайман2

ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ ПАТОГЕННОСТИ И АНТИБИОТИКОРЕЗИСТЕНТНОСТИ ШТАММОВ EPIDERMIDIS И S. AUREUS, ИЗОЛИРОВАННЫХ ИЗ РАЗЛИЧНЫХ БИОТОПОВ

1 Тихоокеанский государственный медицинский университет, 690950, пр. Острякова, 2, e-mail: vgmu@mail.ru, г. Владивосток; 2Филиал ФГБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Приморском крае в городе Лесозаводске», 692091, ул. Колхозная, 17, e-mail: kirovka@fguzpk.ru, п. Кировский Приморского края

Резюме

Настоящее исследование посвящено мониторированию штаммов Staphylococcus spp (S. epidermidis - 51 штамм и S. aureus - 48), изолированных из различных биотопов на присутствие генетических детерминант (fnbpA, fnbpB, luc PVS, mecA). В динамике исследования отмечен рост частоты обнаружения генов патогенности и сочетаний гено-вариантов. У штаммов S. aureus патогенность генетически детерминирована в 81,8 % случаев, S. epidermidis - 4 % (изолированы из операционных ран). Штаммы S. epidermidis, выделенные из микрофлоры медицинского персонала отделений хирургического профиля, обнаруживали гены патогенности в 14,3 % случаев (геновариантfnbpB, luc PVS), S. aureus - 85 %, с сочетанием геновариантов (fnbpA, fnbpB) в 100 %, как и штаммы из операционных ран, но в отличие от последних не обнаруживали ген luc PVS. В послеоперационных ранах генетические детерминанты обнаружены с меньшей частотой (по 50 % у обоих видов). В микрофлоре внешней среды обнаружены гены патогенности лишь у S. epidermidis (11,1 %). Ген метициллинрезистентности обнаружен у штаммов S. aureus и S. epidermidis, изолированных из различных биотопов. Анализ распространенности генетических детерминант патогенности подтверждает рост патогенности клинических изолятов в динамике изучения раневых инфекций, позволяет судить о горизонтальном переносе luc PVS. Амплификация jhbpA, fnbpB, luc PVS, тес А служит объективным критерием при оценке эпидемиологического значения выявления изолятов различных видов рода Snaphyloccocus.

Ключевые слова: гены патогенности, генетические детерминанты, метициллинрезистентность.

V.A. Sharkova1, E.F. Laiman2

PATHOGENESIS GENETIC MARKERS AND ANTIBIOTIC-RESISTANCE OF S. EPIDERMIDIS AND S. AUREUS ISOLATED FROM DIFFERENT BIOPTATES

1Pasific State Medical University;

2Lesozavodsk filiation FSOH «Center of hygiene and epidemiology in Primorsky region», s. Kirovsky

Summary

The present study is devoted to monitoring the strain of Staphylococcus spp (S. epidermidis - 51 strain and S. aureus - 48), isolated from different bioptates to define the genetic determinants (fnbpA, fnbpB, luc PVS, mecA). In the process of investigation we observed the growth of pathogenicity genes occurrence and genovariant combinations. The strain S. aureus has genetically determinated pathogenicity in 81,8 % cases, S. epidermidis - 4 % (isolated from operative wounds). The strains S. epidermidis, isolated from the micro flora of surgery departments' medical personnel, contained pathogenicity genes in 14,3 %> cases (genovariant fnbpB, luc PVS), S. aureus - 85 %, in combination with genovariants (fnbpA, fnbpB) in 100 %, as well as the strains from operative wounds, but in contrast to the latter, they didn't reveal the luc PVS gene. In postoperative wounds genetic determinants are found with less occurrence (50 %> each species)/ In the micro flora of the environment there are pathogenicity genes only within S. epidermidis (11,1 %). The gene of methicillin resistance is found only within the strains S. aureus and S. epidermidis, isolated from different bioptates. The analysis of pathogenicity of genetic determinants proves the growth of pathogenicity of clinical isolates in the process of wound infection investigation, it helps to make a conclusion about horizontal shift of luc PVS. The amplification offnbpA, fnbpB, luc PVS, mec A serves an objective criterion for the assessment of epidemiological significance of detected isolates of different types within the species of Staphylococcus.

Key words: pathogenicity genes, genetic determinants, methicillin resistance.

Актуальность проблемы инфекций, вызванных грамположительными микроорганизмами, во всем мире неуклонно возрастает. Стафилококки являются возбудителями значительной части внебольничных и нозокомиальных бактериемии, пневмоний, инфекций кожи и мягких тканей, костей и суставов. Стафилококковые бактериемии у госпитализированных пациентов, развивающиеся при проникновении S. aureus через катетеры из ран или очагов кожных поражений, -главный фактор патогенеза широкого спектра поражений [1, 2, 5, 6]. Распространение стафилококков в лечебных учреждениях приводит к гнойно-септическим осложнениям в хирургических стационарах, нередко сводя на нет результат прекрасно выполненной операции [10]. Стафилококки - представители нормальной микрофлоры кожи человека, дыхательных путей и пищеварительного тракта, их также постоянно обнаруживают в воздухе и окружающей среде [7]. Типичными для эпидермального стафилококка считаются поражения, обусловленные колонизацией S. epidermi-dis различных протезов, катетеров, дренажей или дис-семинированием возбудителя после хирургических вмешательств [4]. Патогенность стафилококков является результатом скоординированной деятельности нескольких выделяемых ими токсинов и ферментов, а также большого количества белков на бактериальной поверхности, которые связывают внеклеточные матричные и плазменные белки организма человека. Обращает на себя внимание, что скоординированное действие этих факторов является экологическим показателем и для проявления их действия на макроуровне, изолят с большой долей вероятности будет экспресси-ровать представителей всех групп факторов патоген-ности [9]. Обычно адгезивный потенциал S. aureus связывают со специфическими адгезинами (FnbpA и - В), которые у данного вида сгруппированы в так называемое семейство адгезивных матриксных молекул (MSCRAMMs). У другого вида стафилококков (S. epidermidis) он обусловлен полисахаридными адгезинами (PIA), обеспечивающими адгезивные свойства этих штаммов к эукариотическим клеткам [9, 11].

Особое значение имеет распространение стафилококков, резистентных к метициллину (или к оксацил-лину) [10, 12]. Эти особенности стафилококков служат причиной существенного ограничения выбора антибактериальных препаратов для лечения инфекций, вызванных данными микроорганизмами [4]. Большинство исследований указывает на наличие резистентности у 25 % S. aureus и более чем у 50 % коагулазонегативных стафилококков. Резистентность стафилококка связана с наличием гена тес А, кодирующего белок ПСБ2а, который обладает низкой аффинностью к ß-лактамам [3]. Стафилококки, несущие модифицированные пеницил-линсвязывающие белки, обозначаются как метицил-лин (оксациллин)-резистентные S. aureus (MRSA) и S. epidermidis (MRSE) [4]. Из многих штаммов S. aureus, устойчивых к метициллину, самый опасный - MW2 (возник из чувствительного к метициллину MRSA), провоцирующий многие заболевания. Составляющие ДНК MW2, в свою очередь, приводят к появлению генов, кодирующих три эндотоксина, включая PVL или (Panton-Valentine leukocidin). Лейкоцидин Пантона-

Валентайна представляет собой двухкомпонентный лейкоцитный токсин, который имеет отношение как к патофизиологии инфекции кожи, так и к некротической пневмонии и представляет собой основную угрозу здоровым людям всех возрастов по всему миру. PVL произведен из генетического материала бактериофага, который заражает S. aureus, делая его более вирулентным [13].

Таким образом, определение патогенного и антибио-тикорезистентного потенциала стафилококка является актуальным в терапии, профилактике и диагностике инфекционного, в том числе раневого, процесса.

Целью нашей работы явилось определение генов патогенности и антибиотикорезистентности штаммов S. epidermidis и S. aureus, выделенных из различных биотопов: операционных и послеоперационных ран, окружающей среды отделений хирургического профиля, медицинского персонала.

Материалы и методы

На присутствие генетических детерминант исследовались S. aueus и S. epidermidis, у которых определяли маркеры вирулентности методом ПЦР - РВ (ООО «Синтол») с наборами специфических праймеров к 3 генам патогенности: fnbpA, fnbpB, кодирующих поверхностные фибронектин-связывающие белки, играющие важную роль в способности стафилококков колонизировать ткани организма человека и образовании биопленок, лейкоцидин Que PVS), обусловливающий цитотоксическое действие на полиморфноядерные лейкоциты и гену тес А, кодирующий дополнительный пенициллинсвязывающий белок и обеспечивающий устойчивость к бета-лактамным антибиотикам [3, 4, 8].

Для проведения исследований использовали прибор с системной детекцией флуоресцентного сигнала в режиме «реального времени «Rotor-Gene» 6 000. Амплификацию вели согласно схеме, воспроизведенной в инструкции к набору реагентов.

Результаты и обсуждение

Исследовано 48 штаммов S. aureus и 51 штамм S. epidermidis, изолированных из операционных и послеоперационных ран, верхних дыхательных путей медперсонала, внешней среды. Гены патогенности обнаружены в 81,8 % штаммов S. aureus, 4 % S. epidermidis, изолированных из операционных ран. S. Aureus, выделенный из «условно чистых» и «грязных ран», обнаруживал гены fnbpA и fnbpB с одинаковой частотой (по 81,8 % ), ген luc PVS - 5,2 %. Последний выявлялся реже, но является маркерным событием для повышения патогенности штаммов микроба и соответственно для развития инфекционного процесса в ране. Из 25 штаммов S. epidermidis, выделенного из «условно чистой раны», ген патогенности fnbpA обнаружен у одного штамма. Возможно, данное представительство связано с мутацией соответствующего участка в силу воздействия селективных факторов. Штаммы S. aureus имели только сочетания генов по два (fnbpA, fnbpB) или три (fnbpA, fnbpB, luc PVS) (88,9 % и 11,1 %, соответственно). В послеоперационных ранах генетические детерминанты обнаружены с меньшей частотой

(по 50 % штаммов у обоих исследованных видов). Все маркеры патогенности, выявленные из послеопераци-оных ран находились в сочетаниях по два (fnbpA, fn-bpB; fnbpB, luc PVS) или три (fnbpA, fnbpB, luc PVS) с преобладанием (fnbpA, fnbpB) у S. epidermidis в 80 %. Прочие 20 % штаммов эпидермального стафилококка носили сочетания детерминант (fnbpA, fnbpB, luc PVS). Единственный штамм золотистого стафилококка, изолированный из послеоперационной раны носил сочетания маркеров патогенности (fnbpB, luc PVS).

Штаммы S. aureus, выделенные из микрофлоры медицинского персонала отделений хирургического профиля, содержали гены патогенности в 85 % случаев, с сочетанием геновариантов (fnbpA, fnbpB) в 100 %), как и штаммы из операционных ран, но в отличие от последних не обнаруживали ген luc PVS. S. epidermidis обнаруживал гены патогенности у медицинского персонала в 14,3 % случаев (геновариант fnbpB, luc PVS).

В микрофлоре внешней среды стационаров хирургического профиля гены патогенности у S. aureus не обнаружены, у S. Epidermidis - 11,1 %. Один штамм S. epidermidis, обнаруженный в воздухе, из 24 исследованных стафилококков, содержал ген fnbpA, который не был отмечен у микроорганизмов, изолированнных со слизистых медперсонала.

Ген метициллинрезистентности обнаружен у 18,2 % штаммов S. aureus, 24 % штаммов S. epidermi-dis, изолированных из операционных ран. В послеоперационных ранах генетические детерминанты анти-биотикорезистенности обнаружены в 10 % штаммов только S. epidermidis.

Штаммы S. aureus., выделенные из микрофлоры медицинского персонала содержали ген тес-А в 10 % случаев. При этом S. epidermidis обнаруживал ген тес-А у медицинского персонала в 4 раза чаще (42,9 %). Обнаружение генов метициллинрезистентно-сти в микрофлоре внешней среды стационаров хирургического профиля составило по 33,3 % у штаммов S. epidermidis и 40 % - S. aureus.

Стафилококки - распространенное семейство бактерий. Они присутствуют у большинства людей и являются частью нормальной микрофлоры кожных покровов, слизистых оболочек и нижнего отдела кишечника. Носительство стафилококка чаще наблюдается у медицинского персонала. Заражение стафилококком в больницах и роддомах происходит воздушно-капельным путем и через загрязненные руки медицинского персонала. Возможна передача инфекции с инструментами, катетерами, перевязочным материалом, предметами ухода, а также пищей. В наших исследованиях в отношении S. aureus прослеживается влияние на операционную рану микрофлоры медицинского персонала. Удельный вес обнаруженных в операционной ране и во внешней среде сочетаний генов патогенности (fn-bpA, fnbpB) практически одинаков 81,8 % и 85 % соответственно. В отношении S. epidermidis прослеживается влияние на операционную рану микрофлоры внешней среды. Причем в изолятах внешней среды маркер гена fnbpA выявлен с удельным весом в 2,8 раза большим, чем из операционных ран. У штаммов

S. epidermidis обнаружились сочетания fnbpB и Luc PVS, обеспечивающие микроорганизмы наибольшим патогенным потенциалом, как у изолированных из послеоперационных ран, так и от медперсонала (10 %) и 14,3 %, соответственно), свидетельствующие о возможном внебольничном происхождении штаммов, но не исключающие большую опасность S. epidermidis [4, 13]. В целом маркер лейкоцидина обнаруживался у обоих видов (S. aureus и S. epidermidis) с практически одинаковой частотой 4,2 % и 3,9 % (соответственно), что может свидетельствовать о его горизонтальном переносе среди родственных видов.

С конца 90-х годов прошлого века в стационарах России отмечается рост частоты выделения MRSA, которая в ряде больниц достигла 30-70 %, что делает неэффективным использование многих антимикробных препаратов и существенно ухудшает качество оказания медицинской помощи населению. В этих условиях совершенствование методов эпидемиологического и микробиологического мониторинга, направленных на выявление эпидемически значимых штаммов, приобретает все более актуальное значение. В целом обнаруженный нами удельный вес MRSA в хирургическом стационаре составил 20,8 %, MRSE - 25 %, что подчеркивает превалирование метициллинрезистент-ности у штаммов эпидермального стафилококка как резервуара генов резистентности для S. aureus [4].

Выводы

Гены факторов патогенности штаммов Staphylococcus spp., выделенных из операционных, послеоперационных ран обнаруживаются (по данным мониторинга) в последние годы с высокой частотой, в особенности гены адгезии, играющие в инфекционном процессе ключевую роль. Настораживает обнаружение у изоля-тов биоматериала генетических детерминант лейкоци-дина, являющихся маркерами тяжелых инфекционных процессов. В связи с этим, амплификация (fnbpA, fnbpB, luc PVS) может использоваться для подтверждения патогенности клинических изолятов, а также служить объективным критерием при оценке эпидемиологического значения изолятов различных видов рода Sna-phyloccocus.

Анализ распространенности генетических детерминант патогенности подтверждает рост патогенности клинических изолятов S. epidermidis и S. aureus в динамике изучения раневых инфекций, позволяет использовать их в качестве маркеров S. aureus в микробиологическом мониторинге микробиоценоза операционной раны, позволяет судить о горизонтальном переносе luc PVS. Очевиден факт, что существующие различия факторов патогенности у различных штаммов, обусловливают изменения в патогенезе инфекционного процесса, вызванного стафилококками.

Гены устойчивости к метициллину у штаммов S. epidermidis, обнаруживались несколько чаще, особенно у изолированных из биопроб, что свидетельствует о роли эпидермального стафилококка в передаче подвижного генетического элемента тес А золотистому стафилококку.

Литература

1. Абаев Ю.К., Гудкова Е.И., Адарченко А.А., Ласточкина Т.М. Возбудители хирургической инфекции у детей: устойчивость к антибиотикам и ее динамика // Детская хирургия. - 2006. - С. 21—24.

2. Бухарин О.В., Усвяцов Б.Я., Карташова О.Л. Биология патогенных кокков. - М. : Медицина; Екатеринбург : УрО РАН, 2002. - 281 с.

3. Зайцев А.А., Карпов О.И., Сидоренко СВ. Стафилококки и ванкомицин: тенденции и противостояния // Антибиот. и химиотер. - 2003. - № 6. - С. 20—26.

4. Карпов И.А., Качанко Е.Ф. Стафилококковая инфекция: клинические аспекты и перспективы терапии // Медицинские новости. - 2005. - № 9. - С. 53—56.

5. Кунда М.С., Воронина О.Л., Дмитренко О.А., Лунин В.Г. Молекулярно-генетический подход в анализе внутрибольничной стафилококковой инфекции, вызванной КОС в учреждениях родовспоможения // Молекулярная диагностика: сборник трудов всероссийской научно-практической конференции с международным участием / колл. авт., под ред. В.И. Покровского. - Т. 2. - М., 2010. - С. 410-413.

6. Лайман Е.Ф., Шаркова В.А., Баранова Н.А и др. Случай обнаружения S. enteritidis в послеоперационной ране // Дальневосточный медицинский журнал. -2011. - № 4. - С. 104-109.

7. Рахманова С.Н., Шаркова В.А., Юцковский А.Д. Структура и иерархия таксономических групп микрофлоры кожи больных УБ в Приморском крае // Тихоокеанский медицинский журнал. - 2011. - № 3. -С. 34-36.

8. Скачкова Т.С, Черневская Е.А., Дмитриева И.Б. и др. Разработка и апробация методики выявления и количественного определения метициллинезистентным методом ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией продуктов амплификации // Молекулярная диагностика. - 2010 (сборник трудов всероссийской научно-практической конференции с международным участием), Москва. - 2010. - Т. 2. - С. 424-430.

9. Тюрин Ю.А., Долбин Д.А. Роль факторов пато-генности золотистых стафилококков в развитии ато-пического дерматита // Журнал микробиол. - 2008. -№ 4. - C. 105-110.

10. Шаркова В.А., Лайман Е.Ф., Мазур М.Е. и др. Молекулярно-генетический мониторинг метицили-нустойчивых штаммов Staphylococcus spp // KMAX-2012.

11. Шаркова В.А., Лайман Е.Ф., Мазур М.Е. и др. Молекулярно-генетическая характеристика патоген-ности штаммов Staphylococcus spp., изолированных из операционных ран // Международный журнал экспериментального образования. - 2012. - № 7. -С. 69.

12. Bootsma М.С., Diekmann О., Bonten M.J. Controlling methicillin-resistant Staphylococcus aureus quantifying the effects of interventions and rapid diagnostic testing. Proc. Natl. Acad. Sci USA 2006; 103(14):5620-5625.

13. Moellering R.C, Abbott G.F., Ferraro M.J. Case 2-2011 - A 30-Year-0ld Woman with Shock after Treatment of a Furuncle. N. Engl. J. Med. 2011;364:266-275.

Координаты для связи с авторами: Лайман Елена Федоровна - зав. микробиологической лабораторией, врач-бактериолог Лесозаводского филиала ФБУЗ «Центр гигиены эпидемиологии в Приморском крае», аспирант кафедры микробиологии и вирусологии ТГМУ, тел.: 8-(42354)-21-254, +7-914-712-40-97, e-mail: laimanss@ fiiail.ru; Шаркова Валентина Александровна - д-р мед. наук, профессор, зав. кафедрой микробиологии и вирусологии ТГМУ, тел. +7-964-437-70-55, e-mail: valexsh@mail.ru.

□□□

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.