Научная статья на тему 'Анализ В-клеточных эпитопов гемагглютинина вирусов гриппа'

Анализ В-клеточных эпитопов гемагглютинина вирусов гриппа Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
960
133
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Acta Naturae (русскоязычная версия)
WOS
Scopus
ВАК
RSCI
PubMed
Ключевые слова
ВИРУС ГРИППА / ГЕМАГГЛЮТИНИН / КОНФОРМАЦИОННЫЕ ЭПИТОПЫ / МОНОКЛОНАЛЬНЫЕ АНТИТЕЛА ШИРОКОГО СПЕКТРА ДЕЙСТВИЯ / ОДНОДОМЕННЫЕ АНТИТЕЛА ШИРОКОГО СПЕКТРА ДЕЙСТВИЯ

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Щербинин Д.Н., Алексеева С.В., Шмаров М.М., Смирнов Ю.А., Народицкий Б.С.

Вакцинация давно и успешно применяется для профилактики гриппа. Основным антигеном со временных гриппозных вакцин является гемагглютинин (НА) вируса гриппа, вызывающий гуморальный иммунный ответ в организме человека и защищающий от гриппа. Однако периодически появляются новые сезонные и пандемические варианты вируса с измененной структурой НА. Это позволяет возбудителю избегать нейтрализации антителами, которые образовались в ответ на ранее проведенную вакцинацию. Разработка вакцины с новыми вариантами НА в качестве антигена занимает продолжительное время, поэтому в период эпидемии важно иметь в качестве профилактики и терапии средства для пассивной иммунизации, которыми могут служить моноклональные или однодоменные антитела с универсальной специфичностью (широкого спектра действия). В качестве универсальных антител рассматривают анти тела к консервативным эпитопам антигенов вируса гриппа. Мы попытались охарактеризовать основные В-клеточные эпитопы гемагглютинина и обобщить собственные и опубликованные данные об антителах с широкой нейтрализующей активностью. С использованием различных баз данных проведен компью терный анализ наиболее известных конформационных эпитопов НА вирусов гриппа. Результаты анализа свидетельствуют, что мишенью поиска и создания антител широкого спектра действия к вирусу гриппа может быть стержневая часть молекулы HA, антитела к которой обладают выраженной гетеросубтипиче ской активностью.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Щербинин Д.Н., Алексеева С.В., Шмаров М.М., Смирнов Ю.А., Народицкий Б.С.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Анализ В-клеточных эпитопов гемагглютинина вирусов гриппа»

ОБЗОРЫ

УДК 578.74

Анализ В-клеточных эпитопов гемагглютинина вирусов гриппа

Д. Н. Щербинин*, С. В. Алексеева, М. М. Шмаров, Ю. А. Смирнов, Б. С. Народицкий, А. Л.Гинцбург

Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии

им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской

Федерации, 123098, Москва, ул. Гамалеи, 18

*E-mail: dim284@inbox.ru

Поступила в редакцию 16.08.2015

Принята к печати 09.12.2015

РЕФЕРАТ Вакцинация давно и успешно применяется для профилактики гриппа. Основным антигеном современных гриппозных вакцин является гемагглютинин (НА) вируса гриппа, вызывающий гуморальный иммунный ответ в организме человека и защищающий от гриппа. Однако периодически появляются новые сезонные и пандемические варианты вируса с измененной структурой НА. Это позволяет возбудителю избегать нейтрализации антителами, которые образовались в ответ на ранее проведенную вакцинацию. Разработка вакцины с новыми вариантами НА в качестве антигена занимает продолжительное время, поэтому в период эпидемии важно иметь в качестве профилактики и терапии средства для пассивной иммунизации, которыми могут служить моноклональные или однодоменные антитела с универсальной специфичностью (широкого спектра действия). В качестве универсальных антител рассматривают антитела к консервативным эпитопам антигенов вируса гриппа. Мы попытались охарактеризовать основные В-клеточные эпитопы гемагглютинина и обобщить собственные и опубликованные данные об антителах с широкой нейтрализующей активностью. С использованием различных баз данных проведен компьютерный анализ наиболее известных конформационных эпитопов НА вирусов гриппа. Результаты анализа свидетельствуют, что мишенью поиска и создания антител широкого спектра действия к вирусу гриппа может быть стержневая часть молекулы HA, антитела к которой обладают выраженной гетеросубтипиче-ской активностью.

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА вирус гриппа, гемагглютинин, конформационные эпитопы, моноклональные антитела широкого спектра действия, однодоменные антитела широкого спектра действия.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ НА - гемагглютинин вируса гриппа; H1-H18 - подтипы гемагглютинина вируса гриппа.

ВВЕДЕНИЕ

Гемагглютинин (НА) - основной антигенный компонент вирусов гриппа, представляет собой гомотри-мерный поверхностный гликопротеин с грибопо-добной формой, мономер которого состоит из двух фрагментов, связанных дисульфидным мостиком: HA1 (330 аминокислот) - глобулярная часть, дис-тальная от вирусной мембраны, и HA2 (220 аминокислот) - стержневая часть, закрепленная в вирусной мембране. В природе найдено 18 подтипов НА вирусов гриппа А [1].

Вируснейтрализующие антитела, индуцированные HA, составляют основу гуморального иммунитета, защищающего организм человека от гриппозной инфекции [2]. Антигенная структура HA постоянно изменяется в результате селективного давления иммунной системы организма-хозяина,

что приводит к появлению и селекции новых вариантов вируса, способных избегать нейтрализующего эффекта существующих антител и преодолевать специфическую иммунную защиту человека. Этот механизм - антигенный дрейф - снижает эффект противогриппозной вакцинации [3]. При появлении пандемических штаммов вируса гриппа А, когда вирус с новым антигенным подтипом НА попадает в человеческую популяцию (антигенный шифт) [2, 4], существующие вакцины оказываются неэффективными. Эти обстоятельства объясняют необходимость поиска новых подходов к созданию противогриппозных препаратов с широким спектром активности [5]. Один из таких подходов - поиск и характеристика консервативных антигенных детерминант в молекуле НА вируса гриппа, получение нейтрализующих антител широкого спектра действия. Такие антите-

ла могут использоваться для экстренной пассивной иммунизации или терапии при проведении противоэпидемических мероприятий.

Молекулярные исследования антигенной структуры НА показали, что участки, взаимодействующие с антителами, расположены главным образом в глобулярном домене субъединицы НА1 [6]. Аминокислотные последовательности данных сайтов чрезвычайно вариабельны и различаются не только у разных подтипов HA, но и внутри одного подтипа. В субъединице HA2 обнаружены консервативные детерминанты [7-10]. Эти данные позволили предположить, что консервативные антигенные сайты в молекуле НА могут индуцировать образование антител с широкой перекрестно нейтрализующей активностью. Это предположение подтверждено Y. Okuno и соавт. [11], которые впервые получили и охарактеризовали моноклональное антитело к НА подтипа Н2, обладающее нейтрализующей активностью в отношении штаммов вирусов гриппа A с НА Н2 и H1. Это моноклональное антитело (С179) распознает конфор-мационный эпитоп в стержневом регионе молекулы НА, консервативный у вирусов гриппа А подтипов Н2 и H1. Известно, что вирусы гриппа птиц подтипов Н5 и Н6 филогенетически близки к штаммам подтипов H1 и Н2 [12, 13]. Широкий спектр действия мышиного антитела С179 выявлен в НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского и показано, что это антитело реагирует с вирусами подтипов Н1, Н2 и Н5 (и даже с НА подтипа Н6 в его не вполне зрелой форме) [14, 15].

В качестве многообещающего средства пассивной иммунизации против гриппа рассматривают одно-доменные антитела. Однодоменные антитела малы, стабильны и просты в производстве. Показано, что интраназальное введение полученных от ламы одноцепочечных фрагментов вариабельных доменов иммуноглобулинов, обладающих нейтрализующей активностью in vitro против вирусов гриппа H5N1, могут контролировать репликацию вируса, а также снижать заболеваемость и смертность мышей, зараженных вирусом гриппа H5N1. Хотя исследование было сосредоточено на однодоменных антителах, которые распознают эпитоп около домена связывания с рецептором, подчеркивается принципиальная возможность отбора молекул антител широкого спектра действия, которые связываются с другими эпитопа-ми НА, в том числе консервативными [16].

В другой работе получено однодоменное антитело к НА вируса гриппа А и сконструирован рекомби-нантный аденовирус, экспрессирующий данное антитело. Введение такого рекомбинантного аденовируса в интервале от 48 ч до 14 дней до заражения способно полностью защищать мышей от вируса гриппа А [17].

Таким образом, совершенно очевидна необходимость поиска средств пассивной иммунизации с универсальной специфичностью, которые позволяют преодолеть антигенную изменчивость вируса гриппа [18].

Возможно, что направление поиска путей пассивной иммунизации, обеспечивающей защиту от широкого спектра вирусов гриппа, начатое совместно японскими и российскими учеными и продолжаемое сейчас в ряде лабораторий, окажется наиболее перспективным.

АНТИТЕЛА К ГЛОБУЛЯРНОЙ ЧАСТИ МОЛЕКУЛЫ НА

Наибольшее количество вируснейтрализующих антител, вырабатываемых естественным или искусственным путем, связывается с глобулярной частью НА, что приводит к блокированию прикрепления вирионов к клеткам. Однако вследствие того, что ген HA быстро мутирует, возникают аминокислотные замены, которые приводят к формированию новых сайтов гликозилирования, что, в свою очередь, вызывает изменения поверхностной структуры белка. Следовательно, эти антигенные сайты высоковариабельны и антитела к ним штаммоспе-цифичны. Отчасти это объясняет, почему иммунитет после натурального заражения или вакцинации в основном ограничивается циркулирующим штаммом. Например, антитела 2D1, связывающие Sa-антигенный сайт, расположенный в глобулярной части молекулы НА, распознают только пандемические вирусы НШ1 1918 и 2009 годов, эпитопы которых являются антигенно подобными, хотя их разделяет почти столетие [19]. Другие штаммы подтипа Н1, например PR8, такие антитела не способны распознавать (табл. 1, рисунок).

Однако за последнее время были описаны и охарактеризованы несколько антител, специфичных к глобулярной части НА и обладающих при этом вируснейтрализующей активностью против нескольких штаммов вируса гриппа в пределах одного подтипа. Эти эпитопы консервативны у различных штаммов вирусов и, следовательно, распознаются одним и тем же антителом. Примечательно, что эпи-топы таких антител могут располагаться в различных антигенных сайтах. Например, антитела Н5М9 взаимодействуют с консервативным эпитопом НА подтипа Н5, который локализуется в рудиментарном эстеразном субдомене поблизости от рецепторсвязы-вающего сайта и частично перекрывает антигенный сайт СЬ [20]. Антитела Н5М9 эффективно защищают мышей от летальных доз различных штаммов подтипа Н5. Антитела НС45 и ВН151 также взаимодействуют с подобным антигенным сайтом (рисунок), однако их способность взаимодействовать с раз-

Таблица 1. Известные антитела к В-клеточным эпитопам НА вирусов гриппа А и В

Антигенный сайт Антитело PDB ID Источник антител Подтип антител Источник антигена Ссылка

Р.с.к. CH65, CH67 3SM5 H. s. IgG1 A/Solomon Islands/3/2006(H1N1) [27, 33]

Р.с.к. CH65 3SM5 H. s. IgG1 A/Solomon Islands/3/2006(H1N1) [27]

Р.с.к. CH67 4HKX H. s. IgG1 A/Solomon Islands/3/2006(H1N1) [33]

Sa-сайт 2D1 3LZF H. s. ? A/South Carolina/1/1918(H1N1) [19]

Р.с.к. 1F1 4GXU H. s. ? A/South Carolina/1/1918(H1N1) [28]

GC0757 4F15 M. m. ? A/California/04/2009(H1N1) [45]

GC0587 4LVH M. m. ? A/California/04/2009(H1N1) [23]

Р.с.к. 5J8 4M5Z H. s. ? A/California/07/2009(H1N1) [26]

Р.э.с. H5M9 4MHH M. m. IgG1 A/Viet Nam/1203/2004 (H5N1) [20]

H5M9 4MHJ A/goose/Guangdong/1/1996(H5N1) [20]

Р.с.к. 8F8 4HF5 H. s. ? A/Japan/305+/1957(H2N2) [29]

Р.с.к. 8M2 4HFU H. s. ? A/Japan/305+/1957(H2N2) [29]

Р.с.к. 2G1 4HG4 H. s. ? A/Japan/305+/1957(H2N2) [29]

Р.э.с. BH151 1EO8 M. m. IgG1 A/X-31(H3N2) [22]

Р.э.с. HC45 1QFU M. m. IgG1 A/X-31(H3N2) [21]

Р.с.к. C05 4FP8 4FQR H. s. ? A/Hong Kong/1/1968(H3N2) [30]

Р.с.к. S139/1 4GMS M. m. IgG2a A/Victoria/3/1975(H3N2) [31]

Р.с.к. F045-092 4O58 H. s. ? A/Victoria/3/1975(H3N2) [32]

Р.с.к. F045-092 4O5I H. s. ? A/Singapore/H2011.447/2011(H3N2) [32]

Р.с.к. HC63 1KEN M. m. ? A/X-31(H3N2) [46]

Р.с.к. HC19 2VIR 2VIS 2VIT M. m. IgG1 A/X-31(H3N2) [47]

IIB4 M. m. ? A/Philippines/2/1982(H3N2) [48]

Fab 26/9 1FRG M. m. IgG2a A/Victoria/3/1975(H3N2) [49]

CR8071 4FQJ H. s. IgG1 B/Florida/4/2006 [44]

CR8059 4FQK H. s. IgG1 B/Brisbane/60/2008 [44]

С.т. FI6v3 3ZTJ H. s. ? A/Aichi/2/1968(H3N2) [42]

FI6v3 3ZTN H. s. ? A/California/04/2009(H1N1) [42]

MAb 3.1 4PY8 H. s. IgG1 A/South Carolina/1/1918(H1N1) [39]

CR6261 3GBN M. m. IgG1 A/Brevig Mission/1/1918(H1N1) [37, 50]

CR6261 3GBM M. m. IgG1 A/Viet Nam/1203/2004(H5N1) [37]

CR8020 3SDY H. s. ? A/Hong Kong/1/1968(H3N2) [40]

F10 3FKU H. s. IgG1 A/Viet Nam/1203/2004(H5N1) [38]

C179 4HLZ M. m. IgG2a A/Japan/305/1957(H2N2) [11, 15, 36]

CR8043 4NM8 H. s. IgG1 A/Hong Kong/1/1968(H3N2) [41]

CR9114 4FQI H. s. IgG1 A/Viet Nam/1203/2004(H5N1) [44]

CR9114 4FQV -//-//- -//-//- A/Netherlands/219/2003(H7N7) [44]

CR9114 4FQY -//-//- A/Hong Kong/1/1968(H3N2) [44]

Fab 39.29 4KVN H. s. ? A/Perth/16/2009(H3N2) [43]

Примечания. Информация о наиболее известных конформационных В-клеточных эпитопах НА вирусов гриппа получена из базы данных иммунологических эпитопов (IEDB - Immune Epitope DataBase and analysis resource; www.iedb.org), а также из базы данных белков (PDB - Protein Data Bank; www.rcsb.org). Синим выделена Hi-подгруппа вирусов гриппа (Hi, H5 и H2), зеленым - Н3-подгруппа, красным - антитела к стержневой части HA различных вирусов гриппа. С.т. - стержневая часть, Р.с.к. - рецепторсвязывающий карман, Р.э.с. - сайт, локализованный в рудиментарном эстеразном субдомене, H. s. - Homo sapiens, M. m. - Mus musculus.

2G1-4HG4

1F1-4GXU

2D1-3LZF

5J8-4M5Z

8F8-4HF5

8M2-4HFU

CH65-3SM5

CH67-4HKX

GC0587-4LVH

GC0757-4F15

H5M9-4MHH

H5M9-4MHJ

C05-4FP8

F045-092-4058

S139/1-4GMS

F045-092-4051

HC19-2VIR

HC63-1KEN

BH151-1EO8 HC45-1QFU

Ml I ■

I I К

И I I

I II I Ml I N1

I «I

•I—p-•I Ml

I— ««■— N —t

1— -и m- W —1

II III

I 11

M

HA

37

87

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

137

184

234

284

333

IHM I-1

»M

379

429

479 ■ ' ■

565

Ш

CR9114-4FQI

CR9114-4FQV

CR9114-4FQY

F10-3FKU

C179-4HLZ

MAb 3.1-4PY8

FI6v3-3ZTN

CR6261-3GBM

Fab 39.29-4KVN

FI6v3-3ZTJ

CR6261-3GBN

CR8043-4NM8

CR8020-3SDY

» I I

I-

I-1-

I-1

• •

I «MM -•—МММ i—HIM

I—HIM

• mm

I mm

-I—mm

•—mm*

I—IWH

I mm

NIM

HI

Схематичное расположение В-клеточных эпитопов на аминокислотной последовательности гемагглютинина НА. Рисунок получен с использованием программного обеспечения Geneious 9.0.2 следующим образом: аминокислотные последовательности гемагглютининов вирусов гриппа, распознающиеся соответствующими антителами (табл. 1), выровнены друг относительно друга, на каждой последовательности картирован эпитоп, распознающийся соответствующим антителом. Информация о В-клеточных эпитопах НА получена из базы данных иммунологических эпитопов. В центре представлен НА с расположенными на нем элементами. Снизу вверх представлены цепи HA1 и HA2 (зеленые), а-спирали (розовые), антигенные сайты - Cb (желтые), Ca1 (фиолетовые), Ca2 (голубые), Sa (серые), Sb (зеленые). Над и под HA показана локализация В-клеточных эпитопов НА вирусов гриппа А (см. табл. 1): сверху эпитопы к глобулярной части HA, подгруппы H1 (темно-синие), подгруппы H3 (темно-зеленые); снизу эпитопы к стержневой части HA (темно-красные). Антигенные сайты картированы согласно A.J. Caton [51]

личными штаммами не определена [21, 22]. Такие антитела, как GC0757 и GC0587, взаимодействуют с одним и тем же эпитопом, расположенным в глобулярной части НА, и распознают различные штаммы подтипа Н1 [23]. Эти антитела взаимодействуют с неизвестным ранее эпитопом, который не располагается в известных антигенных сайтах [23].

Группа других антител, взаимодействующих с несколькими штаммами вируса гриппа, распознает ре-

цепторсвязывающий сайт в глобулярной части НА. Поскольку рецепторсвязывающийся сайт функционально консервативен, его аминокислотное разнообразие ограничено, и он рассматривается в качестве привлекательной мишени для антител широкого спектра действия [24].

Рецепторсвязывающий сайт представляет собой широкий, неглубокий карман, локализованный в верхней части глобулярного домена. Границы ре-

цепторсвязывающего сайта формируют петли 130, 150, 220 и а-спираль 190, которые обозначают позиции в аминокислотной последовательности НА [25]. Структурная характеристика нескольких антител, связанных с рецепторсвязывающим сайтом, показала, что все антитела встраивают вариабельную петлю в рецепторсвязывающий сайт и таким образом прямо блокируют взаимодействие НА с клеточными сиаловыми кислотами [26-32]. Однако из-за компактности этого сайта большинство антител встраиваются только с помощью одной петли, и лишь некоторые антитела взаимодействуют двумя петлями. Поскольку сайт связывания с рецептором находится в глобулярной части НА, это не создает стерических преград для формирования антител к этому антигенному сайту.

Антитела получены от людей, перенесших пандемию гриппа 1918 года. Эти антитела способны ингибировать некоторые штаммы вируса гриппа А подтипа Н1: изоляты 1918, 1943, 1947 и 1977 годов [28]. Изучение кристаллической структуры этих антител в комплексе с НА вируса гриппа 1918 года показало, что они взаимодействуют с аминокислотными остатками, принадлежащими к антигенным сайтам Sa, Sb и Са2. Тяжелая цепь антитела №1 также контактирует с рецепторсвязывающим сайтом, взаимодействуя с аминокислотными остатками, принимающими участие в связывании сиаловых кислот.

Антитела СН65 и СН67 связывают и нейтрализуют вирусы гриппа подтипа Н1, которые циркулируют в человеческой популяции начиная с 1986 года [27, 33]. Однако эти антитела не обладают активностью против пандемического вируса гриппа Н1 2009 года. Антитела 5J8 активны против НА подтипов Н1 как пандемических вирусов гриппа 1918 и 2009 годов, так и против сезонных вирусов гриппа А. Исследование кристаллической структуры антител СН65, СН67 и 5J8 в комплексе с НА обнаружило, что все они распознают эпитопы возле рецептор-связывающего сайта и встраивают их HCDR3-петлю в рецепторсвязывающий карман.

Вирусы подтипа ^N2 циркулировали в человеческой популяции в течение 11 лет, с 1957 по 1968 год. Вследствие длительного отсутствия этих вирусов иммунитет у населения значительно снизился, а у лиц, родившихся после 1968 года, полностью отсутствует, поэтому вероятность возвращения вирусов этого подтипа очень высока, что, несомненно, вызывает беспокойство. С помощью гибридомной технологии от доноров были получены антитела к подтипу ^N2 - 8F8, 8М2 и 2G1, которые распознают и нейтрализуют все подтипы НА Н2, начиная с 1957 до 1968 года [29]. Анализ кристаллической структуры этих антител в комплексе с НА показал,

что они распознают рецепторсвязывающий карман. Антитела 8F8 встраивают их HCDR3-петлю в рецеп-торсвязывающий карман, тогда как антитела 8М2 и 2G1 - в HCDR2-петлю [29].

Описанные антитела к рецепторсвязывающему карману НА свидетельствуют о том, что этот участок глобулярной части НА более консервативен, чем такие антигенные сайты, как Sa или Sb, однако антитела к этому участку не способны распознавать НА различных подтипов. Тем не менее найдены антитела, распознающие рецепторсвязывающий карман и способные к гетеросубтипическому распознаванию НА.

Антитела С05 и S139/1 обладают гетеросубти-пической активностью и могут связываться со множеством подтипов вируса гриппа, включая Н1, Н2 и Н3 [30, 31]. Антитела S139/1 получены от мышей, иммунизированных вирусом ^N2. Это первые ге-теросубтипические антитела, которые распознают рецепторсвязывающий карман, взаимодействуя с НА подтипов Н1, Н2, Н3, Н5, Н9 и Н13 [34]. В результате анализа кристаллической структуры этих антител в комплексе с НА установлено, что они взаимодействуют с рецепторсвязывающим пакетом при помощи петли HCDR2 [31]. Изучение связывания и нейтрализации вируса подтвердило, что антитела S139/1 действительно имеют гетеросубтипическую активность, хотя и с узкой специфичностью в пределах одного подтипа. Тем не менее эти результаты позволяют предположить, что разные штаммы разных подтипов вируса гриппа А могут содержать похожий эпитоп в рецепторсвязывающем сайте.

Другие антитела - С05 - найдены при помощи фаговой библиотеки, полученной на основе клеток, выделенных от лиц, зараженных сезонным вирусом гриппа [30]. С05 оказывают нейтрализующее действие в отношении вирусов Н1, Н2, Н3 и Н9 и имеют большую широту распознавания внутри этих подтипов по сравнению с S139/1-антителами. В отличие от других описанных ранее антител, распознающих рецепторсвязывающий карман, С05 связывают НА исключительно при помощи тяжелой цепи. Основное взаимодействие опосредуется только длинной HCDR3-петлей, которая проникает в рецепторсвя-зывающий карман. Эпитоп к этим антителам на поверхности НА является очень компактным.

Еще одни антитела с широким гетеросубтипиче-ским распознаванием - F045-092, также получены с помощью фаговой библиотеки на основе клеток, выделенных от доноров. Они способны распознавать и нейтрализовать различные штаммы вируса гриппа подтипов Н1, Н2, Н3 и Н5 [35]. Анализ кристаллической структуры антител F045-092 в комплексе с НА показал, что они встраивают HCDR3-петлю в рецеп-

Таблица 2. Взаимодействие моноклональных антител, специфичных к стержневой части НА, с различными подтипами вирусов гриппа А

Групповая классификация вирусов гриппа

Моноклональное антитело

С179

Е10

CR6261

МАЬ 3.1 CR8020 CR8043

ЕаЬ 39.29

FI6v3*

CR9114**

Н9

Н8

Н12

Н6

Н1

Н2

Н5

Н11

Н13

Н16

Н3

Н4

Н14

Н10

Н7

Н15

Примечания. «+» - нейтрализация вируса гриппа, «-» - не выявлено взаимодействие с НА, «н.т.» - не тестировали. Красным показана группа Н1 вирусов гриппа, зеленым - группа Н3.

*Антитела FI6v3 взаимодействуют с другими подтипами НА, но нейтрализация вируса не исследована. **CR9114 взаимодействуют с вирусом гриппа В, но не нейтрализуют его.

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

торсвязывающий карман, причем карбоксильная группа аспартата на верхушке распознающей петли мимикрирует карбоксильную группу сиаловых кислот [32]. Вероятно, благодаря рецепторной мимикрии достигается большая широта распознавания различных подтипов вируса гриппа А.

АНТИТЕЛА К СТЕРЖНЕВОЙ ЧАСТИ МОЛЕКУЛЫ HA

Первоначально описанные антигенные сайты располагались только на глобулярном домене НА, и какое-то время была распространена точка зрения, согласно которой стержневой регион считался недоступным для гуморального иммунного ответа. Однако уже в 1993 году были описаны антитела С179, полученные в мышах, иммунизированных вирусом гриппа Н2^, и способные нейтрализовать НА подтипов Н1, Н2 и Н5 [11, 14]. В отличие от антител к глобулярной части, эти антитела блокировали конформа-ционные перестройки НА при низком значении рН, подавляя таким образом его функции. Спустя 20 лет после открытия антител С179 установили их кристаллическую структуру в комплексе с НА подтипа Н5. Анализ этого комплекса показал, что антитела взаимодействуют с НА при помощи как тяжелых, так и легких цепей [36].

Спустя 15 лет после открытия антител С179 были описаны еще несколько антител к стержневой части НА. Изучение структуры двух таких антител человека - СИ6261 [37] и П0 [38] - в комплексе с НА показало, что они взаимодействуют с высококонсервативным эпитопом в стержневой части, общим среди НА первой группы (табл. 2). Оба антитела взаимодействуют с НА только с помощью тяжелых цепей, вставляя петлю HCDR2 в гидрофобный карман.

Другие моноклональные гетеросубтипические антитела (МАЬ 3.1) были получены от доноров с использованием фаговой библиотеки. Антитела МАЬ 3.1 способны нейтрализовать вирусы гриппа подгруппы Н1а (Н1, Н2, Н5 и Н6), но имеют слабую нейтрализующую активность против подгруппы Н1Ь (Н13, Н16 и Н11) [39]. Подобно другим гетеросубтипическим антигриппозным антителам CR6261 и П0, МАЬ 3.1 контактируют со стержневой частью НА, используя только тяжелую цепь, однако у МАЬ 3.1 в отличие от них во взаимодействии участвуют петли HCDR1 и HCDR3.

Найдены также антитела, которые взаимодействуют исключительно со второй группой НА. Так, например, антитела CR8020, выделенные от здорового донора, связывают высококонсервативный эпи-топ стержневой части НА и проявляют нейтрализу-

ющую активность против вирусов H3, H7 и H10 [39]. Позднее были получены другие антитела, CR8043, которые, в отличие от CR8020, кодируются другими генными сегментами [40]. В опытах in vitro CR8043 проявляли нейтрализующую активность против подтипов H3 и H10 вируса гриппа и защищали мышей от летальной дозы вирусов H3N2 и H7N7 [41]. Антитела CR8020 и CR8043 связывают схожие эпи-топы, но с HA взаимодействуют по-разному. Оба антитела взаимодействуют как с легкими, так и с тяжелыми цепями HA. Подобно антителам, связывающим первую группу HA, антитела CR8020 и CR8043 также взаимодействуют со стержневой частью молекулы HA и предотвращают его конформационные изменения при низких значениях pH. Эти антитела также ингибируют процесс созревания HA, блокируя протеолитическое расщепление незрелого предшественника HA0 на субъединицы HA1 и HA2. Таким образом, обнаруженные и структурно охарактеризованные эпитопы к этим антителам представляют собой второе уязвимое место на стержневой части молекулы HA.

Описаны моноклональные антитела, обладающие гетеросубтипической активностью как против первой (H1), так и против второй (H3) группы вирусов гриппа А. В 2011 году впервые охарактеризовали подобные пангетеросубтипические антитела FI6v3, выделенные из библиотеки, состоящей из 104 000 плазматических клеток, полученных от восьми доноров, при помощи метода культивирования единичных клеток [42]. Антитела FI6v3 обладали вируснейтра-лизующей активностью против вирусов обеих групп и ингибировали формирование синцития в культуре клеток. Подобные им Fab-фрагменты моноклональ-ных антител Fab 39.29 получены с помощью метода «in vitro активирования и обогащения антигенспеци-фическим способом» 840 плазмобластов вакцинированных индивидов [43].

Еще одни пангетеросубтипические антитела CR9114 связывают консервативный эпитоп на стержневой части HA и в тестах нейтрализации проявляют активность против всех проверяемых штаммов вируса гриппа А [44]. Более того, эти антитела способны взаимодействовать с вирусом гриппа В, однако в опытах in vitro нейтрализация вируса гриппа В не была выявлена, по крайней мере в тестируемых концентрациях. Таким образом, в настоящее время антитела CR9114 являются антителами с самой широкой специфичностью из всех изученных монокло-нальных антител к HA вирусов гриппа А.

Найдены также гетеросубтипические антитела к вирусам гриппа В. В частности, антитела CR8059 и CR8071 способны нейтрализовать вирусы гриппа В обеих линий [44].

Возможность получения однодоменных антител с перекрестной нейтрализующей активностью впервые показана в отношении подтипов H1, H2, H5, H9 вируса гриппа. Четыре перекрестно нейтрализующих антитела (R2b-E8, R2b-D9, R1a-A5 и R1a-B6) связывались с HA полной длины, но не с доменом НА1, а также утрачивали связь с НА при низком рН. Эти антитела связываются с эпитопами в мембранной проксимальной области стержня НА вдали от сайта связывания рецептора. Подобный механизм перекрестной нейтрализации описан для моноклональных антител F10 человека и CR6261. Одно из антител (R2a-G8) связывается с частью домена НА1, который находится в области стержня НА [18].

На основании сказанного по широте распознавания все антитела можно классифицировать на четыре группы.

1) Антитела к глобулярной части, распознающие один или небольшое количество штаммов в пределах одного подтипа HA (2D1).

2) Антитела к глобулярной части, распознающие большое количество штаммов или все штаммы в пределах одного подтипа HA (H5M9, HC45, BH151, 8F8, 8M2, 2G1 и др.).

3) Антитела к глобулярной части, способные распознавать несколько штаммов различных подтипов HA (C05 и S139/1).

4) Антитела к стержневой части, достигающие выраженной гетеросубтипической активности (C179, F10, CR6261, CR8020, FI6v3, MAb 3.1, CR8043, Fab 39.29, CR9114).

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Возникающие время от времени эпидемические вспышки гриппа в вакцинированных популяциях безусловно свидетельствуют о необходимости продолжения поиска средств экстренной профилактики, а также лечения этого заболевания. Особую важность при этом приобретают средства защиты от пандемических штаммов вируса гриппа.

Для экстренной профилактики гриппа, вызываемого вирусом, изменчивым в отношении главного антигена - гемагглютинина, наиболее интересной представляется идея разработки препаратов широкого спектра действия, способных нейтрализовать вирусы гриппа разных подтипов.

В данной работе рассмотрена возможность распознавания различных В-клеточных эпитопов НА нейтрализующими антителами широкого спектра действия, что весьма актуально в связи с эволюцией вирусов гриппа.

В результате компьютерного анализа известных конформационных В-клеточных эпитопов НА виру-

сов гриппа показано, что мишенью при поиске и создании антител широкого спектра действия к вирусу гриппа является стержневая часть молекулы НА, антитела к которой обладают выраженной гетеро-субтипической активностью. Из всех полученных и исследованных к настоящему времени монокло-нальных антител к НА вирусов гриппа А самую широкую перекрестную нейтрализующую активность проявляют антитела CR9114. Найдены также гетеро-

субтипические антитела CR8059 и CR8071 к вирусам гриппа типа В.

Полученные данные свидетельствуют о возможности получения препаратов широкого спектра действия для экстренной профилактики и лечения гриппа с применением моноклональных или одно-доменных антител, нейтрализующих определенные В-клеточные эпитопы в стержневой части НА вируса гриппа.»

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Webster R.G., Govorkova E.A. // Ann. N. Y. Acad. Sci. 2014. V. 1323. P. 115-139.

2. Murphy B.R., Webster R.G. Orthomyxoviruses. Virology. 2nd ed. / Eds Fields B.N., Knipe D.M.. N.Y.: Raven Press, 1990. P. 1091-1152.

3. Kilbourne E.D. Influenza. N.Y.: Plenum Publ. Co., 1987.

4. Webster R.G., Bean W.G., Gorman O.T., Chambers T.M., Kawaoka Y. // Microbiol. Rev. 1992. V. 56. P. 152-179.

5. Kilbourne E.D. // Nat. Medicine. 1999. V. 5. P. 1119-1120.

6. Wiley D.C., Skehel J.J. // Ann. Rev. Biochem. 1987. V. 56. P. 365-394.

7. Graves P.N., Schulman J.L., Yong J.F., Palese P. // Virology. 1983. V. 126. P. 106-116.

8. Laver W.G., Air G.M., Dopheide T. A., Ward C.W. // Nature. 1980. V. 283. P. 454-457.

9. Raymond E.L., Caton A.J., Cox N.J., Kendal A.P., Brownlee G.G. // Virology. 1986. V. 148. P. 275-287.

10. Verhoeyen M., Fang R., Min Jou W., Devos R., Huylebroeek D., Saman E., Fiers W. // Nature. 1980. V. 286. P. 771-776.

11. Okuno Y., Isegawa Y., Sasao F., Ueda S. // J. Virol. 1993. V. 67. № 5. P. 2552-2558.

12. Air G.M. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1981. V. 78. P. 76397643.

13. Nobusawa E., Aoyama T., Kato H., Suzuki Y., Tateno Y., Nakajima K. // Virology. 1991. V. 182. P. 475-485.

14. Смирнов Ю.А., Липатов А.С., Окуно И., Гительман А.К. // Вопросы вирусологии. 1999. Т. 44. С. 111-115.

15. Smirnov Y.A., Lipatov A.S., Gitelman A.K., Okuno Y., van Beek R., Osterhaus A.D., Claas E.C. // Acta Virologica. 1999. V. 43. P. 237-244.

16. Ibanez L.I., De Filette M., Hultberg A., Verrips T., Temperton N., Weiss R.A., Vandevelde W., Schepens B., Vanlandschoot P., Saelens X. // J. Infect. Dis. 2011. V. 203. № 8. P. 1063-1072.

17. Tutykhina I.L., Sedova E.S., Gribova I.Y., Ivanova T.I., Vasilev L.A., Rutovskaya M.V., Lysenko A.A., Shmarov M.M., Logunov D.Y., Naroditsky B.S., et al. // Antiviral Res. 2013. V. 97. № 3. P. 318-328.

18. Hufton S.E., Risley P., Ball C.R., Major D., Engelhardt O.G., Poole S. // PLoS One. 2014. V. 9. № 8. P. e103294.

19. Xu R., Ekiert D.C., Krause J.C., Hai R., Crowe J.E.Jr., Wilson I.A. // Science. 2010. V. 328. № 5976. P. 357-360.

20. Zhu X., Guo Y.H., Jiang T., Wang Y.D., Chan K.H., Li X.F., Yu W., McBride R., Paulson J.C., Yuen K.Y., et al. // J. Virol. 2013. V. 87. № 23. P. 12619-12635.

21. Fleury D., Barrere B., Bizebard T., Daniels R.S., Skehel J.J., Knossow M. // Nat. Struct. Biol. 1999. V. 6. № 6. P. 530-534.

22. Fleury D., Daniels R.S., Skehel J.J., Knossow M., Bizebard T. // Proteins. 2000. V. 40. № 4. P. 572-578.

23. Cho K.J., Hong K.W., Kim S.H., Seok J.H., Kim S., Lee J.H., Saelens X., Kim K.H. // PLoS One. 2014. V. 9. № 2. P. e89803.

24. Martin J., Wharton S.A., Lin Y.P., Takemoto D.K., Skehel J.J., Wiley D.C., Steinhauer D.A. // Virology. 1998. V. 241. № 1. P. 101-111.

25. Skehel J. J., Wiley D.C. // Annu. Rev. Biochem. 2000. V. 69. P. 531-569.

26. Hong M., Lee P.S., Hoffman R.M., Zhu X., Krause J.C., Laursen N.S., Yoon S.I., Song L., Tussey L., Crowe J.E., et al. // J. Virol. 2013. V. 87. № 22. P. 12471-12480.

27. Whittle J.R., Zhang R., Khurana S., King L.R., Manischewitz J., Golding H., Dormitzer P.R., Haynes B.F., Walter E.B., Moody M.A., et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2011. V. 108. № 34.

P. 14216-14221.

28. Tsibane T., Ekiert D.C., Krause J.C., Martinez O., Crowe J.E., Wilson I.A., Basler C.F. // PLoS Pathog. 2012. V. 8. № 12. P. e1003067.

29. Xu R., Krause J.C., McBride R., Paulson J.C., Crowe J.E. Jr., Wilson I.A. // Nat. Struct. Mol. Biol. 2013. V. 20. № 3. P. 363-370.

30. Ekiert D.C., Kashyap A.K., Steel J., Rubrum A., Bhabha G., Khayat R., Lee J.H., Dillon M.A., O'Neil R.E., Faynboym A.M., et al. // Nature. 2012. V. 489. № 7417. P. 526-532.

31. Lee P.S., Yoshida R., Ekiert D.C., Sakai N., Suzuki Y., Takada A., Wilson I.A. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2012. V. 109. № 42. P. 17040-17045.

32. Lee P.S., Ohshima N., Stanfield R.L., Yu W., Iba Y., Okuno Y., Kurosawa Y., Wilson I.A. // Nat. Commun. 2014. V. 5. P. 3614.

33. Schmidt A.G., Xu H., Khan A.R., O'Donnell T., Khurana S., King L.R., Manischewitz J., Golding H., Suphaphiphat P., Carfi A., et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2013. V. 110. № 1. P. 264-269.

34. Yoshida R., Igarashi M., Ozaki H., Kishida N., Tomabechi D., Kida H., Ito K., Takada A. // PLoS Pathog. 2009. V. 5. № 3. P. e1000350.

35. Ohshima N., Iba Y., Kubota-Koketsu R., Asano Y., Okuno Y., Kurosawa Y. // J. Virol. 2011. V. 85. № 21. P. 11048-11057.

36. Dreyfus C., Ekiert D.C., Wilson I.A. // J. Virol. 2013. V. 87. № 12. P. 7149-7154.

37. Ekiert D.C., Bhabha G., Elsliger M.A., Friesen R.H., Jongeneelen M., Throsby M., Goudsmit J., Wilson I.A. // Science. 2009. V. 324. № 5924. P. 246-251.

38. Sui J., Hwang W.C., Perez S., Wei G., Aird D., Chen L.M., Santelli E., Stec B., Cadwell G., Ali M., et al. // Nat. Struct. Mol. Biol. 2009. V. 16. № 3. P. 265-273.

39. Wyrzucki A., Dreyfus C., Kohler I., Steck M., Wilson I.A., Hangartner L. // J. Virol. 2014. V. 88. № 12. P. 7083-7092.

40. Ekiert D.C., Friesen R.H., Bhabha G., Kwaks T., Jongeneelen M., Yu W., Ophorst C., Cox F., Korse H.J., Brandenburg B., et al. // Science. 2011. V. 333. № 6044. P. 843-850.

41. Friesen R.H., Lee P.S., Stoop E.J., Hoffman R.M., Ekiert D.C., Bhabha G., Yu W., Juraszek J., Koudstaal W., Jongeneelen M., et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2014. V. 111. № 1. P. 445-450.

42. Corti D., Voss J., Gamblin S.J., Codoni G., Macagno A., Jar-rossay D., Vachieri S.G., Pinna D., Minola A., Vanzetta F., et al. // Science. 2011. V. 333. № 6044. P. 850-856.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

43. Nakamura G., Chai N., Park S., Chiang N., Lin Z., Chiu H., Fong R., Yan D., Kim J., Zhang J., et al. // Cell Host Microbe. 2013. V. 14. № 1. P. 93-103.

44. Dreyfus C., Laursen N.S., Kwaks T., Zuijdgeest D., Khayat R., Ekiert D.C., Lee J.H., Metlagel Z., Bujny M.V., Jongeneelen M., et al. // Science. 2012. V. 337. № 6100. P. 1343-1348.

45. Cho K.J., Lee J.H., Hong K.W., Kim S.H., Park Y., Lee J.Y., Kang S., Kim S., Yang J.H., Kim E.K., et al. // J. Gen. Virol. 2013. V. 94. P. 1712-1722.

46. Barbey-Martin C., Gigant B., Bizebard T., Calder L.J., Wharton S.A., Skehel J.J., Knossow M. // Virology. 2002. V. 294. № 1. P. 70-74.

47. Fleury D., Wharton S.A., Skehel J.J., Knossow M., Bizebard T. // Nat. Struct. Biol. 1998. V. 5. № 2. P. 119-123.

48. Kostolansky F., Vareckova E., Betakova T., Mucha V., Russ G., Wharton S.A. // J. Gen. Virol. 2000. V. 81. P. 1727-1735.

49. Churchill M.E., Stura E.A., Pinilla C., Appel J.R., Houghten R.A., Kono D.H., Balderas R.S., Fieser G.G., Schulze-Gahmen U., Wilson I.A. // J. Mol. Biol. 1994. V. 241. № 4. P. 534-556.

50. Throsby M., van den Brink E., Jongeneelen M., Poon L.L., Alard P., Cornelissen L., Bakker A., Cox F., van Deventer E., Guan Y., et al. // PLoS One. 2008. V. 3. № 12. P. e3942.

51. Caton A.J., Brownlee G.G., Yewdell J.W., Gerhard W. // Cell. 1982. V. 31. P. 417-427.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.