CC BY
88
ИССЛЕДОВАНИЯ ВОДНЫХ БИОЛОГИЧЕСКИХ РЕСУРСОВ КАМЧАТКИ И СЕВЕРО-ЗАПАДНОЙ ЧАСТИ ТИХОГО ОКЕАНА, 2015, вып. 36
УДК 576.312:597.587.9 DOI: 10.15853/2072-8212.2015.36.25-33
анализ изменчивости нуклЕотидной последовательности фрагмента гена цитохромоксидАзы 1 мтднк у тихоокеанского БЕЛокоРого палтуса (HIPPOGLOSSUS STENOLEPIS) охотского моРя
с.п. пустовойт, Р.Р. Юсупов*, А.и. каика*
Ст. н. с., Институт биологических проблем Севера Дальневосточного отделения Российской академии наук 685000 Магадан, Портовая, 18 Тел, факс: (4132) 64-31-21 E-mail: pustov@ibpn.ru
*Ст. н. с., ст. н. с., Магаданский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии 685000 Магадан, Портовая, 36/10 Тел., факс: (4132) 64-88-23 Е-mail: yusupov@magniro.ru
белокорый палтус, цитохромоксидаза 1 мтднк, охотское море
Рассматривается изменчивость нуклеотидной последовательности фрагмента гена цитохромоксидазы 1 мтДНК белокорого палтуса. Нуклеотидное разнообразие палтусов Охотского моря составило п=0,00495. Показано, что на величину изменчивости нуклеотидных сайтов у особей белокорого палтуса оказывают влияние неселективные факторы, такие как мутационный процесс или миграция.
analysis of variability of the nucleotide sequence of the gene
fragment cytochrome c oxidase i (coi) mtdna from the pacific halibut (HIPPOGLOSSUS STENOLEPIS) in the sea of okhotsk s.P. Pustovoit, R.R. Yusupov*, A.I. kaika*
Senior scientist, Institute of Biological Problems of the North Far East Division RAS 685000 Magadan, Portovaya, 18 Tel., fax: (4132) 64-31-21 E-mail: pustov@ibpn.ru
*Senior scientist, senior scientist, Magadan Research Institute of Fisheries and Oceanography 685000 Magadan, Portovaya, 36/10 Tel., fax: (4132) 64-88-23 E-mail: yusupov@magniro.ru
PACIFIC HALIBUT, CYTOCHROME C OXIDASE I (COI) MTDNA, THE SEA OF OKHOTSK
The nucleotide sequences mitochondrial cytochrome C oxidase I (COI) mtDNA of the Pacific halibut was founded. Nucleotide diversity of halibut of the Sea of Okhotsk was n=0.00495. It is shown that the amount of variability in nucleotide sites in individuals Pacific halibut influence nonselective factors such as mutation or migration process.
Тихоокеанский белокорый палтус Hippoglossus ставе донного ихтиоцена североохотоморского
stenolepis Schmidt, 1904 — широко распространен- шельфа, но и оценить его численность и биомассу.
ный, преимущественно бореальный, ценный про- Однако в целом информация по белокорому пал-
мысловый вид. Первые сведения о распростране- тусу северной части Охотского моря ограничива-
нии белокорого палтуса в Охотском море приводят лась лишь общими сведениями о его батиметри-
В.К. Солдатов и Г.У. Линдберг (1930) (цит. по Вер- ческом распределении. По всей видимости, отсут-
нидуб, 1936) для Западной Камчатки. В 60-80-х ствие в литературе 60-80-х гг. каких-либо сведений
годах прошлого века исследованиями Н.П. Нови- о биологии белокорого палтуса в этой части Охот-
кова (1964) и Н.С. Фадеева (1987) было установлено, ского моря связано с ограниченностью исследова-
что ареал белокорого палтуса охватывает также ний акваториями шельфа и материкового склона в
северную часть Охотского моря, где он изредка летне-осенний период, когда его численность в
отмечался авторами в уловах донного трала на этом батиметрическом диапазоне низкая.
материковом склоне. Материалы, полученные в Для Берингова моря давно известно, что летом
ходе проведения траловых съемок 1981-1982 и белокорый палтус часто присутствует в уловах
1988 гг., позволили Л.А. Борцу (1985, 1990) не толь- ярусов, а также ставных неводов при добыче ло-
ко установить наличие белокорого палтуса в со- сосей (Вернидуб, 1936). Такая особенность летне-
го распределения белокорого палтуса была подтверждена и более поздними исследованиями (Моисеев, 1953; Полутов, 1967; Новиков, 1964, 1974; Фадеев, 1987; Линдберг, Федоров, 1993; Новиков, 1997; Чикилев, Пальм, 1999).
В 1996 г. северо-восточная центральная ихтиологическая лаборатория Охотскрыбвода (СВЦИЛ) провела научно-поисковые работы в прибрежье Магаданской области, в ходе которых впервые были выявлены летние скопления белокорого палтуса у побережья п-ова Кони и прилегающих к нему с востока прибрежных участках Притауйского района и получены количественные данные плотности его поселения. В 1997 г. исследования продолжили специалисты МагаданНИРО; были уточнены участки основных концентраций палтуса и собран первый материал о его размерно-массовой структуре (Лачугин, 1998). С 2001 г. специалистами МагаданНИРО налажен ежегодный мониторинг за состоянием запаса этого ценного промыслового объекта (Юсупов и др., 2008).
Имеющиеся сведения о популяционной структуре белокорого палтуса базируются на анализе темпов роста и морфометрических исследованиях выборок из разных участков ареала, а также на анализе поимки особей после мечения (Фадеев, 2005; Юсупов, 2012; Юсупов и др., 2008). По-видимому, для данного вида характерно образование территориально разобщенных стад, окончательное количество таких стад и их локализация до конца не известны. В настоящее время предпринимаются попытки решить данную проблему генетическими методами (Коваль, Богданов, 1982; Потапова и др., 2014; Пустовойт, Юсупов, 2011, 2012; Mork, Haug, 1983; Ding et al., 2009). Несмотря на видимые успехи, авторы обзора генетических исследований донных видов рыб (Cerda et al., 2010) отмечают фрагментарность популяционно-гене-тических исследований палтусов.
Другим направлением генетических работ является определение нуклеотидных последовательностей ядерных и митохондриальных генов. Полная нуклеотидная последовательность митохон-дриальной ДНК как тихоокеанского, так и атлантического видов известна (Mjelle et al., 2008). Кроме того, имеются сведения о последовательностях отдельных генов, прежде всего цитохро-моксидазы субъединицы 1 (Espineira et al., 2008; Mecklenburg et al., 2011; Steinke et al., 2009). Стандартный участок данного гена является единствен-
ным для международной программы «Штрих-кодирование жизни» (International Barcode of Life, www.boldsystems.org), поскольку в подавляющем большинстве исследований животных нуклеотид-ные последовательности его являются видоспеци-фичными (Шнеер, 2009). Анализ изменчивости указанного участка гена полезен, прежде всего, для филогенетических исследований, а также для идентификации видов в смешанных выборках в случае затруднения определения вида по морфологическим признакам. Если сравнивать два вида палтусов, то атлантический вид исследован более подробно (Ding et al, 2009; Nielsen et al., 2009). Имеющиеся данные для белокорого палтуса касаются только популяций Берингова моря (Galindo et al., 2011; Nielsen et al., 2010).
Цель работы — исследовать нуклеотидные последовательности фрагмента гена цитохро-моксидазы субъединицы 1 мтДНК у белокорого палтуса.
МАТЕРИАЛ И МЕТОДИКА
Пробы мышц белокорого палтуса собраны во время промысла в ноябре 2006 г. на западнокамчат-ском шельфе (6 экз.), они обозначены 1-06, т. е. это 1-я проба за 2006 г. и до 6-й пробы — 6-06; 3 пробы получены от рыб, пойманных в июле 2011 г. на североохотоморском шельфе в районе п-ова Кони (обозначены 1-11, 2-11 и 3-11).
Выделение ДНК проведено солево-хлоро-формным методом (Пустовойт, Юсупов, 2012; Sambrook et al., 1989). Секвенирование нуклеотид-ной последовательности гена цитохромоксидазы 1 выполнено в ОАО «Синтол» (Москва). Для по-лимеразной цепной реакции использованы следующие праймеры (Шарина, Картавцев, 2010): FishF1 5' TCAACCAACCACAAAGACATTGGCAC3', FishR1 5'TAGACTTCTGGGTGGCCAAAGAATCA3'. Из двух антипараллельных последовательностей, определенных для каждой особи, получена одна консенсусная последовательность общей длиной 651 нуклеотид. Последовательности ДНК были выравнены при помощи программы Clustal W, входящей в пакет MEGA 6.0 (Tamura et al., 2013). Для анализа привлечены все имеющие в международных банках данных последовательности, пробы приведены с указанием номера (barcode ID, www.boldsystems.org) и места сбора (прибрежный участок моря): 1) MFC344-8 — залив Пьюджет Саунд, Вашингтон, США; 2) FMV126-08 — залив
Пьюджет Саунд, Вашингтон, США; 3) TZFP082-04; 4) TZFPB689-06; 6) TZFPB800-06; 7) TZFPB706-06 — все Британская Колумбия, Канада; 4) DSFAL039-07 — о. Семиди, Аляска, США; 8) DSFAL221-07 — юго-восточная часть Чукотского моря, США; 9) DSFAL456-08 — о. Булдур, западная часть Алеутских островов, США, пробы номеров GBGC7344-09, GBGC7345-09, GBGC7346-09 собраны из коммерческих уловов, места сбора в работе (Espineira et al, 2008) не указаны, пробы номеров GBGC7859-09, GBGC7860-09, GBGC3103-07, GBGC7858-09, GBGC3115-07 получены от рыб, пойманных около тихоокеанского побережья Канады (Mjelle et al., 2008).
Статистический анализ выполнен при помощи программы MEGA 6.0. (Tamura et al., 2013). Он включал определение нуклеотидного разнообразия (п), а также тестов на селективность замен нуклеотидов. Дендрограммы строили с использованием алгоритма UPGMA и p-дистанций для оценки величины генетических различий.
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
Проведенные в 1996-1997 гг. научно-поисковые исследования обширной прибрежной зоны от бух. Лужина на западе до м. Кекурный (п-ов Пья-гина) на востоке показали, что в летне-осенний период на основной площади исследованного прибрежья белокорый палтус встречается повсеместно, но в небольших количествах. Скопления промысловой значимости отмечены лишь на сравнительно небольшом участке от м. Скалистого (северное побережье п-ова Кони) до м. Кекурного (юго-восточная часть п-ова Пьягина). Но и в этом районе частота его встреч была неодинакова: мак-
симальные концентрации палтус образовывал, как правило, на участках, прилегающих к мысам с крутым уклоном дна.
Предпринятые РС «Бриакан» в 1998 г. поисковые работы с целью обнаружить новые промысловые скопления этого объекта к западу от Тауй-ской губы (вплоть до п-ова Лисянского) положительных результатов не дали: палтус часто присутствовал в улове, но в единичных экземплярах.
В 2000 г. МагаданНИРО на НИС «Зодиак» провел траловую съемку северной части Охотского моря с целью оценить современное состояние и структуру биоресурсов этого региона. В числе исследованных участков общей площадью 67 250 квадратных миль был и зал. Шелихова — к северу от 58°00' и к востоку от 155°00' (от м. Кекурного) (Вышегородцев, Панфилов, 2001). Анализ видового состава рыб на 21 станции, с глубинами 41219 м, наличие белокорого палтуса не выявил.
В целом, имеющиеся сведения позволяют сформировать достаточно четкую картину сезонного распределения белокорого палтуса на североохото-морском шельфе. К востоку от п-ова Лисянского, на обширном мелководье северной части Охотского моря, общей протяженностью береговой линии около 2 тыс. км, белокорый палтус образует плотные концентрации лишь на сравнительно небольшом, примерно 360-километровом, участке прибрежной зоны вдоль побережья п-овов Кони и, частично, Пьягина (рис. 1). Здесь узкая локализация основной массы белокорого палтуса в период летнего откорма, несомненно, связана с благоприятными условиями его обитания. Как известно (Чернявский, 1980а, б; Борец, 1990), этот район характеризуется высокой биологической продуктивно-
Рис. 1. Карта летнего (слева) и зимнего (справа) распределения белокорого палтуса на акватории североохото-морского шельфа
стью, обусловленной влиянием ямского апвеллин-га, где температура водной массы от придонного слоя до поверхности находится в пределах температурного оптимума обитания белокорого палтуса, составляющего 2-7 °С (Фадеев, 1987).
Объединенные за 2012-2014 гг. данные ССД (суточных судовых донесений) промысловых судов о прилове белокорого палтуса при добыче черного палтуса на североохотоморском шельфе показывают, что в зимний период скопления бело-корого палтуса (более разреженные, чем летние), смещаясь на юг, в целом сохраняют свою локальность. Основные концентрации его отмечены на траверзе летнего обитания на глубинах 200-300 м.
Наличие устойчивой географической локальности белокорого палтуса на североохотоморском шельфе подтверждается и историей промыслового освоения его запасов (рис. 2). В целом, динамика промыслового освоения североохотоморского белокорого палтуса обнаруживает значительное сходство с хорошо известными литературными данными (Милинский, 1944; Никольский, 1974), описывающими примеры подрыва запасов долго-живущих видов рыб интенсивным промыслом, их перехода в депрессивное состояние и длительного периода восстановления. В то же время по данным на западнокамчатском шельфе, вылов белокорого палтуса характеризуется стабильностью и составляет 500-600 т в год (Новиков, 2009).
Секвенирование участка гена цитохромокси-дазы субъединицы 1 мтДНК белокорых палтусов разных районов обитания показало, что для всех исследованных нами особей его стандартная длина составила 651 нуклеотид (табл. 1). Сопоставление определенной нами нуклеотидной последовательности и имеющейся в GenBank (www.ncbi.nlm. nih.gov) полной последовательности мтДНК бело-корого палтуса (М]е11е et а1., 2008) показывает, что исследованный нами участок гена цитохромокси-
1996 1998 2000 2002 2004 2006 2008 2010 2012 2014 Год
Рис. 2. Динамика вылова белокорого палтуса на североохотоморском шельфе
дазы 1 начинается с позиции № 5555 и заканчивается N° 6205. Обнаружено 11 полиморфных сайтов, ps = 0,0169, нуклеотидное разнообразие п=0,00495. Девять особей делятся на две неравные группировки в зависимости от комбинаций нуклеотидов. Две особи (1-06, 1-11) в положениях 25 и 100 имеют цитозин (С), в положении 333 гуанин (G), остальные семь: в положениях 25 и 100 — гуанин (G), и в положении 333 — аденин (A).
Гаплотипы нуклеотидных последовательно -стей гена цитохромоксидазы 1 у особей из Охотского, Берингова и Чукотского морей указаны в таблице 2. Для корректного сопоставления в данном случае и в последующих вычислениях длины всех секвенсов были ограничены 651 нуклеотида-ми, а проба № TZFP010-04 (14 мая 2004 г., Британская Колумбия, Канада, www. boldsystems. org) исключена из анализа по причине неполноты последовательности. По нуклеотидным последовательностям из 26 особей в наибольшей степени отличаются тауйская № 1-06 и западнокамчатская особи № 1-11, поскольку они имеют вышеупомянутые особенности наборов нуклеотидов в полиморфных сайтах. Третьей аномальной особью является таковая с номером TZFP082-04 (Берингово море, Британская Колумбия, Канада, 16 мая 2004) (рис. 3). Для выяснения причин наличия таких особей необходимы дополнительные исследования. В остальных случаях особи из Охотского моря включаются случайным образом в кластеры, состоящие из рыб, пойманных в северной части Тихого океана. Выявлено отсутствие географически обусловленной закономерности в составах кластеров. Изменчивость данного участка гена цитохромоксидаза невысока, что позволяет использовать его для идентификации видов, а не популяций (Картавцев, Ли, 2006; Шарина, Кар-тавцев, 2010; Шнеер, 2009).
Количественные меры генетического разнообразия следующие: в 26 секвенсах выявлено 18 вариабельных сайтов (ps=18/651=0,02765), нуклеотидное разнообразие п=0,004947. Для определения селективного или неселективного характера замен использован тест Таджимы (Tajima, 1989), он равен D = -1, 1289. Поскольку данная величина находится в 95%-м доверительном интервале, указанном в таблице 2 работы Таджимы (-1,807~2,013), то остается в силе нулевая гипотеза о нейтральном характере замен нуклеотидов. Как известно, этот тест сравнивает разницу в величинах нуклеотидного
£
..........I .......[оНооОЗн^О^ОоНтОюО.......
^ н ^Ч^НСЧСЧСЧСПСПСП
О...............
О........I .......
1111111
^ч^счсчсчсчспсп
00 00 00 00 . 00 , ч 00 _ 00 . 00 -н,
Н О о <С т <с чо О сл О <м <С «ч О 1111111
^ч I <М <М <М <М СП СП
о I I I I I I I I ¡¡^н 111111 | !^овоо<ссн<сюос?;<с^<с'о<с 1111111
ЧО ЧО^^О ЧО^Ю ЧО ЧО ЧО
чог | | | | | |
ГЧ ГЧ ГЧ ГЧ СП СП
О........I ооО^Н.......
ОООООО I ОО&О I ............-^<се:ОО<ССН
ГЧ ГЧ ГЧ ГЧ СП СП
хчн 1111111
........... I .......3<С£<СоО?пОчоОслнйо8<С.......
и I I I I I I | I I ооО^н 1 1 I I I I I 1111111
о........... I 5оО^<С........
о о О О О ООО
(оОтН^Н^ОмОпО 1111111 гч гч гч гч ел ел
О I I I I I I I I | ^ОоН 111111 I слО^З^^^ОГ^НУЧОООО^^^^^О 1111111
Н1111||||?°<С1 г?<СоН 1111111т
О I I I I I I I I I £<СоН 1111111
00 00 00 Ж 00 Ж ОС 90
<С 00 <С . .
<М <М <м СП СП
1111111
О I I I I I I I I !£о I ^Оо<С 111111 I т н ^ < < О "Я н оо н ^ О ^ О 1111111
Н I I I I I I I 2 0 I £Оо<С 111111 1111111
Н I I I I I I I ^о I ¡?Оо<С 1111111
<М <М <М СП СП
...............................
Т ^ ' —| — ^ —' ГЧ ГЧ ГЧ СП СП
Н I I I I I I 1^0 |Е^НО<С 111111 I СП <С чо Н СЛ о ^ <С О оо н £ О ^ О 1111111
О........2<С I ^ОоООООООООтО^слН^О^оооЗо^О.......
О...... I .......^О^ООО^О.......
ГЧ ГЧ ГЧ СП СП
................я о
00 00 г 00 . 00 г . 00 00г 00 00
СЧ СЧ СЧ СП СП
спО 1111111
О.......... I .......в0^0^^0^^0^0^0.......
ЧО ^О^^-О^ЧО^^ЧО ЧО ЧО.ЧО
.........¡5о I 1 101 I I ¡счо^^^^
^ ГЧ ГЧ СП СП
0<т0 I I I I | | |
..........180&0.......£ о «Я н & о £ о 3 <с £ н «3 <с £ .........
.........^ООю^^О..............
О........... I .............^^О^^Ьо^О^нО^^Нг^ОсЗн^пО^^^^^^^
ГЧ СЧ ГЧ г^ г^
.........I ....................
О I I I I I I I I ^З^Е^О 111111 I счО^^^^^^^^^^^О^О 1111111
< ГЧ СП ^ чо оо ^
< ГЧ СП ^ ЧО 00 оч
Окончание таблицы 1
№ | 1 1 2 1 3 1 4 5 1 6 7 1 8 1 9 1 10 и 1 12 1 13 1 14 1 15 116 1 17 1 18 1 19 1 20 21 1 22 23 | 24 1 25 | 26 | 27 1 28 29 | 30
1 1 361 С 391 т 362 А 392 Т 363 с 393 С 364 в 394 Т 365 С 395 С 366 с 396 А 367 в 397 С 368 в 398 Т 369 А 399 Т 370 в 400 С 371 С 401 А 372 А 402 С 373 Т 403 С 374 С 404 Т 375 С 405 Т 376 в 406 в 377 Т 407 С 378 А 408 А 379 в 409 в 380 А 410 в 381 С 411 А 382 С 412 А 383 Т 413 Т 384 в 414 Т 385 А 415 Т 386 С 416 С 387 А 417 А 388 А 418 Т 389 Т 419 С 390 С 420 А
/ 1 5 421 А 422 Т 423 Т 424 С 425 Т 426 в Т 427 в 428 в 429 в 430 в 431 С 432 А 433 А 434 Т 435 Т 436 А 437 А 438 С 439 Т 440 Т 441 Т 442 А 443 Т 444 Т 445 А 446 С 447 Т 448 А 449 С 450 Т
6 9 : : : : : I т : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : :
451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480
1 А Т С А Т Т А А С А Т в А А А С С С А С А А С А в Т С А С Т
481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510
1 А Т в Т А С С А А А Т С С С С Т Т А Т т Т в Т Т Т в А в С С
511 512 513 514 151 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540
1 в Т Т С Т Т А Т Т А С А в С С в Т А С Т Т С Т Т С Т Т С Т А
541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570
1 Т С С С Т в С С С в Т Т Т Т А в С С в С А в в А А Т Т А С А
571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600
1 о А Т А С Т А С Т А г А С А в А С С в С А А С С Т Т А А С А С в
о 601 602 603 604 605 606 607 608 и 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630
1 А С С Т Т С Т Т Т в А С С С Т в С С в в А в в А в в Т в А с
631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651
1 С С с А Т с С Т С Т А С С А в С А С С Т А
Примечание: в каждом разделе таблицы указаны только те последовательности, которые отличаются от таковой у первой особи.
Таблица 2. Гаплотипы исследованного участка гена цитохромоксидазы 1 мтДНКу 26 особей белокорого палтуса
9 21 24 25 34 66 96 100 246 333 362 412 426 453 573 579 594 645
1 вВСС7859-09 С С А в в А А в Т А А А в Т А А Т А 1
2 СВСС7858-09, СВСС7860-09, Т2РРВ800-06, 3-1ирр-06 в 4
3 СВСС7344-09, СВСС7345-09, вВСС7345-09 - - - - - - - - - - - - Т - - - А - 3
4 СВвСЗЮЗ-Ог СВСС3115-07 - - - - - - - - С - в - - - - в - в 2
5 В8РАЬ221-07, ВСРАЬ039-07, МРС344-08, РМУ126-08, 2-Ырр-11 - - - - - - - - с - - - - - - в - в 5
6 Б8РАЬ456-08 - т - - - - - - с - - - - - - в - в 1
7 Т2РРВ689-06 - - - - - - - - с - - - - - - в - 1
8 Т2РРВ706-06, 5-Ырр-06, 6-1ирр-06, 7-1ирр-11 - - - - - - - - - - - - т - - - - в
9 Т2РР082-04 - - - - - в - - - - - - - С в - - - 1
10 1-Ырр-06 - - - С - - - С - в - - - - - - - в 1
11 2-Ырр-06 - - С - С - - - - - - - - - - - - в 1
12 4-1ирр-06 - - - - - - в - - - - - - - - - - в 1
13 1-1ирр-11 т - - С - - - с - в - Т - - - - - в 1
разнообразия и частот вариабельных сайтов (Nei, Kumar, 2000). Другим способом оценить существенность селективных факторов является сравнение частот замен в синонимичных (не меняющих кодирование) или в несинонимичных сайтах. Реализованный в программе MEGA z-тест на селективность замен показал, что только в небольшом числе случаев попарного сравнения 26 последовательностей можно предполагать преобладание несинонимичных замен над синонимичными (матрица не приводится из-за недостатка места). Следовательно, наибольшая часть замен происходит под влиянием неселективных факторов.
Рис. 3. Дендрограмма генетических дистанций, определенная по нуклеотидным последовательностям СО1 для 26 особей белокорого палтуса
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Таким образом, на величину изменчивости нукле-отидных сайтов оказывают влияние неселективные факторы. Таковыми могут быть как мутационный процесс, так и миграции особей в северной части Тихоокеанского бассейна. Степень влияния каждого из факторов пока остается неясной. Полученные результаты базируются на небольшом числе сравниваемых особей и пока носят характер предварительных. Для окончательного ответа на поставленный вопрос необходимы дополнительные исследования.
TZFPB 300-06 > hipp 06 ~ G9GC7858-09 " GBGC 7860-09
-4- hipp- 06
TZFPB 706-06 5-КррОб
- 6 hipp 06
7-hipp-11
-GBGC7859-09
_ _ 2 hipp 06
GBGC 7346-09
- GBGC7345-09
--GBGC7344-09
_GBGC3103-07
I GBGC3115-07
- -DSFAL456-08
-TZFPB 689-06
DSFAL039-07 DSFAL221-07
- FMV126-08
MFC344-08 2-hipp 11
-TZFP082-04
- 1-hip-06
-i-hip-11
QOM (ЙШ шЗо2 ШЮ1 Ö000
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
Борец л.А. 1985. Состав и биомасса донных рыб на шельфе Охотского моря // Биол. моря. № 4. С.54-65.
борец л.А. 1990. Состав и обилие рыб в донных их-тиоценах шельфа северной части Охотского моря // Изв. Тихоокеан. НИИ рыб. хоз-ва и океанографии. Т. III. С. 162-171.
Вернидуб М.Ф. 1936. Материалы к познанию тихоокеанского белокорого палтуса // Тр. Ленинград. общества естествоиспыт. Т. 65. Вып. 2. С. 143-184. Вышегородцев В.А., Панфилов А.М. 2001. О результатах донной траловой съемки в северной части Охотского моря на НИС «Зодиак» в августе-сентябре 2000 г. // Сб. науч. тр. Магаданского НИИ рыб. хоз-ва и океанографии. Вып. 1. С. 7-36. картавцев Ю.Ф., ли Ж.С. 2006. Анализ нукле-отидного разнообразия по генам цитохрома b и цитохромоксидазы 1 на популяционном, видовом и родовом уровнях // Генетика. Т. 42. № 4. С. 437-461.
коваль Е.з., богданов л.В. 1982. Сравнение элек-трофоретических спектров белков у разных видов дальневосточных камбал (Pleuronectiformes, Pleuronectidae) // Вопр. ихтиологии. Т. 22. Вып. 4. С.679-685.
лачугин А.С. 1998. О возможностях промыслового освоения палтусов в северной части Охотского моря // Северо-восток России: проблемы экономики и народонаселения: Тез. докл. Магадан. С. 85-86.
линдбергГ.у., Федоров В.В. 1993. Рыбы Японского моря и сопредельных частей Охотского и Желтого морей. Ч. 6. Teleostomi. 31. Pleuronectiformes. СПб.: Наука. 272 с.
Милинский Г.И. 1944. Биология и промысел палтуса Hippoglossus vulgaris (L.) Норвежского и Баренцева морей // Промысловые донные рыбы Баренцева моря. Труды ВНИРО, ПИНРО. Вып. 8. М., Л.: Пи-щепромиздат. С. 331-374.
Моисеев П.А. 1953. Треска и камбала дальневосточных морей // Изв. Тихоокеан. НИИ рыб. хоз-ва и океанографии. Т. 40. 288 с.
Никольский Г.В. 1974. Теория динамики стада рыб. М.: Пищ. пром-сть. 448 с.
Новиков Н.П. 1964. Основные черты биологии тихоокеанского белокорого палтуса (Hippoglossus hippoglossus stenolepis Schmidt) в Беринговом море // Изв. Тихоокеан. НИИ рыб. хоз-ва и океанографии. Т. 51. Вып. 2. С. 167-207.
Новиков Н.П. 1974. Промысловые рыбы материкового склона северной части Тихого океана. М.: Пищ. пром-сть. 308 с.
Новиков Р.Н. 1997. Некоторые результаты исследований белокорого палтуса у восточного побережья Камчатки // Биомониторинг и рациональное использование гидробионтов: Тез. докл. молодых ученых 27-29 мая 1997 г. Владивосток: ТИНРО-Центр. С. 56-57.
Новиков Р.Н. 2009. Некоторые аспекты промысла белокорого палтуса (Hippoglossus stenolepis) восточной части Охотского моря // Исслед. водн. биол. ресурсов Камчатки и сев.-зап. части Тихого океана. Сб. науч. тр. КамчатНИИ рыб. хоз-ва и океанографии. Вып. 15. С. 44-49.
Полутов И.А. 1967. Запасы камбаловых и донных рыб в водах Камчатки и развитие активного рыболовства // Изв. Тихоокеан. НИИ рыб. хоз-ва и океанографии. Т. 57. С. 98-121. ПотаповаН.А., Пустовойт С.П., ЮсуповР.Р. 2014. Анализ нуклеотидных последовательностей гена цитохромоксидазы 1 (СО1) мтДНК полярной Li-opsetta glacialis и Liopsettapinnifasciata полосатой камбал (Pleuronectidae) Охотского моря // Цитология и генетика. Т. 48. № 6. С. 11-16. Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р. 2011. О генетической дифференциации желтоперой камбалы Limanda aspera, обитающей в Тауйской губе, Охотское море // Цитология и генетика. Т. 45. № 3. С. 57-62. Пустовойт С.П., Юсупов Р.Р. 2012. О нуклеотид-ной последовательности гена цитохромооксидаза СО-1 митохондриальной ДНК желтоперой камбалы (Limanda aspera) Тауйской губы // Вестник Северо-Восточного гос. ун-та. Вып. 17. С. 49-58. Фадеев Н.С. 1987. Северотихоокеанские камбалы: распространение и биология. М.: Агропромиздат. 175 с.
Фадеев Н.С. 2009. Справочник по биологии и промыслу рыб северной части Тихого океана. Владивосток: ТИНРО-Центр. 366 с. Чикилев В.Г., Пальм С.А. 1999. Распределение и биологическая характеристика белокорого палтуса Hippoglossus stenolepis на шельфе северо-западной части Берингова моря // Изв. Тихоокеан. НИИ рыб. хоз-ва и океанографии. 1999. Т. 126. С. 262-270. Шарина С.Н., картавцевЮ.Ф. 2010. Филогенетический анализ камбал (Teleostei, Pleuronectiformes), основанный на исследовании нуклеотидных последовательностей гена цитохромоксидазы 1 (Со-1) // Генетика. Т. 46. № 3. С. 401-407.
Шнеер В.С. 2009. ДНК-штрих-кодирование видов животных и растений — способ их молекулярной идентификации и изучения биоразнообразия // Журн. общ. биологии. Т. 70. № 4. С. 296-315. Чернявский В.И. 1980а. Гидрологический фронт северной части Охотского моря // Изв. Тихоокеан. НИИ рыб. хоз-ва и океанографии. Т. 86. С. 3-11. Чернявский В.И. 1980б. О причинах высокой биологической продуктивности северной части Охотского моря // Изв. Тихоокеан. НИИ рыб. хоз-ва и океанографии. Т. 86. С. 13-22. ЮсуповР.Р. 2012. О половом диморфизме в процессе роста белокорого палтуса Hippoglossus stenolepis (Pleuronectidae) северной части Охотского моря // Вестник Северо-Восточного научного центра ДВО РАН. № 1. С. 61-68.
Юсупов Р.Р., лачугин А.С., Михайлов А.Н., Ракити-на М.В. 2008. Морфо-биологические особенности, промысел и рыбохозяйственный статус белокорого палтуса Hippoglossus stenolepis (Pleuronectidae) северной части Охотского моря // Вестник Северо-Восточного научного центра ДВО РАН. № 1. С. 61-71. Cerda J., Douglas S., Reith M. 2010. Genomic resources for flatfish research and their applications // Journal of Fish Biology. V. 77.5. P. 1045-1070. Ding H., Shao C.W., Liao X.L., Xu G.B., Ji X.S., Chen S.L. 2009. Ten polymorphic microsatellite loci for the Atlantic halibut (Hippoglossus hippoglossus) and cross-species application in the related species // Conservation Genetics. V. 10. 3. P. 611-614. Espineira M., Gonzalez-Lavin N., Vieites J.M., Santaclara J. 2008. Development of a method for the genetic identification of flatfish species on the basis of mitochondrial DNA sequences // Journal of Agricultural and Food Chemistry. V. 56 (19). P. 8954-8961. Galindo H.M., Loher T., Hauser L. 2011. Genetic sex identification and the potential evolution of sex deter-
mination in Pacific halibut (Hippoglossus stenolepis) // Marine Biotechnology. V. 13. № 5. P. 1027-1037. Nei M., Kumar S. 2000. Molecular evolution and phy-logenetics. Oxford University Press. 333 p. Mecklenburg C.W., Moller P.R., Steinke D. 2011. Biodiversity of arctic marine fishes: taxonomy and zoogeography // Marine Biodiversity. V. 41. P. 109-140.
Mjelle K.A., Karlsen B.O., Jorgensen T.E., Moum T., Johansen D.J. 2008. Halibut mitochondrial genomes contain extensive heteroplasmic tandem repeat arrays involved in DNA recombination // BMC Genomics. V. 9. P. 1-11.
Mork J., Haug T. 1983. Genetic variation in halibut Hippoglossus hippoglossus from Norwegian waters // Hereditas. V. 98 (2). P. 167-174. Nielsen E.E., Hemmer-Hansen J., Larsen P.F., Bekken-vold D. 2009. Population genomics of marine fishes: identifying adaptive variation in space and time // Molecular ecology. V. 18. 15. P. 3128-3150. Nielsen J.L., GrazianoS.L., SeitzA.C. 2010. Fine-scale population genetic structure in Alaskan Pacific halibut (Hippoglossus stenolepis) // Conservation Genetics. V.11. 3. P. 999-1012.
Sambrook J.F., Fristch E.F., Maniatis T. 1989. Molecular cloning: a laboratory manual. N.Y.: Cold Spring Harbor Lab. Press. 2nd edn. 1626 p. Steinke D., Zemlak T.S., Boutillier J.A., Hebert P.D.N. 2009. DNA barcoding of Pacific Canada's fishes // Marine Biology. V. 156. № 12. P. 2641-2647. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. 2013. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetic Analysis version 6.0 // Molecular Biology and Evolution. V. 30. P. 2725-2729. Tajima F. 1989. Statistical method for testing the neutral mutation hypothesis dy DNA polymorphism // Genetics. 1989. V. 123. P. 585-595.
